Internet医学资源搜索引擎(二)
CliniWeb International
http://www.ohsu.edu/cliniweb/
CliniWeb International是由美国Oregon医学院组织建立的基于WWW的临床医学网络信息资源目录,主页如图1所示。由于网络上的信息资源质量良莠不齐,所以一个好的搜索引擎并不体现在收集网络资源量的多少,而在于所收集资源的质量。CliniWeb的成功之处,也是基于其对入选网页比较严格的筛选机制。
CliniWeb的资源收集机制:
图1 CliniWeb International主页
CliniWeb在其第一次的内容筛选中采用了对所有收集到的网页进行人工选择的方法,来发现和确定网页中是否包括高质量的临床信息。随后,CliniWeb的研制人员对其自动搜索机器人Web Crawler进行了修改,一方面建立一个包含或链接有高质量临床信息的“哨兵”网页(Sentinal Pages)的列表,作为自动搜索程序Crawler的起始URL集合;另一方面在搜集信息的策略中采用不跨域进行链接、在一个网站内不链接到其他目录、对长度缩短的URL不进行链接、对非HTML文件不进行链接等四种主要规则,控制Crawler不去访问或链接到有可能是低质量的网页。在采取上述两方面的控制后,Crawler发现高质量网页的可能性大大提高。通过这个Crawler发现的网页成为“候选”网页(Candidate Pages),还要由专业人员对其质量进行评价和选择,并进行人工标引。
, 百拇医药
CliniWeb的资源分类机制:
目前虽然有很多集中反映网络临床医学信息资源的索引,但许多索引的分类太粗、太宽泛,如:外科、内科、肿瘤等,这种过粗的分类方法使临床医生在使用上很不方便,不能迅速定位欲查找的信息。Cliniweb充分考虑到了临床医生的使用特点,采用了美国国立医学图书馆的医学主题词表(MeSH,Medical Subheading Words)作为分类基础,按照MeSH树状结构表分为七个大类:
●解剖学(Anatomy);
●生物体(Organisms);
●疾病(Disease);
●化学制品和药物(Chemicals and Drugs);
●分析、诊断与治疗技术及仪器(Analytical Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment);
, 百拇医药
●精神病学与心理学(Psychiatry and Psychology);
●生物科学(Biological Sciences)。
MeSH词表中的按疾病和解剖部位分类体系,可以使医生很方便地定位欲查找的信息,因此说,MeSH分类方法提供了更丰富的、详细的主题查找途径。而CliniWeb采用的统一医学语言系统(UMLS,Unified Medical Language System)标引系统,又可帮助用户将输入的不规范词(如:同义词、近义词等)自动转换成MeSH词进行检索,还可以完成对MeSH词表中暂时没有收录词的补充检索,避免了用户查找规范词的麻烦和漏检、误检的可能。例如输入heart diseases,可以检索出MeSH中该树下的所有分类,Coronary Disease、 Glycogen Storage Disease Type II、Heart Block、 Heart Failure, Congestive Myocardial Diseases等。用户可以根据下一级结构再选择合适的词。
, http://www.100md.com
CliniWeb信息检索:
CliniWeb共链接了10000多个临床资源节点,可以通过逐级浏览和关键词两种方式进行检索。浏览方式可以让用户按照MeSH 分类层次进行逐级浏览,直到发现欲查找内容的分类超链为止。关键词检索则要点击Searching,在检索框中输入检索词即可。在高级检索中可以限定语种,提供了用英语、法语、德语、西班牙语和葡萄牙语等语种的选择。
检索实例:
实例1 检索肝癌方面的信息:
图2 Virus Diseases 分类及资源页面
在检索框中输入:hepatocarcinoma,回车后系统返回规范的主题词:carcinoma, hepatocellular,点击其超链接,即进入命中的有关肝癌的信息页。在该信息页中,首先将PubMed系统(Medline数据库)收录的有关最近一年中肝癌方面的信息分为:All(全部)、Review(综述)、Therapy(治疗)以及Diagnosis(诊断)等四类进行组织,点击即开始自动执行PubMed检索。此外,还搜集了许多肝癌方面的各种图像信息。这些图像信息主要来自于美国衣阿华网络虚拟医院病理图库、美国犹他州医学院病理解剖图库、意大利比萨超声波图库等,这些图像资料对临床医生具有较高的参考价值。
, http://www.100md.com
实例2 检索病毒性疾病方面的信息:
按浏览方式检索有关病毒性疾病方面的信息,可以在首页上点击Browse,然后在七大分类中选择Diseases,在返回页中点击Virus Diseases即可得到所有有关病毒性疾病的信息页(如图2界面),该界面按照字母顺序对病毒性疾病进行分类排列,在具体疾病下面则列出了相关的网络资源,如PubMed系统中有关该疾病的文献链接以及相关网上电子期刊、研究报告等资源的链接。
特别提示:
1、CliniWeb 还只是一个实验性的侧重于搜索临床医学信息资源的搜索引擎,它不是一个全面体现网络临床医学信息资源的数据库,如果通过CliniWeb不能满足检索需求,CliniWeb 建议采用Medical Matrix、Yahoo Health或MedWeb来补充。
2、CliniWeb的目标是提供快捷和方便获取临床医学信息资源,其收集内容的重点是对医学教育和医疗实践有参考价值的临床信息。因此,它更侧重于服务医学院校的学生和临床医生,而不太适合于医学研究人员获取动态信息。, 百拇医药
http://www.ohsu.edu/cliniweb/
