生物学性状都是由基因决定的吗?
——正确看待中心法则
在水族中,有一种鱼人们称之为“清道夫”,它们专门清除其它鱼的皮肤上的外寄生虫,从而获得食物来源,而接受清除服务的鱼无论多么凶恶对它们会敬若上宾。清道夫鱼营小群体生活,头领是一条年长的雄鱼,另有三到六条雌鱼,其它的则是一些未成熟的小雌鱼,这就是说一群这类鱼中只有一条雄鱼。它们过着一种有严格等级的社会生活,所有雌性的鱼按从小到大地位越来越高,最高地位的那条雌鱼就是鱼群中的“后”。人们当然会担心那条鱼“王”死后这群鱼所面临的生存问题,其实当“王”死后,“后”便立即产生性转换,一跃变为雄鱼并成为了这群鱼中的“王”。研究表明,在这种性转换中,染色体没有变化。这一点是与中心法则完全相悖的,而事实上有更多的例子表明DNA通过RNA、蛋白质控制着物种的生物学性状,我们在后面的叙述中将会谈到。这个例子告诉我们,中心法则是科学的,但不是绝对没有问题的。
所谓中心法则就是:遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质的转录和翻译过程,以及遗传信息从DNA传递给DNA的复制过程。很多人认为如果进化论是生物中的牛顿定律,那么中心法则则是生物学中的相对论。这个类比是不准确的,但它却表示了中心法则在生物学中的重要地位。
, 百拇医药
1953年是个值得纪念的时期,Francis Crick和James D.Watsan提出了DNA双螺旋互补结构模型。在此基础上,五年后Crick便提出了中心法则。双螺旋结构模型中由于两条链碱基互补,模型本身就提示了自我复制的机理,进而表明了DNA作为遗传物质由亲代传给子代的原因。当然,遗传物质除亲子传递外还必需具备控制自身生物学性状的能力。Crick在当时许多研究尚未进行或非常不明朗的情况下从DNA复制时碱基配对原理出发,天才地预言模板RNA的存在,并由RNA碱基无法直接与多肽氨基酸配对的事实,提出了密码和应接器(即后来发现的转运RNA)的概念,这就是在DNA模板上合成RNA,再以RNA为模板在应接器参与下氨基酸按密码顺序合成肽链。这是一个革命性的、划时代的创举,从此在中心法则的影响下,生物学向新的层次大踏步地前进着,生物学理论出现了日新月异的发展,并助产了基因工程的诞生和发展。
和进化论所经历的情况一样,在以后的实践中人们也发现了许多与中心法则不相容的实验结果。
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首先是逆转录酶,它以RNA为模板、催化合成DNA的酶,说明细胞中遗传信息可以从RNA传递给DNA。这一结果促使Crick承认遗传信息可在DNA和RNA间逆转传递并重新修正了中心法则,这比19世纪前的科学家的作风有明显的进步,但他却依然坚持:核酸的碱基顺序和相应蛋白质的氨基酸序列是相对应的,而且遗传信息一旦传递到蛋白质就不可能再行输出。就是说只要我们知道了编码蛋白质的DNA片断的碱基顺序,就能推算出RNA的碱基序列,然后通过遗传密码表就能列出翻译产生蛋白质的氨基酸序列,反过来也一样。
事情真的都是这样的吗?一个著名的否定例证来自所谓分子重排现象。人们在实验中发现,丝状氰化细菌未分化之前不能固氮,当分化为异形细胞时就能获得固氮能力。固氮作用的核心固氮酶是固氮酶基因的表达产物,分化前固氮基因在DNA分子上被分隔为两个部分,异形细胞分化时这两个部分连在一起成为完整的基因,这表明基因中核苷酸序列在生物发育的不同时期会出现重排现象。从DNA的角度来看,中心法则无法解释这一现象。
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我们再来看看RNA的情况。中心法则表明RNA是以DNA为模板合成的,DNA、RNA碱基序列和蛋白质氨基酸排列顺序应严格对应,RNA合成后不容改变,否则DNA序列就不可能与蛋白质氨基酸序列相对应。1977年美国病毒学家Sharp发现病毒基因内部存在插入序列,这个序列在转录后RNA成熟时被切除,后来又发现真核生物信使RNA、转运RNA和核糖体RNA成熟过程中几乎都有此现象。这就是说DNA上的碱基序列也无法正确推出它的表达产物蛋白质的氨基酸序列。近年来又发现RNA成熟过程中还可能有碱基的的添加、删除和更换等状况,更让人吃惊的是这绝不是个别现象,它广泛地出现在病毒、细菌、植物、真菌和动物中。有时变更幅度竟然达一半以上。这些现象都无法用严格的“转录”和“翻译”过程来解释。
