气功疗法是中医学的一个组成部分，它具有传统中医学的基本特色，同时还具有不同于中医其他疗法的自身特色。这些特色可概括为四种，可称气功疗法的四大特点。
1、整体疗法
气功疗法在总体上对于具体病种或机体的某个局部的针对性并不强，它不是特异性疗法，而是以改善整体机能状态，提高整体素质为目的的疗法，因此是整体疗法。气功疗法是以调心、调息、调身为操作内容的，这三调的操作活动均有整体作用。调心在三调中起主导作用，中医理论认为，心主神明，心为五脏六腑之大主，气功疗法中调心活动可以安定心神，主明则下安，故通过调心即可对五脏六腑起到良性调节作用，使整体受益。从现代医学和生理学观点看，调心活动实际上是对神经系统、尤其是高级中枢神经系统进行调整。科学实验证明，练功时大脑皮层额叶、顶叶的细胞电活动的有序化以及皮层各区域电活动的同步化加强，这可以解释为练功可对于高级神经中枢产生良好的调整作用，并促进其对全身各功能系统的统领，从而可改善整体的功能状态。这个推论与中医理论的认识是不谋而合的，均指出了调心活动的整体作用。调息的整体作用也很明显，调息活动与内气密切相关，可以起到推动内气运行、培补元气的作用，使周身气血通达，整体生机旺盛。调身活动外动四肢百骸，内及五脏六腑，通过肢体运动促进脏腑机能，上通下达，里应外合，使整个机体协调统一，功能得到加强。由此可见，以三调操作为内容的气功疗法绝不是头痛医头、脚痛医脚，而是调节整体、加强整体，以整体带动局部，从而使疾病康复。应用气功疗法治病，无论学练何种功法，经过一段时间，普遍反映饮食和睡眠改善，心情愉快，精力充沛，这正是整体功能改善和健康程度提高的基本表现。
气功疗法的整体性特点也体现在疗效的特点上，例如它的双向调节作用，同一种功法可能在两个不同方向上对机体进行调节，血压高者可使降低，血压低者可使升高，甲状腺机能亢进者使之降低，甲状腺机能低下者使之升高。这也说明气功疗法的调节是在整体水平上的“以平为期”。如果仅是对局部症状的治疗，不会有双向调节的效果。
2、主动疗法
气功疗法是心身锻炼方法，需要充分发挥个人的主观能动性，所以是一种主动疗法。在强调主动性这一方面，气功疗法是对其他疗法的重要补充。在数千年的医学发展史上，无论是中医还是西医，无论是针灸、推拿还是手术、药物，患者都是被动地接受治疗，听从医护人员的安排。只有气功疗法使患者在疾病面前处于主动地位，一旦学会了所需的功法，便把治疗措施掌握在自己手中，实行自我调整，自我治疗。患者面对疾病的主动或被动态度，对机体的心身活动能够产生深刻的影响，从而最终影响治疗结果。某些应用其他疗法效果欠佳的病例因练气功而得到效果，其原因就可能与患者心态的转变有关。
既然是主动疗法，就需要勤学勤练，持之以恒，才能取得良好的效果。学练气功最忌信心不坚，一曝十寒。抱着半信半疑的态度三心二意地练功是难于坚持到底的。在这个意义上，“信则灵”有一定道理。为使患者树立信心，应尽可能让患者了解气功疗法治病的机理，对气功疗法有正确的、科学的认识，这是关系到治疗成败的重要因素之一。
3、自然疗法
气功疗法的一项基本原则是“顺乎自然”，要求依主客观的自然条件而灵活掌握练功进程。气功疗法的大多数功法都是简便易行的，不受外界条件限制，只在自己身上下功夫，可以因时、因地、因人制宜，随时随地练习。而且，只要顺其自然练功，锻炼起来就是一种轻松愉快、充满乐趣的享受，毫无强制约束之苦，故懂得气功疗法顺乎自然之精髓者，并不需要苦练，而是要求“乐”练。相反，如果一味追求人为的境界而不是顺其自然，则容易出现偏差，正如《张氏医通·入魔走火》篇所说：“修真练气之士，不求自然之旨，刻以吐纳为务，乃至气乱于中，火炽于外，而为怔忡痞逆，躁扰不宁等患。”
4、综合疗法
气功疗法从现代医学的观点看，不是一种单一的疗法，而是包含了多种疗法的综合疗法。例如，它包括心理疗法、体育疗法、音乐疗法、森林疗法、花香疗法、书画等作业疗法、自我按摩、信息疗法，以及利用日光、空气、水等各种自然条件帮助康复的一切方法，是多种自然疗法的综合运用。此外，古今的许多练功方法还包括食物、药物(包括丹药)相辅佐，也常配合针灸和推拿，现代又常配合各种理疗仪器，故它与其他疗法也可协同应用，共同发挥作用。
