应用基因表达谱芯片研究人胃癌细胞周期和细胞凋亡相关基因.pdf
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×流行病学研究?
应用基因表达谱芯片研究人胃癌细胞周期和
细胞凋亡相关基因
马万山1
, 葛汝村2
, 高辉2
, 汪运山3
1.山东省千佛山医院检验科 ,山东 济南 250014
2.山东省交通医院中心实验室 ,山东 济南 250031
3.济南市中心医院检验科 ,山东 济南 250013
Microarray in screening for di fferentially expre ssed gene s of cellular cycle and apoptosis
in ga stric cancer
MA Wan2shan1
, GE Ru2cun2
, GAO Hui
2
, WA N G Yun2shan3
1. Cl inical L aboratory of S handong Province Qianf oshan Hos pi tal , J inan 250014 , P. R. China
2. Cent ral L ab of S handong Province T raf f ic Hos pi tal , J i nan 250031 , P. R. China
3. Cl inical L aboratory of J inan Cent ral Hos pi tal , J inan 250013 , P. R. China
【摘要】 目的:筛选胃癌发生过程中与正常
组织差异表达的细胞周期和细胞凋亡相关
基因并作初步功能分析。方法:应用 Trizol
一步法抽提胃癌及正常组织总 RNA ,分离
纯化 mRNA 并 逆 转 录 合 成 荧 光 分 子
(Cy3/ Cy5)标记 cDNA 探针 ,与含有 8 464
种cDNA 基因的表达谱芯片杂交 ,分析胃癌
与正常组织间差异表达的基因 ,对所获得的
基因进行分子生物信息学分析。结果:胃癌
与正常组织间差异表达的细胞周期和细胞
凋亡基因有 17 条 ,占芯片基因总数的
012 %。其中与细胞周期相关的基因 11 条 ,与细胞凋亡相关的基因 6 条。在胃癌组织
中表达量增加的 10 条 ,表达量下降的 7 条。
生物信息学分析显示 ,该 17 条差异表达的
细胞周期和细胞凋亡相关基因 ,与胃癌组织
细胞的生长和凋亡有关。结论:胃癌的发
生、 发展过程中存在多基因表达调控的改变,细胞周期和细胞凋亡基因与胃癌组织细胞的
生长和凋亡有相关性,对于该相关基因群的
进一步研究有助于阐释胃癌的发病机制。
中华肿瘤防治杂志,2007 ,14 (8) :569 - 572
[ ABSTRACT] OBJECTIVE: To analyze the functions of ex2
pressed genes related to cell cycle and apoptosis between gast ric
cancer and normal stomach tissue by cDNA microarray. METH 2
ODS : Total RNAs were respectively isolated f rom the gast ric canc2
er and normal stomach tissue , purified into mRNAs. Subsequently
they were reverse2t ranscribed into cDNAs incorporated with fluo2
rescent dCTP to make hybridization probes , which were hybridized
with the cDNA microarray for scanning of fluorescent signals and
differentially expressed genes between gast ric cancer and normal
stomach tissue. RESULTS : A total of 17 differentially expressed
genes were detected , accounting for 012 % of total genes. Among
these genes , 11 were related to cell cycle and the remaining 6 to
cell apoptosis. The number of up2regulated genes in the gast ric
cancer was 10 and that of the down2regulated 7. Bio2informative a2
nalysis showed that these 17 genes might influence the growth and
apoptosis of stomach cells in gast ric cancer . CONCLUSIONS : Dur2
ing the development of gast ric cancer , modulations of multi2gene
expression would undergo various changes. Cell cycle and apopto2
sis2related genes were related to the growth and apoptosis of stom2
ach cells in gast ric cancer . Further research into these genes will
clarify the mechanisms of gast ric cancer .
Chin J Cancer Prev Treat ,2007 ,14 (8) :569 - 572
【关键词】 胃肿瘤;基因表达;细胞周期;细胞凋亡
[ KEYWORDS] stomach neoplasms ; gene expression ; cell cycle arrest ; apoptosis
【中图分类号】 R730. 51 ; Q78 【文献标识码】 A 【文章编号】 1673 - 5269 (2007) 08 - 0569 - 04
【基金项目】 山东省自然科学基金( Y2005D07)
【第一作者简介】 马万山 ,男 ,山东宁津人 ,硕士 ,副主任技师 ,主要从事临床检验的研究工作。
Tel :86 - 531 - 82968900 - 2435 E2mail :ws_ma @126. com
【通讯作者简介】 汪运山 ,男 ,山东临沂人 ,主任医师 ,博士生导师 ,主要从事细胞和肿瘤免疫检测的研究工作。
E2mail : sdjnwys @163. com
· 965 · 中华肿瘤防治杂志2007 年4 月第14 卷第8 期 CHIN J CANCER PREV TREAT ,April 2007 ,Vol . 14 No. 8 胃癌的发生和发展是一个多因素的致病过程 ,正
常的上皮细胞转变成癌细胞需要经过多个阶段 ,涉及
到多种癌基因、 抑癌基因、 细胞周期和细胞凋亡基因等
变化的积累 ,以及基因的不稳定性等变化 ,但确切发病
机制未明。基因芯片( Gene chip)指将许多特定的寡
核苷酸或基因片段作为探针有规律地排列固定于支持
物上 ,样品 RNA 经同位素或荧光标志后进行杂交 ,应
用计算机系统对杂交信号检测分析 ,从而得出相应的
生物信息[1 ] ......