“翻译”上也存在着问题。按中心法则信使RNA的碱基序列决定了蛋白质的氨基酸序列,但是某些肽类抗生素(如短杆菌肽等)并非在信使RNA模板上合成的,而是由短杆菌肽合成酶按顺序吸附了相应的氨基酸排列在酶分子表面,然后使其聚合而成的,于是原有的蛋白质成了合成新蛋白质的模板。按中心法则蛋白质应当是遗传信息传递的终端,可一些朊病毒只有蛋白质没有核酸,进入宿主细胞后能靠自身的蛋白质将宿主正常蛋白质改变结构而繁殖自己,这也是遗传信息由蛋白质传给蛋白质的典型例子(疯牛病毒)。
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我们从分子水平上已经看到一些与中心法则相悖的事例,那么在更高层次上情况又如何呢?我们知道细胞膜是由脂类和蛋白质组成的,而蛋白质是由膜蛋白的有关基因表达而来,脂类则由合成脂类的酶催化而成,DNA还是主宰者,但如果仅有脂类和蛋白质却得不到膜,必需加上极少量的膜作为模板,亦即非DNA模板。这类现象还出现在叶绿体、线粒体、细菌细胞壁的生成过程中。显然这是与中心法则相悖的。
在中心法则下我们能够解释基因控制性状,有些直接参与了我们对一些基因疾病的研究并取得了可靠的依据。但本文开头所描述的清道夫们仍在水中游动着,它们的存在让我们不得不对中心法则进行更深入的思考。
这再次告诉我们,一个科学的理论系统不是一蹴而就的,和进化论一样,中心法则推动了生物学突飞猛进的发展,历史功绩不容抹杀,有悖现象的存在不是坏事,它必将促使我们的认识水平向纵深发展,相信中心法则作为一个重要的生物学理论基础一定会得到充实、发展和提高。
□九 歌, 百拇医药
在水族中,有一种鱼人们称之为“清道夫”,它们专门清除其它鱼的皮肤上的外寄生虫,从而获得食物来源,而接受清除服务的鱼无论多么凶恶对它们会敬若上宾。清道夫鱼营小群体生活,头领是一条年长的雄鱼,另有三到六条雌鱼,其它的则是一些未成熟的小雌鱼,这就是说一群这类鱼中只有一条雄鱼。它们过着一种有严格等级的社会生活,所有雌性的鱼按从小到大地位越来越高,最高地位的那条雌鱼就是鱼群中的“后”。人们当然会担心那条鱼“王”死后这群鱼所面临的生存问题,其实当“王”死后,“后”便立即产生性转换,一跃变为雄鱼并成为了这群鱼中的“王”。研究表明,在这种性转换中,染色体没有变化。这一点是与中心法则完全相悖的,而事实上有更多的例子表明DNA通过RNA、蛋白质控制着物种的生物学性状,我们在后面的叙述中将会谈到。这个例子告诉我们,中心法则是科学的,但不是绝对没有问题的。
所谓中心法则就是:遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质的转录和翻译过程,以及遗传信息从DNA传递给DNA的复制过程。很多人认为如果进化论是生物中的牛顿定律,那么中心法则则是生物学中的相对论。这个类比是不准确的,但它却表示了中心法则在生物学中的重要地位。
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1953年是个值得纪念的时期,Francis Crick和James D.Watsan提出了DNA双螺旋互补结构模型。在此基础上,五年后Crick便提出了中心法则。双螺旋结构模型中由于两条链碱基互补,模型本身就提示了自我复制的机理,进而表明了DNA作为遗传物质由亲代传给子代的原因。当然,遗传物质除亲子传递外还必需具备控制自身生物学性状的能力。Crick在当时许多研究尚未进行或非常不明朗的情况下从DNA复制时碱基配对原理出发,天才地预言模板RNA的存在,并由RNA碱基无法直接与多肽氨基酸配对的事实,提出了密码和应接器(即后来发现的转运RNA)的概念,这就是在DNA模板上合成RNA,再以RNA为模板在应接器参与下氨基酸按密码顺序合成肽链。这是一个革命性的、划时代的创举,从此在中心法则的影响下,生物学向新的层次大踏步地前进着,生物学理论出现了日新月异的发展,并助产了基因工程的诞生和发展。