CliniWeb International是由美国Oregon医学院组织建立的基于WWW的临床医学网络信息资源目录,主页如图1所示。由于网络上的信息资源质量良莠不齐,所以一个好的搜索引擎并不体现在收集网络资源量的多少,而在于所收集资源的质量。CliniWeb的成功之处,也是基于其对入选网页比较严格的筛选机制。
CliniWeb的资源收集机制:
图1 CliniWeb International主页
CliniWeb在其第一次的内容筛选中采用了对所有收集到的网页进行人工选择的方法,来发现和确定网页中是否包括高质量的临床信息。随后,CliniWeb的研制人员对其自动搜索机器人Web Crawler进行了修改,一方面建立一个包含或链接有高质量临床信息的“哨兵”网页(Sentinal Pages)的列表,作为自动搜索程序Crawler的起始URL集合;另一方面在搜集信息的策略中采用不跨域进行链接、在一个网站内不链接到其他目录、对长度缩短的URL不进行链接、对非HTML文件不进行链接等四种主要规则,控制Crawler不去访问或链接到有可能是低质量的网页。在采取上述两方面的控制后,Crawler发现高质量网页的可能性大大提高。通过这个Crawler发现的网页成为“候选”网页(Candidate Pages),还要由专业人员对其质量进行评价和选择,并进行人工标引。
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CliniWeb的资源分类机制:
目前虽然有很多集中反映网络临床医学信息资源的索引,但许多索引的分类太粗、太宽泛,如:外科、内科、肿瘤等,这种过粗的分类方法使临床医生在使用上很不方便,不能迅速定位欲查找的信息。Cliniweb充分考虑到了临床医生的使用特点,采用了美国国立医学图书馆的医学主题词表(MeSH,Medical Subheading Words)作为分类基础,按照MeSH树状结构表分为七个大类:
●解剖学(Anatomy);
●生物体(Organisms);
●疾病(Disease);
●化学制品和药物(Chemicals and Drugs);
●分析、诊断与治疗技术及仪器(Analytical Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment);
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●精神病学与心理学(Psychiatry and Psychology);
●生物科学(Biological Sciences)。
MeSH词表中的按疾病和解剖部位分类体系,可以使医生很方便地定位欲查找的信息,因此说,MeSH分类方法提供了更丰富的、详细的主题查找途径。而CliniWeb采用的统一医学语言系统(UMLS,Unified Medical Language System)标引系统,又可帮助用户将输入的不规范词(如:同义词、近义词等)自动转换成MeSH词进行检索,还可以完成对MeSH词表中暂时没有收录词的补充检索,避免了用户查找规范词的麻烦和漏检、误检的可能。例如输入heart diseases,可以检索出MeSH中该树下的所有分类,Coronary Disease、 Glycogen Storage Disease Type II、Heart Block、 Heart Failure, Congestive Myocardial Diseases等。用户可以根据下一级结构再选择合适的词。
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CliniWeb信息检索:
CliniWeb共链接了10000多个临床资源节点,可以通过逐级浏览和关键词两种方式进行检索。浏览方式可以让用户按照MeSH 分类层次进行逐级浏览,直到发现欲查找内容的分类超链为止。关键词检索则要点击Searching,在检索框中输入检索词即可。在高级检索中可以限定语种,提供了用英语、法语、德语、西班牙语和葡萄牙语等语种的选择。
检索实例:
实例1 检索肝癌方面的信息:
图2 Virus Diseases 分类及资源页面
在检索框中输入:hepatocarcinoma,回车后系统返回规范的主题词:carcinoma, hepatocellular,点击其超链接,即进入命中的有关肝癌的信息页。在该信息页中,首先将PubMed系统(Medline数据库)收录的有关最近一年中肝癌方面的信息分为:All(全部)、Review(综述)、Therapy(治疗)以及Diagnosis(诊断)等四类进行组织,点击即开始自动执行PubMed检索。此外,还搜集了许多肝癌方面的各种图像信息。这些图像信息主要来自于美国衣阿华网络虚拟医院病理图库、美国犹他州医学院病理解剖图库、意大利比萨超声波图库等,这些图像资料对临床医生具有较高的参考价值。
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实例2 检索病毒性疾病方面的信息:
按浏览方式检索有关病毒性疾病方面的信息,可以在首页上点击Browse,然后在七大分类中选择Diseases,在返回页中点击Virus Diseases即可得到所有有关病毒性疾病的信息页(如图2界面),该界面按照字母顺序对病毒性疾病进行分类排列,在具体疾病下面则列出了相关的网络资源,如PubMed系统中有关该疾病的文献链接以及相关网上电子期刊、研究报告等资源的链接。
特别提示:
1、CliniWeb 还只是一个实验性的侧重于搜索临床医学信息资源的搜索引擎,它不是一个全面体现网络临床医学信息资源的数据库,如果通过CliniWeb不能满足检索需求,CliniWeb 建议采用Medical Matrix、Yahoo Health或MedWeb来补充。
2、CliniWeb的目标是提供快捷和方便获取临床医学信息资源,其收集内容的重点是对医学教育和医疗实践有参考价值的临床信息。因此,它更侧重于服务医学院校的学生和临床医生,而不太适合于医学研究人员获取动态信息。, 百拇医药