骨髓移植配型中组织相容性抗原Ⅱ类基因PCR-SSP分型技术的应用
作者:聂向民 王 潍 徐 群 张世训
单位:山东省血液中心(250014)
关键词:
实用医学杂志991026 组织相容性抗原(HLA)Ⅱ类基因是位于人类第6对染色体短臂远端的一组高度多态的基因,主要包括HLA-DR、DQ、DP三个亚区[1]。骨髓移植现已被接受作为治疗血液系统恶性疾病,骨髓衰竭,某些遗传病及免疫缺陷的手段。对于慢性粒细胞性白血病(CML)患者,继大剂量化疗后采用骨髓移植可使50%~70%病例治愈[2]。HLAⅡ类基因配型对提高异基因骨髓移植存活率,减少移植物抗宿主疾病(GVHD),具有重要意义[3]。既往HLAⅡ类分型采用血清学微量淋巴细胞毒试验,近年国外实验室已转向基因分型,并已将其列为常规。我们采用序列特异性引物(SSP)PCR技术对HLA-DRB1,DQB1进行基因分型,快速简便,现报告如下。
, 百拇医药
1 材料与方法
1.1 样本 山东医科大学附属医院提供22名拟行骨髓移植的恶性血液病患者及其相关供者样本。
1.2 DNA提取 抽取静脉血1ml,EDTA抗凝,2000×g离心取白膜层加入红细胞裂解液(NH4Cl6.35g/L,EDTA1.33g/L,Tris0.92g/L),充分裂解红细胞,离心弃上清液,取白细胞沉淀加入蛋白酶K(10g/L)25μl,7.5M盐酸胍200μl,10%十二烷基硫酸钠(SDS)200 μl,双蒸水200μ l,70℃震荡水浴20分钟,高速离心,取上清液,加入2.5倍体积预冷无水乙醇沉淀DNA,溶于pH8.0TE溶液中备用。
1.3 引物 扩增引物由北京市血液中心提供,包括17对DRB1引物及5对DQB1引物,相应扩增检定17种DR基因型及5种DQ基因型,可识别:DRB1*01,DRB1*15,DRB1*16,DRB1*03,DRB1*04,DRB1*11,DRB1*12,DRB1*07,DRB1*08,DRB1*09,DRB1*10,DRB1*13a,DRB1*13b,DRB1*14a,DRB1*14b,DRB3,DRB4及DQB1*0201,DQB1*03,DQB1*04,DQB1*05,DQB1*06。
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1.4 扩增 美国PE公司2400基因扩增仪。扩增体系25μl,包括10×PCR扩增缓冲液2.5μl,25mMMgCl21.5μl,2mM 10×dNTPs 2.5 μl,模板DNA 100 ng,TaqDNA聚合酶1u(美国Promega公司)。PCR扩增程序为:94℃预变性2分钟进入PCR循环:94℃40秒,64℃40秒,72℃40秒,35个循环后继续延伸2分钟,降温至5℃。
1.5 结果分析 以1.5%琼脂糖凝胶(含0.5μg/ml溴乙锭),0.5×TBE电泳缓冲液电泳,302nm波长紫外线透射仪下显示扩增条带。
2 结果
22例骨髓移植供受者HLA-DR,DQ基因分型结果见表1。
表1 22例骨髓移植供受者HLA-DR、DQ基因分型结果 样本
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PCR-SSP扩增分型
扩增片段长度(bP)
血清学特异性
患者1
DRB1*04,DRB1*07,DRB4
269,233,222,DR4,DR7
DQB1*0201,DQB1*03
214,79
DQ2,DQ3
供者1
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DRB1*04,DRB1*09,DRB4
269,180,222
DR4,DR9
DQB1*03
79
DQ3
患者2
DRB1*11,DRB1*15,DRB3
177,205,240
DR11,DR15
, http://www.100md.com
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
供者2
DRB1*14a,DRB1*15,DRB3
210,205,240
DR14,DR15
DQB1*05,DQB1*06
225,81
DQ5,DQ6
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患者3
DRB1*09,DRB1*15,DRB4
180,205,222
DR9,DR15
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
供者3
DRB1*04,DRB1*11,DRB3,DRB4
269,177,240,222
, 百拇医药
DR4,DR11
DQB1*03
79
DQ3
