Pudmed系统 免费的Medline数据库检索
主持人的话:
美国Medline数据库是当今世界上最具权威的临床医学文献数据库,也是国内医学用户获取国外医学信息使用最频繁的数据库。先进的网络技术支持,使PubMed系统免费Medline数据库的服务功能全面而强大,堪称为网络时代数据库服务系统的楷模。尽管界面功能和智能化搜索程度的提高,使用户对检索技巧的依赖性降低,但是否能以更快捷的方式、更高的精度得到满意的查询结果,很大程度上仍取决于对系统规则的了解。为了让广大医生科学、系统地掌握该库的检索方法,我们将开辟四个版面,系统介绍PubMed系统功能及 Medline数据库的检索规则、技巧。
美国国立医学图书馆的Medline数据库收录了1966年以来、70多个国家、4300多种生物医学期刊的题录和文摘,其中88%的资料用英文发表,76%的文献带有文摘。Medline数据库收录的专业范围包括人类医学、兽医学和其他学科,内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医学保健和医学情报科学等多个学科领域,目前已有1100多万条记录,年递增达30万条以上。
, http://www.100md.com
1997年6月26日,美国国立医学图书馆开始利用Internet的Web方式提供免费Medline数据库、Premedline以及最新版医学主题词词表(MeSH)等检索服务,为全球的医学工作者特别是临床医生获取医学信息资源提供了极大的方便。为了让国内的医学用户了解Medline数据库的检索知识,全面掌握检索技巧,本文将结合实例,全面、系统地介绍PubMed系统Medline数据库的检索技能。Pubmed系统主页如图1所示。
PubMed检索
PubMed提供了强大的技术支持,使用户可以非常容易地进行检索。用户可以在检索框中输入任意一个符合自己检索要求的概念:如一个或多个主题(可以是一到多个自由词、关键词、主题词)、作者姓名、杂志名称、特定时间等,点“Go”按键,就可以得到相关文献。检索功能栏见图2。
1.主题概念检索
, 百拇医药
在检索框中键入一到多个单词,如键入:vitamin c common cold,PubMed将自动地利用它的“自动词语匹配”功能将重要的词语结合在一起,并将不规范的词语转换成MeSH词表中的规范用词。如上例中,系统会将检索要求转换成(“Ascorbic Acid”[MeSH Terms]OR vitamin c [Text Word]) And (“Common Cold”[MeSH Terms] OR common cold [Text Word]) 在多个字段中进行检索。
如果输入的检索词包括逻辑运算符AND、OR、NOT, 这些运算符必须要大写,例如: vitamin c OR zinc
一旦点击检索键Go,PubMed 将显示检索结果,同时检索框中仍然保留刚才输入的检索式。可以通过在检索框或Details(明细框)中添加或删除检索词来修改当前的检索式。
2.作者姓名检索
, 百拇医药
按照姓+名缩写(不加标点)的格式键入作者姓名,如:Smith ja,jones k,系统会自动在作者字段内进行检索。如果想进行更精确的检索,可以用双引号将作者名引起来,再加[au](作者字段标识符),如:“smith J”[au]。如果只键入作者的姓(last name),PubMed 将在所有字段中进行检索,除非在MeSH 转换表中检索到(如:Yang 将检索成Yin-Yang [MeSH]或 Yang [Text Word])。
3.杂志名称检索
可以在检索框中键入杂志全名,如:molecular biology of the cell,系统的“自动词语匹配”功能会自动将其转换成(“mol biol cell” [Journal Name])进行检索;也可以直接键入Medline的期刊标准缩写形式如:mol biol cell,或者是键入刊物的ISSN(国际标准出版物代码)如:1059-1524进行检索。
, 百拇医药
需要注意的是:如果杂志名称恰好是MeSH词表中的词,如:Gene Therapy,Science,Cell等,PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中的主题词进行检索;此外,如果杂志名是一个单词,如“Scanning”,系统将会在所有的字段中进行检索。以上两种情况下,需要将检索请求进行标准化处理,即在杂志名后面加[ta](杂志名称字段标识符)。还需要注意的是,在早年的文献中,没有ISSN号。
如果杂志全名中包括括弧或方括号,键入时应该予以取消,例如杂志名为:J Hand Surg [Am],检索时应转成:J Hand Surg Am.