1、整体疗法
气功疗法在总体上对于具体病种或机体的某个局部的针对性并不强，它不是特异性疗法，而是以改善整体机能状态，提高整体素质为目的的疗法，因此是整体疗法。气功疗法是以调心、调息、调身为操作内容的，这三调的操作活动均有整体作用。调心在三调中起主导作用，中医理论认为，心主神明，心为五脏六腑之大主，气功疗法中调心活动可以安定心神，主明则下安，故通过调心即可对五脏六腑起到良性调节作用，使整体受益。从现代医学和生理学观点看，调心活动实际上是对神经系统、尤其是高级中枢神经系统进行调整。科学实验证明，练功时大脑皮层额叶、顶叶的细胞电活动的有序化以及皮层各区域电活动的同步化加强，这可以解释为练功可对于高级神经中枢产生良好的调整作用，并促进其对全身各功能系统的统领，从而可改善整体的功能状态。这个推论与中医理论的认识是不谋而合的，均指出了调心活动的整体作用。调息的整体作用也很明显，调息活动与内气密切相关，可以起到推动内气运行、培补元气的作用，使周身气血通达，整体生机旺盛。调身活动外动四肢百骸，内及五脏六腑，通过肢体运动促进脏腑机能，上通下达，里应外合，使整个机体协调统一，功能得到加强。由此可见，以三调操作为内容的气功疗法绝不是头痛医头、脚痛医脚，而是调节整体、加强整体，以整体带动局部，从而使疾病康复。应用气功疗法治病，无论学练何种功法，经过一段时间，普遍反映饮食和睡眠改善，心情愉快，精力充沛，这正是整体功能改善和健康程度提高的基本表现。
气功疗法的整体性特点也体现在疗效的特点上，例如它的双向调节作用，同一种功法可能在两个不同方向上对机体进行调节，血压高者可使降低，血压低者可使升高，甲状腺机能亢进者使之降低，甲状腺机能低下者使之升高。这也说明气功疗法的调节是在整体水平上的“以平为期”。如果仅是对局部症状的治疗，不会有双向调节的效果。
2、主动疗法
气功疗法是心身锻炼方法，需要充分发挥个人的主观能动性，所以是一种主动疗法。在强调主动性这一方面，气功疗法是对其他疗法的重要补充。在数千年的医学发展史上，无论是中医还是西医，无论是针灸、推拿还是手术、药物，患者都是被动地接受治疗，听从医护人员的安排。只有气功疗法使患者在疾病面前处于主动地位，一旦学会了所需的功法，便把治疗措施掌握在自己手中，实行自我调整，自我治疗。患者面对疾病的主动或被动态度，对机体的心身活动能够产生深刻的影响，从而最终影响治疗结果。某些应用其他疗法效果欠佳的病例因练气功而得到效果，其原因就可能与患者心态的转变有关。
既然是主动疗法，就需要勤学勤练，持之以恒，才能取得良好的效果。学练气功最忌信心不坚，一曝十寒。抱着半信半疑的态度三心二意地练功是难于坚持到底的。在这个意义上，“信则灵”有一定道理。为使患者树立信心，应尽可能让患者了解气功疗法治病的机理，对气功疗法有正确的、科学的认识，这是关系到治疗成败的重要因素之一。
3、自然疗法
气功疗法的一项基本原则是“顺乎自然”，要求依主客观的自然条件而灵活掌握练功进程。气功疗法的大多数功法都是简便易行的，不受外界条件限制，只在自己身上下功夫，可以因时、因地、因人制宜，随时随地练习。而且，只要顺其自然练功，锻炼起来就是一种轻松愉快、充满乐趣的享受，毫无强制约束之苦，故懂得气功疗法顺乎自然之精髓者，并不需要苦练，而是要求“乐”练。相反，如果一味追求人为的境界而不是顺其自然，则容易出现偏差，正如《张氏医通·入魔走火》篇所说：“修真练气之士，不求自然之旨，刻以吐纳为务，乃至气乱于中，火炽于外，而为怔忡痞逆，躁扰不宁等患。”
4、综合疗法
气功疗法从现代医学的观点看，不是一种单一的疗法，而是包含了多种疗法的综合疗法。例如，它包括心理疗法、体育疗法、音乐疗法、森林疗法、花香疗法、书画等作业疗法、自我按摩、信息疗法，以及利用日光、空气、水等各种自然条件帮助康复的一切方法，是多种自然疗法的综合运用。此外，古今的许多练功方法还包括食物、药物(包括丹药)相辅佐，也常配合针灸和推拿，现代又常配合各种理疗仪器，故它与其他疗法也可协同应用，共同发挥作用。