患者4
DRB1*08,DRB1*13a,DRB3
222,137,240
DR8,DR13
DQB1*06
81
DQ6
, 百拇医药
供者4
DRB1*08,DRB1*11,DRB3
222,177,240
DR8,DR11
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
患者5
DRB1*04,DRB1*15,DRB4
269,205,222
, http://www.100md.com
DR4,DR15
DQB1*04,DQB1*06
192,81
DQ4,DQ6
供者5-1
DRB1*04,DRB1*11,DRB3,DRB4
269,177,240,222
DR4,DR11
DQB1*03,DQB1*04
79,192
, http://www.100md.com
DQ3,DQ4
供者5-2
DRB1*09,DRB1*15,DRB4
180,205,222
DR9,DR15
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
患者6
DRB1*09,DRB1*10,DRB4
, 百拇医药
180,213,222
DR9,DR10
DQB1*03,DQB1*05
79,225
DQ3,DQ5
供者6
DRB1*10,DRB1*12,DRB3
213,110,240
DR10,DR12
DQB1*05,DQB1*03
, 百拇医药
225,79
DQ3,DQ5
患者7
DRB1*04,DRB1*09,DRB4
269,180,222
DR4,DR9
DQB1*03
79
DQ3
供者7-1
DRB1*10,DRB1*12,DRB3
, 百拇医药
213,110,240
DR10,DR12
DQB1*03,DQB1*05
79,225
DQ3,DQ5
供者7-2
DRB1*09,DRB1*10,DRB4
180,213,222
DR9,DR10
DQB1*03,DQB1*05
, http://www.100md.com
79,225
DQ3,DQ5
患者8
DRB1*11,DRB1*15,DRB3
177,205,240
DR11,DR15
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
供者8
DRB1*11,DRB1*15,DRB3
, 百拇医药
177,205,240
DR11,DR15
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
患者9
DRB1*09,DRB1*14a,DRB3,DRB4
180,210,240,222
DR9,DR14
DQB1*03,DQB1*05
, 百拇医药
79,225
DQ3,DQ5
供者9
DRB1*09,DRB1*14a,DRB3,DRB4
180,210,240,222
DR9,DR14
DQB1*03,DQB1*05
79,225
DQ3,DQ5
患者10
, 百拇医药 DRB1*04,DRB1*15,DRB4
269,205,222
DR4,DR15
DQB1*04,DQB1*06
192,81
DQ4,DQ6
供者10
DRB1*04,DRB1*07,DRB4
269,233,222
DR4,DR7
, 百拇医药
DQB1*04,DQB1*0201
192,214
DQ4,DQ2
3 讨论
HLA基因位于人类第6号染色体短臂6P23.1片断上。DR区有1个功能性α链基因(2个等位基因)及4个功能性β链基因DRB1,BRB3,DRB4和DRB5,4个功能性β链基因是全部血清学特异性(DR1~DR18,DR52,DR53)的基因密码[4]。HLA-DQ区有2个DQA基因和3个DQB基因(DQB1,DQB2和DQB3)。其中DQA1和DQB1为结构基因,DQ的表型是由DQB1决定的[5]。
器官移植配型中重要的是了解供、受者之间的HLA基因型是否相合。既往配型采用血清学定型分析,由于高质量的Ⅱ类定型血清来源困难,存在交叉反应,而且血清学相同者基因型不一定相同,导致比较高的分型错误率[6]。与其比较,PCR-SSP具有特异性高的特点,避免了杂交、酶切等步骤。整个过程3~4小时即可完成,是血清学和其它PCR基础上的基因分型方法难以比拟的。在以上分型标本中,患者8,患者9与其供者DR,DQ基因分型全相同,其中,患者8成功地进行了骨髓移植,移植后情况良好,未出现严重移植物抗宿主病。
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4 参考文献
1 刘红雨.HLA-Ⅱ类基因表达的上游调节.国外医学输血及血液学分册,1997,20(3):162.
