□周东浩

    编者按

    科学技术的进步和医学思维模式的创新，促使人们对疾病的发生、发展规律有了更加深入的认识。系统医学是一种新的医学思维模式，它将无数看似纷繁复杂的医学数据、资源和信息加以整合，并予以充分拓展和合理应用。近年来，系统医学得到了迅猛的发展，如美国国立卫生研究院(NIH)制定了通向医学生物学未来的NIH研究路线图(NIH roadmap)，强调未来的主要目标是进行复杂生命系统的“大科学”系统研究。本报在此刊登周东浩的文章，以让读者进一步了解系统医学和系统生物学。

    随着还原论的现代医学从器官、细胞、基因乃至分子一步步解析研究的深入，20世纪的生物学也经历了从宏观到微观的不断发展过程。然而人们在为医学科技飞速发展取得的成就不断感到欢欣鼓舞的同时，面对海量的研究数据以及现代医学的实际困境，迷惑和疑问也与日俱增——人们曾经寄予厚望的基因研究并没有能够真正解开疾病的奥秘，分析和还原的研究思路正在受到越来越多的质疑。此时，系统生物学作为对现代还原的一个“反动”诞生了，很快受到了各国科学家的重视，成为目前西医的一个前沿学科。

    本文通过讨论系统生物学和笔者所倡导的系统医学的区别，以求对系统医学的概念和方法、内容能有更加确切了解。

    “从下到上”的系统生物学

    和“从上到下”的系统医学

    系统医学和系统生物学虽然都是以系统命名的，都以系统论的原则方法为指导，但两者却也存在着明显的区别，根据系统生物学创始人胡德的定义，系统生物学是研究一个生物系统中所有组成成分(基因、mRNA、蛋白质等)的构成，以及在特定条件下这些组分间的相互关系的学科。也就是说，系统生物学不同于以往的还原生物学——仅关心个别的基因和蛋白质，它更加关注的是基因和基因之间、基因和蛋白质之间以及蛋白质和蛋白质之间等要素之间的相互关系，试图从相互关系着手，通过计算机仿真 ......