拟南介与马铃薯
尽管拟南介和马铃薯于1.12亿年前在进化树上就已分开，但它们各自的基因组充当了历史见证人的角色，它们原本共享一些基因，在进化的过程中又分别获得了一些新基因。对这两者的基因组加以比较，能够让我们了解自从双子叶植物发散进化后，基因组是怎样变化的，进而也能在其他重要作物如咖啡，棉花也用类似的方法进行比较。
Ku etal.将马铃薯2号染色体中的一个105kb的BAC测序，发现有17个预测出的可能基因，其中12个ORF与拟南介基因组中的四条染色体(2,3,4,5)上的某区域都有cross-matched，这四个拟南介染色体中的对应片段与马铃薯BAC中的ORF有重叠，但并不完整覆盖。而且，马铃薯BAC中这12个ORF的排列顺序与拟南介对应片段的顺序也相同。
最简单的解释可能有两点，一，拟南介与马铃薯在进化上分开后，拟南介的这些区域发生了两轮大规模的染色体重复，二是所有这些区域都有一个共同的祖先，类马铃薯的序列是最初的模板。
保守的基因排列顺序告诉我们染色体重排(插入、倒位、移位)在影响植物基因组的进化方面作用有限，有可能是基因组的若干轮重复复制的作用更大。
还有尽管马铃薯的基因组大小是拟南介的近七倍，但马铃薯的基因分布并不比拟南介更分散。如果认为此BAC能足够代表马铃薯基因组的话，那么要14.5万个基因才能构造出马铃薯来!
接下来的问题越来越多，其他双子叶植物也有基因组重复的现象吗?我们还能在跨度很远的基因组比较上发现更多的多样化现象吗?这些现象会影响到拟南介基因组序列的分析和注释吗?
相关文章：
ORIGINAL RESEARCH PAPER
Ku, H.-M., Vision, T., Liu, J. & Tanksley, S. D. Comparing sequenced
segments of the tomato and Arabidopsis genomes: large-scale
duplication followed by selective gene loss creates a network of synteny. Proc. Natl Acad. Sci. USA 97, 9121–9126 (2000). MEDLINE
Grant,D., Cregan, P. & Shoemaker, R. C. Genome organization in dicots:
genome duplication in Arabidopsis and synteny between soybean and Arabidopsis. Proc. Natl Acad. Sci. USA 97, 4168– 4173 (2000).
MEDLINE
FURTHER READING
Blanc, G., Barakat, A., Guyot, R., Cooke, R. & Delseny M. Extensive duplication and reshuffling
in the Arabidopsis genome. Plant Cell 12, 1093–1102 (2000).
MEDLINE, 百拇医药
Ku etal.将马铃薯2号染色体中的一个105kb的BAC测序，发现有17个预测出的可能基因，其中12个ORF与拟南介基因组中的四条染色体(2,3,4,5)上的某区域都有cross-matched，这四个拟南介染色体中的对应片段与马铃薯BAC中的ORF有重叠，但并不完整覆盖。而且，马铃薯BAC中这12个ORF的排列顺序与拟南介对应片段的顺序也相同。
最简单的解释可能有两点，一，拟南介与马铃薯在进化上分开后，拟南介的这些区域发生了两轮大规模的染色体重复，二是所有这些区域都有一个共同的祖先，类马铃薯的序列是最初的模板。
保守的基因排列顺序告诉我们染色体重排(插入、倒位、移位)在影响植物基因组的进化方面作用有限，有可能是基因组的若干轮重复复制的作用更大。
还有尽管马铃薯的基因组大小是拟南介的近七倍，但马铃薯的基因分布并不比拟南介更分散。如果认为此BAC能足够代表马铃薯基因组的话，那么要14.5万个基因才能构造出马铃薯来!
接下来的问题越来越多，其他双子叶植物也有基因组重复的现象吗?我们还能在跨度很远的基因组比较上发现更多的多样化现象吗?这些现象会影响到拟南介基因组序列的分析和注释吗?
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ORIGINAL RESEARCH PAPER
Ku, H.-M., Vision, T., Liu, J. & Tanksley, S. D. Comparing sequenced
segments of the tomato and Arabidopsis genomes: large-scale
duplication followed by selective gene loss creates a network of synteny. Proc. Natl Acad. Sci. USA 97, 9121–9126 (2000). MEDLINE
Grant,D., Cregan, P. & Shoemaker, R. C. Genome organization in dicots:
genome duplication in Arabidopsis and synteny between soybean and Arabidopsis. Proc. Natl Acad. Sci. USA 97, 4168– 4173 (2000).
MEDLINE
FURTHER READING
Blanc, G., Barakat, A., Guyot, R., Cooke, R. & Delseny M. Extensive duplication and reshuffling
in the Arabidopsis genome. Plant Cell 12, 1093–1102 (2000).
MEDLINE, 百拇医药
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