阴阳除用来阐释杂病总病机外，尚有其他许多重要作用，在《金匮要略》中阴阳描述可见一斑。

    掌控发病 如湿邪伤于腰以下的肌肉、关节时，因湿为阴邪，又腰以下属阴，故常从阴治；同样寒邪中于体内，因寒为阴邪，体内为阴，也常从阴治。雾邪伤于人体上部、皮肤腠理，因雾为阳邪，上部及皮肤腠理属阳，故常从阳治；风邪伤于体表，因风为阳邪，体表属阳，故常从阳治。“极寒伤经”，因寒、经俱属阴。这高度概括了湿、寒、雾、风等四邪中人的发病规律。故对于腰以下的疾病即使脉舌无湿、寒之征，在处方用药时往往稍佐利湿、散寒之品；同样对于腰以上的疾病即令没有风邪，没有上肢及头部的摇动，也没有轻微头重的症状 ......