4.转换功能
PubMed系统采用以下几种词表(索引)之间的相互转换,来保证查全、查准率。
(1) MeSH词转换表
, 百拇医药
MeSH词转换表包含MeSH词和组成MeSH主题词和副主题词以及统一医学词汇系统(UMLS)的同义词、英语变异词以及物质名称等词汇, 如果键入的检索词与该表中的词相匹配,则检索词作为MeSH词和文本词(Text Word)同时进行检索。例如输入检索词:vitamin h , PubMed将转换为(“Biotin”[MeSH Terms] OR vitamin h[Text Word]) 进行检索,因为vitamin h 与MeSH词表中的Biotin是同义词。
提示:点击特征栏上的Details功能键, 可以了解输入的词被转换后进行检索的详细情况。
(2) 杂志名称转换表
该表包括杂志全称、MEDLINE杂志缩写形式和ISSN 号。例如:如键入杂志名称为:new england journal of medicine,PubMed 将自动转换为: “N Engl J Med”[Journal Name]进行检索。
, 百拇医药
(3)短语表
如果输入的词在 MeSH 和杂志名称转换表中都没有找到合适的匹配词,系统将在短语表中进行查找。该表中的短语来源于MeSH、UMLS以及物质名称等。
(4)作者索引
如果系统对输入的短语在以上表中检索都没有被命中, 并且有一个或两个字母在词后, PubMed 将在作者索引表中进行查找,如果仍然没有发现合适的匹配,PubMed 将用AND将单个词联接起来在所有字段中进行查找。
5、截词检索
可利用系统的截词功能获取更多的相关文献,这与检索Medline光盘时截词符的用法是相同的。截词符“*”可代表多个字符,将 * 加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索,例如:bacter*,可以检出bacter、bacteria、bacterium等词。 PubMed 一次最多可以检索出150个词形变异词。如果多于150个变异词,PubMed 将显示提示信息。
注意:
截词符 * 空格以后的词不在检索范围内,例如infection* 包括infections,但不包括infection control等词语。
截词检索时,系统的自动词语匹配功能和MeSH自动扩展功能将不再被执行,例如:heart attack* 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarction ,也不包括更多其他特殊词,如:Myocardial Stunning;Shock;Cardiogenic。, http://www.100md.com(郑 力)
美国Medline数据库是当今世界上最具权威的临床医学文献数据库,也是国内医学用户获取国外医学信息使用最频繁的数据库。先进的网络技术支持,使PubMed系统免费Medline数据库的服务功能全面而强大,堪称为网络时代数据库服务系统的楷模。尽管界面功能和智能化搜索程度的提高,使用户对检索技巧的依赖性降低,但是否能以更快捷的方式、更高的精度得到满意的查询结果,很大程度上仍取决于对系统规则的了解。为了让广大医生科学、系统地掌握该库的检索方法,我们将开辟四个版面,系统介绍PubMed系统功能及 Medline数据库的检索规则、技巧。
美国国立医学图书馆的Medline数据库收录了1966年以来、70多个国家、4300多种生物医学期刊的题录和文摘,其中88%的资料用英文发表,76%的文献带有文摘。Medline数据库收录的专业范围包括人类医学、兽医学和其他学科,内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医学保健和医学情报科学等多个学科领域,目前已有1100多万条记录,年递增达30万条以上。
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1997年6月26日,美国国立医学图书馆开始利用Internet的Web方式提供免费Medline数据库、Premedline以及最新版医学主题词词表(MeSH)等检索服务,为全球的医学工作者特别是临床医生获取医学信息资源提供了极大的方便。为了让国内的医学用户了解Medline数据库的检索知识,全面掌握检索技巧,本文将结合实例,全面、系统地介绍PubMed系统Medline数据库的检索技能。Pubmed系统主页如图1所示。
PubMed检索
PubMed提供了强大的技术支持,使用户可以非常容易地进行检索。用户可以在检索框中输入任意一个符合自己检索要求的概念:如一个或多个主题(可以是一到多个自由词、关键词、主题词)、作者姓名、杂志名称、特定时间等,点“Go”按键,就可以得到相关文献。检索功能栏见图2。
1.主题概念检索
, 百拇医药
在检索框中键入一到多个单词,如键入:vitamin c common cold,PubMed将自动地利用它的“自动词语匹配”功能将重要的词语结合在一起,并将不规范的词语转换成MeSH词表中的规范用词。如上例中,系统会将检索要求转换成(“Ascorbic Acid”[MeSH Terms]OR vitamin c [Text Word]) And (“Common Cold”[MeSH Terms] OR common cold [Text Word]) 在多个字段中进行检索。