2 Clift RA,Appelbaum FR,Thomos ED. Treatment of chronic myeloid leuke mia by marrow transplantation. Blood,1993,82(7):1954~1956.
3 Stroneck DF. Results of bone marrow transplant from unrelated donor . Transfusion,1992,32:180~189.
4 Marsh SG. HLA class Ⅱ nucleotide sequences. Human Immunol,1992,35( 1):21.
5 Marsh SG. Bodmer JG. HLA class Ⅱ region nucleotide sequence. Tissu e Antigens,1995,46:258~280.
6 Willem V,Ilias IN,Anholts J. Biotinylated DRB sequence -specific
oligonucleotides comparision to serologic HLA-DR typing of o rgan donors in eurotransplant. Human Immunol,1993,37:59., http://www.100md.com
单位:山东省血液中心(250014)
关键词:
实用医学杂志991026 组织相容性抗原(HLA)Ⅱ类基因是位于人类第6对染色体短臂远端的一组高度多态的基因,主要包括HLA-DR、DQ、DP三个亚区[1]。骨髓移植现已被接受作为治疗血液系统恶性疾病,骨髓衰竭,某些遗传病及免疫缺陷的手段。对于慢性粒细胞性白血病(CML)患者,继大剂量化疗后采用骨髓移植可使50%~70%病例治愈[2]。HLAⅡ类基因配型对提高异基因骨髓移植存活率,减少移植物抗宿主疾病(GVHD),具有重要意义[3]。既往HLAⅡ类分型采用血清学微量淋巴细胞毒试验,近年国外实验室已转向基因分型,并已将其列为常规。我们采用序列特异性引物(SSP)PCR技术对HLA-DRB1,DQB1进行基因分型,快速简便,现报告如下。
, 百拇医药
1 材料与方法
1.1 样本 山东医科大学附属医院提供22名拟行骨髓移植的恶性血液病患者及其相关供者样本。
1.2 DNA提取 抽取静脉血1ml,EDTA抗凝,2000×g离心取白膜层加入红细胞裂解液(NH4Cl6.35g/L,EDTA1.33g/L,Tris0.92g/L),充分裂解红细胞,离心弃上清液,取白细胞沉淀加入蛋白酶K(10g/L)25μl,7.5M盐酸胍200μl,10%十二烷基硫酸钠(SDS)200 μl,双蒸水200μ l,70℃震荡水浴20分钟,高速离心,取上清液,加入2.5倍体积预冷无水乙醇沉淀DNA,溶于pH8.0TE溶液中备用。
1.3 引物 扩增引物由北京市血液中心提供,包括17对DRB1引物及5对DQB1引物,相应扩增检定17种DR基因型及5种DQ基因型,可识别:DRB1*01,DRB1*15,DRB1*16,DRB1*03,DRB1*04,DRB1*11,DRB1*12,DRB1*07,DRB1*08,DRB1*09,DRB1*10,DRB1*13a,DRB1*13b,DRB1*14a,DRB1*14b,DRB3,DRB4及DQB1*0201,DQB1*03,DQB1*04,DQB1*05,DQB1*06。
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1.4 扩增 美国PE公司2400基因扩增仪。扩增体系25μl,包括10×PCR扩增缓冲液2.5μl,25mMMgCl21.5μl,2mM 10×dNTPs 2.5 μl,模板DNA 100 ng,TaqDNA聚合酶1u(美国Promega公司)。PCR扩增程序为:94℃预变性2分钟进入PCR循环:94℃40秒,64℃40秒,72℃40秒,35个循环后继续延伸2分钟,降温至5℃。
1.5 结果分析 以1.5%琼脂糖凝胶(含0.5μg/ml溴乙锭),0.5×TBE电泳缓冲液电泳,302nm波长紫外线透射仪下显示扩增条带。
2 结果
22例骨髓移植供受者HLA-DR,DQ基因分型结果见表1。
表1 22例骨髓移植供受者HLA-DR、DQ基因分型结果 样本
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PCR-SSP扩增分型
扩增片段长度(bP)
血清学特异性
患者1
DRB1*04,DRB1*07,DRB4
269,233,222,DR4,DR7
DQB1*0201,DQB1*03
214,79
DQ2,DQ3
供者1
, http://www.100md.com
