限制性内切酶在非特异DNA上的滑动
与Aggarwal在今年五月的Molecular Cell上报道解析了BamHI结合在非特异性DNA上的结晶结构，此结构为滑行模型中的中间复合物提供了原子细节。
复合物的结构显示，BamHI双体以开放模式松散的结合在DNA上，Viadiu
与Aggarwal确实发现DNA分子在非特异性复合物的结合缝隙中滑落。而且，特异性位点的单碱基突变导致DNA与蛋白质之间主干碱基特异性接触缺失，这个缺失可能让DNA与蛋白之间的滑动可以进行。
这项研究有助于解释限制性内切酶的特异性原因，为什么蛋白与非特异性DNA的结合有利于滑动而不利于切割。目前还存在的问题是BamHI究竟是沿着DNA单面滑动还是沿着大沟滑动?
相关文章：
Original research paper
Viadiu, H. & Aggarwal, A. K. Structure of BamHI bound to nonspecific DNA: a model for DNA sliding. Mol. Cell 5,889–895 (2000). REVIEWS
von Hippel, P. H. Protein–DNA recognition: new
perspectives and underlying themes. Science 263, 769–770 (1994).
Further reading
Guthold, M. et al. Direct observation of one-dimensional diffusion and transcription by Escherichia coli RNA
polymerase. Biophys. J. 77, 2284–2294 (1999).
Viadiu, H., Kucera, R., Schildkraut, I. &
Aggarwal, A. K. Crystallization of restriction endonuclease BamHI with Non-specific DNA. J. Struct. Biol. (in the press)., http://www.100md.com
复合物的结构显示，BamHI双体以开放模式松散的结合在DNA上，Viadiu
与Aggarwal确实发现DNA分子在非特异性复合物的结合缝隙中滑落。而且，特异性位点的单碱基突变导致DNA与蛋白质之间主干碱基特异性接触缺失，这个缺失可能让DNA与蛋白之间的滑动可以进行。
这项研究有助于解释限制性内切酶的特异性原因，为什么蛋白与非特异性DNA的结合有利于滑动而不利于切割。目前还存在的问题是BamHI究竟是沿着DNA单面滑动还是沿着大沟滑动?
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perspectives and underlying themes. Science 263, 769–770 (1994).
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polymerase. Biophys. J. 77, 2284–2294 (1999).
Viadiu, H., Kucera, R., Schildkraut, I. &
Aggarwal, A. K. Crystallization of restriction endonuclease BamHI with Non-specific DNA. J. Struct. Biol. (in the press)., http://www.100md.com