应用基因表达谱芯片研究人胃癌细胞周期和
细胞凋亡相关基因
马万山1
, 葛汝村2
, 高辉2
, 汪运山3
1.山东省千佛山医院检验科 ,山东 济南 250014
2.山东省交通医院中心实验室 ,山东 济南 250031
3.济南市中心医院检验科 ,山东 济南 250013
Microarray in screening for di fferentially expre ssed gene s of cellular cycle and apoptosis
in ga stric cancer
MA Wan2shan1
, GE Ru2cun2
, GAO Hui
2
, WA N G Yun2shan3
1. Cl inical L aboratory of S handong Province Qianf oshan Hos pi tal , J inan 250014 , P. R. China
2. Cent ral L ab of S handong Province T raf f ic Hos pi tal , J i nan 250031 , P. R. China
3. Cl inical L aboratory of J inan Cent ral Hos pi tal , J inan 250013 , P. R. China
【摘要】 目的:筛选胃癌发生过程中与正常
组织差异表达的细胞周期和细胞凋亡相关
基因并作初步功能分析。方法:应用 Trizol
一步法抽提胃癌及正常组织总 RNA ,分离
纯化 mRNA 并 逆 转 录 合 成 荧 光 分 子
(Cy3/ Cy5)标记 cDNA 探针 ,与含有 8 464
种cDNA 基因的表达谱芯片杂交 ,分析胃癌
与正常组织间差异表达的基因 ,对所获得的
基因进行分子生物信息学分析。结果:胃癌
与正常组织间差异表达的细胞周期和细胞
凋亡基因有 17 条 ,占芯片基因总数的
012 %。其中与细胞周期相关的基因 11 条 ,与细胞凋亡相关的基因 6 条。在胃癌组织
中表达量增加的 10 条 ,表达量下降的 7 条。
生物信息学分析显示 ,该 17 条差异表达的
细胞周期和细胞凋亡相关基因 ,与胃癌组织
细胞的生长和凋亡有关。结论:胃癌的发
生、 发展过程中存在多基因表达调控的改变,细胞周期和细胞凋亡基因与胃癌组织细胞的
生长和凋亡有相关性,对于该相关基因群的
进一步研究有助于阐释胃癌的发病机制。
中华肿瘤防治杂志,2007 ,14 (8) :569 - 572
[ ABSTRACT] OBJECTIVE: To analyze the functions of ex2
pressed genes related to cell cycle and apoptosis between gast ric
cancer and normal stomach tissue by cDNA microarray. METH 2
ODS : Total RNAs were respectively isolated f rom the gast ric canc2
er and normal stomach tissue , purified into mRNAs. Subsequently
they were reverse2t ranscribed into cDNAs incorporated with fluo2
rescent dCTP to make hybridization probes , which were hybridized
with the cDNA microarray for scanning of fluorescent signals and
differentially expressed genes between gast ric cancer and normal
stomach tissue. RESULTS : A total of 17 differentially expressed
genes were detected , accounting for 012 % of total genes. Among
these genes , 11 were related to cell cycle and the remaining 6 to
cell apoptosis. The number of up2regulated genes in the gast ric
cancer was 10 and that of the down2regulated 7. Bio2informative a2
nalysis showed that these 17 genes might influence the growth and
apoptosis of stomach cells in gast ric cancer . CONCLUSIONS : Dur2
ing the development of gast ric cancer , modulations of multi2gene
expression would undergo various changes. Cell cycle and apopto2
sis2related genes were related to the growth and apoptosis of stom2
ach cells in gast ric cancer . Further research into these genes will
clarify the mechanisms of gast ric cancer .
Chin J Cancer Prev Treat ,2007 ,14 (8) :569 - 572
【关键词】 胃肿瘤;基因表达;细胞周期;细胞凋亡
[ KEYWORDS] stomach neoplasms ; gene expression ; cell cycle arrest ; apoptosis
【中图分类号】 R730. 51 ; Q78 【文献标识码】 A 【文章编号】 1673 - 5269 (2007) 08 - 0569 - 04
【基金项目】 山东省自然科学基金( Y2005D07)
【第一作者简介】 马万山 ,男 ,山东宁津人 ,硕士 ,副主任技师 ,主要从事临床检验的研究工作。
Tel :86 - 531 - 82968900 - 2435 E2mail :ws_ma @126. com
【通讯作者简介】 汪运山 ,男 ,山东临沂人 ,主任医师 ,博士生导师 ,主要从事细胞和肿瘤免疫检测的研究工作。
E2mail : sdjnwys @163. com
· 965 · 中华肿瘤防治杂志2007 年4 月第14 卷第8 期 CHIN J CANCER PREV TREAT ,April 2007 ,Vol . 14 No. 8 胃癌的发生和发展是一个多因素的致病过程 ,正
常的上皮细胞转变成癌细胞需要经过多个阶段 ,涉及
到多种癌基因、 抑癌基因、 细胞周期和细胞凋亡基因等
变化的积累 ,以及基因的不稳定性等变化 ,但确切发病
机制未明。基因芯片( Gene chip)指将许多特定的寡
核苷酸或基因片段作为探针有规律地排列固定于支持
物上 ,样品 RNA 经同位素或荧光标志后进行杂交 ,应
用计算机系统对杂交信号检测分析 ,从而得出相应的
生物信息[1 ] ......
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