如果输入的检索词包括逻辑运算符AND、OR、NOT, 这些运算符必须要大写,例如: vitamin c OR zinc
一旦点击检索键Go,PubMed 将显示检索结果,同时检索框中仍然保留刚才输入的检索式。可以通过在检索框或Details(明细框)中添加或删除检索词来修改当前的检索式。
2.作者姓名检索
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按照姓+名缩写(不加标点)的格式键入作者姓名,如:Smith ja,jones k,系统会自动在作者字段内进行检索。如果想进行更精确的检索,可以用双引号将作者名引起来,再加[au](作者字段标识符),如:“smith J”[au]。如果只键入作者的姓(last name),PubMed 将在所有字段中进行检索,除非在MeSH 转换表中检索到(如:Yang 将检索成Yin-Yang [MeSH]或 Yang [Text Word])。
3.杂志名称检索
可以在检索框中键入杂志全名,如:molecular biology of the cell,系统的“自动词语匹配”功能会自动将其转换成(“mol biol cell” [Journal Name])进行检索;也可以直接键入Medline的期刊标准缩写形式如:mol biol cell,或者是键入刊物的ISSN(国际标准出版物代码)如:1059-1524进行检索。
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需要注意的是:如果杂志名称恰好是MeSH词表中的词,如:Gene Therapy,Science,Cell等,PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中的主题词进行检索;此外,如果杂志名是一个单词,如“Scanning”,系统将会在所有的字段中进行检索。以上两种情况下,需要将检索请求进行标准化处理,即在杂志名后面加[ta](杂志名称字段标识符)。还需要注意的是,在早年的文献中,没有ISSN号。
如果杂志全名中包括括弧或方括号,键入时应该予以取消,例如杂志名为:J Hand Surg [Am],检索时应转成:J Hand Surg Am.
4.转换功能
PubMed系统采用以下几种词表(索引)之间的相互转换,来保证查全、查准率。
(1) MeSH词转换表
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MeSH词转换表包含MeSH词和组成MeSH主题词和副主题词以及统一医学词汇系统(UMLS)的同义词、英语变异词以及物质名称等词汇, 如果键入的检索词与该表中的词相匹配,则检索词作为MeSH词和文本词(Text Word)同时进行检索。例如输入检索词:vitamin h , PubMed将转换为(“Biotin”[MeSH Terms] OR vitamin h[Text Word]) 进行检索,因为vitamin h 与MeSH词表中的Biotin是同义词。
提示:点击特征栏上的Details功能键, 可以了解输入的词被转换后进行检索的详细情况。
(2) 杂志名称转换表
该表包括杂志全称、MEDLINE杂志缩写形式和ISSN 号。例如:如键入杂志名称为:new england journal of medicine,PubMed 将自动转换为: “N Engl J Med”[Journal Name]进行检索。
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(3)短语表
如果输入的词在 MeSH 和杂志名称转换表中都没有找到合适的匹配词,系统将在短语表中进行查找。该表中的短语来源于MeSH、UMLS以及物质名称等。
(4)作者索引
如果系统对输入的短语在以上表中检索都没有被命中, 并且有一个或两个字母在词后, PubMed 将在作者索引表中进行查找,如果仍然没有发现合适的匹配,PubMed 将用AND将单个词联接起来在所有字段中进行查找。
5、截词检索
可利用系统的截词功能获取更多的相关文献,这与检索Medline光盘时截词符的用法是相同的。截词符“*”可代表多个字符,将 * 加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索,例如:bacter*,可以检出bacter、bacteria、bacterium等词。 PubMed 一次最多可以检索出150个词形变异词。如果多于150个变异词,PubMed 将显示提示信息。
注意:
截词符 * 空格以后的词不在检索范围内,例如infection* 包括infections,但不包括infection control等词语。
截词检索时,系统的自动词语匹配功能和MeSH自动扩展功能将不再被执行,例如:heart attack* 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarction ,也不包括更多其他特殊词,如:Myocardial Stunning;Shock;Cardiogenic。, http://www.100md.com(郑 力)