对M组和O组亚型的Hiv-1进行定量检测的新方法
摘要：研究人员开发了一种能够对M和O组亚型HIV-1进行有效定量的灵敏的检测方法。
11月20日美国伊利诺州雅培实验室的P. Swanson及其同事说，1型人免疫缺陷病毒的遗传多样性对以核酸为基础的检测方法的敏感性和定量的精确性提出了挑战。雅培LCx HIV RNA定量法 HIV 法)是一种针对病毒pol整合酶区域的竞争性RT-PCR法。他们对来自于喀麦隆、乌干达、巴西、 泰国、西班牙、阿根廷和南非的297份HIV-1血清阳性的血浆样本用这种检测方法对效果进行了评估。
研究结果发表在《病毒学方法杂志》上和O组病毒。J Virol Meth, 2000;89:97-108)。
作者解释说，样品中包括了M组、嵌合体和O组HIV-1病毒。HIV-1病毒的分组是根据对gag p24、pol 整合酶和env gp41的序列分析而进行的。
LCx HIV法能够对290份样本进行定量分析，其中包括所有的O组HIV-1样本。O组是遗传多样性最多的一组HIV-1病毒。
研究人员还把LCx HIV法与罗氏Amplicor HIV-1监测试验1.0和1.5版作了比较。两种版本的Amplicor HIV-1监测试验只能分别定量67.3%和94.6%的样本。Swanson等报道，没有一种版本的Amplicor HIV-1监测试验能检测出O组HIV-1病毒标本。
297份标本中有7份不能被任何检测试验定量，因为它们还未到达检出水平。资料显示LCx HIV法同任一版本的Amplicor HIV-1监测试验相比，在引物/探针结合部位发生核苷酸错配的情况更少见。
Swanson等总结道：“由于pol靶区域核苷酸的高度保守性，使得LCx HIV法能有效地定量A-G亚型HIV-1和遗传多样性最多的O组HIV-1。”, 百拇医药
11月20日美国伊利诺州雅培实验室的P. Swanson及其同事说，1型人免疫缺陷病毒的遗传多样性对以核酸为基础的检测方法的敏感性和定量的精确性提出了挑战。雅培LCx HIV RNA定量法 HIV 法)是一种针对病毒pol整合酶区域的竞争性RT-PCR法。他们对来自于喀麦隆、乌干达、巴西、 泰国、西班牙、阿根廷和南非的297份HIV-1血清阳性的血浆样本用这种检测方法对效果进行了评估。
研究结果发表在《病毒学方法杂志》上和O组病毒。J Virol Meth, 2000;89:97-108)。
作者解释说，样品中包括了M组、嵌合体和O组HIV-1病毒。HIV-1病毒的分组是根据对gag p24、pol 整合酶和env gp41的序列分析而进行的。
LCx HIV法能够对290份样本进行定量分析，其中包括所有的O组HIV-1样本。O组是遗传多样性最多的一组HIV-1病毒。
研究人员还把LCx HIV法与罗氏Amplicor HIV-1监测试验1.0和1.5版作了比较。两种版本的Amplicor HIV-1监测试验只能分别定量67.3%和94.6%的样本。Swanson等报道，没有一种版本的Amplicor HIV-1监测试验能检测出O组HIV-1病毒标本。
297份标本中有7份不能被任何检测试验定量，因为它们还未到达检出水平。资料显示LCx HIV法同任一版本的Amplicor HIV-1监测试验相比，在引物/探针结合部位发生核苷酸错配的情况更少见。
Swanson等总结道：“由于pol靶区域核苷酸的高度保守性，使得LCx HIV法能有效地定量A-G亚型HIV-1和遗传多样性最多的O组HIV-1。”, 百拇医药