和进化论所经历的情况一样,在以后的实践中人们也发现了许多与中心法则不相容的实验结果。
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首先是逆转录酶,它以RNA为模板、催化合成DNA的酶,说明细胞中遗传信息可以从RNA传递给DNA。这一结果促使Crick承认遗传信息可在DNA和RNA间逆转传递并重新修正了中心法则,这比19世纪前的科学家的作风有明显的进步,但他却依然坚持:核酸的碱基顺序和相应蛋白质的氨基酸序列是相对应的,而且遗传信息一旦传递到蛋白质就不可能再行输出。就是说只要我们知道了编码蛋白质的DNA片断的碱基顺序,就能推算出RNA的碱基序列,然后通过遗传密码表就能列出翻译产生蛋白质的氨基酸序列,反过来也一样。
事情真的都是这样的吗?一个著名的否定例证来自所谓分子重排现象。人们在实验中发现,丝状氰化细菌未分化之前不能固氮,当分化为异形细胞时就能获得固氮能力。固氮作用的核心固氮酶是固氮酶基因的表达产物,分化前固氮基因在DNA分子上被分隔为两个部分,异形细胞分化时这两个部分连在一起成为完整的基因,这表明基因中核苷酸序列在生物发育的不同时期会出现重排现象。从DNA的角度来看,中心法则无法解释这一现象。
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我们再来看看RNA的情况。中心法则表明RNA是以DNA为模板合成的,DNA、RNA碱基序列和蛋白质氨基酸排列顺序应严格对应,RNA合成后不容改变,否则DNA序列就不可能与蛋白质氨基酸序列相对应。1977年美国病毒学家Sharp发现病毒基因内部存在插入序列,这个序列在转录后RNA成熟时被切除,后来又发现真核生物信使RNA、转运RNA和核糖体RNA成熟过程中几乎都有此现象。这就是说DNA上的碱基序列也无法正确推出它的表达产物蛋白质的氨基酸序列。近年来又发现RNA成熟过程中还可能有碱基的的添加、删除和更换等状况,更让人吃惊的是这绝不是个别现象,它广泛地出现在病毒、细菌、植物、真菌和动物中。有时变更幅度竟然达一半以上。这些现象都无法用严格的“转录”和“翻译”过程来解释。
“翻译”上也存在着问题。按中心法则信使RNA的碱基序列决定了蛋白质的氨基酸序列,但是某些肽类抗生素(如短杆菌肽等)并非在信使RNA模板上合成的,而是由短杆菌肽合成酶按顺序吸附了相应的氨基酸排列在酶分子表面,然后使其聚合而成的,于是原有的蛋白质成了合成新蛋白质的模板。按中心法则蛋白质应当是遗传信息传递的终端,可一些朊病毒只有蛋白质没有核酸,进入宿主细胞后能靠自身的蛋白质将宿主正常蛋白质改变结构而繁殖自己,这也是遗传信息由蛋白质传给蛋白质的典型例子(疯牛病毒)。
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我们从分子水平上已经看到一些与中心法则相悖的事例,那么在更高层次上情况又如何呢?我们知道细胞膜是由脂类和蛋白质组成的,而蛋白质是由膜蛋白的有关基因表达而来,脂类则由合成脂类的酶催化而成,DNA还是主宰者,但如果仅有脂类和蛋白质却得不到膜,必需加上极少量的膜作为模板,亦即非DNA模板。这类现象还出现在叶绿体、线粒体、细菌细胞壁的生成过程中。显然这是与中心法则相悖的。
在中心法则下我们能够解释基因控制性状,有些直接参与了我们对一些基因疾病的研究并取得了可靠的依据。但本文开头所描述的清道夫们仍在水中游动着,它们的存在让我们不得不对中心法则进行更深入的思考。
这再次告诉我们,一个科学的理论系统不是一蹴而就的,和进化论一样,中心法则推动了生物学突飞猛进的发展,历史功绩不容抹杀,有悖现象的存在不是坏事,它必将促使我们的认识水平向纵深发展,相信中心法则作为一个重要的生物学理论基础一定会得到充实、发展和提高。
□九 歌, 百拇医药