DRB1*04,DRB1*09,DRB4
269,180,222
DR4,DR9
DQB1*03
79
DQ3
患者2
DRB1*11,DRB1*15,DRB3
177,205,240
DR11,DR15
, http://www.100md.com
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
供者2
DRB1*14a,DRB1*15,DRB3
210,205,240
DR14,DR15
DQB1*05,DQB1*06
225,81
DQ5,DQ6
, http://www.100md.com
患者3
DRB1*09,DRB1*15,DRB4
180,205,222
DR9,DR15
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
供者3
DRB1*04,DRB1*11,DRB3,DRB4
269,177,240,222
, 百拇医药
DR4,DR11
DQB1*03
79
DQ3
患者4
DRB1*08,DRB1*13a,DRB3
222,137,240
DR8,DR13
DQB1*06
81
DQ6
, 百拇医药
供者4
DRB1*08,DRB1*11,DRB3
222,177,240
DR8,DR11
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
患者5
DRB1*04,DRB1*15,DRB4
269,205,222
, http://www.100md.com
DR4,DR15
DQB1*04,DQB1*06
192,81
DQ4,DQ6
供者5-1
DRB1*04,DRB1*11,DRB3,DRB4
269,177,240,222
DR4,DR11
DQB1*03,DQB1*04
79,192
, http://www.100md.com
DQ3,DQ4
供者5-2
DRB1*09,DRB1*15,DRB4
180,205,222
DR9,DR15
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
患者6
DRB1*09,DRB1*10,DRB4
, 百拇医药
180,213,222
DR9,DR10
DQB1*03,DQB1*05
79,225
DQ3,DQ5
供者6
DRB1*10,DRB1*12,DRB3
213,110,240
DR10,DR12
DQB1*05,DQB1*03
, 百拇医药
225,79
DQ3,DQ5
患者7
DRB1*04,DRB1*09,DRB4
269,180,222
DR4,DR9
DQB1*03
79
DQ3
供者7-1
DRB1*10,DRB1*12,DRB3
, 百拇医药
213,110,240
DR10,DR12
DQB1*03,DQB1*05
79,225
DQ3,DQ5
供者7-2
DRB1*09,DRB1*10,DRB4
180,213,222
DR9,DR10
DQB1*03,DQB1*05
, http://www.100md.com
79,225
DQ3,DQ5
患者8
DRB1*11,DRB1*15,DRB3
177,205,240
DR11,DR15
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
供者8
DRB1*11,DRB1*15,DRB3
, 百拇医药
177,205,240
DR11,DR15
DQB1*03,DQB1*06
79,81
DQ3,DQ6
患者9
DRB1*09,DRB1*14a,DRB3,DRB4
180,210,240,222
DR9,DR14
DQB1*03,DQB1*05
, 百拇医药
79,225
DQ3,DQ5
供者9
DRB1*09,DRB1*14a,DRB3,DRB4
180,210,240,222
DR9,DR14
DQB1*03,DQB1*05
79,225
DQ3,DQ5
患者10
, 百拇医药 DRB1*04,DRB1*15,DRB4
269,205,222
DR4,DR15
DQB1*04,DQB1*06
192,81
DQ4,DQ6
供者10
DRB1*04,DRB1*07,DRB4
269,233,222
DR4,DR7
, 百拇医药
DQB1*04,DQB1*0201
192,214
DQ4,DQ2
3 讨论
HLA基因位于人类第6号染色体短臂6P23.1片断上。DR区有1个功能性α链基因(2个等位基因)及4个功能性β链基因DRB1,BRB3,DRB4和DRB5,4个功能性β链基因是全部血清学特异性(DR1~DR18,DR52,DR53)的基因密码[4]。HLA-DQ区有2个DQA基因和3个DQB基因(DQB1,DQB2和DQB3)。其中DQA1和DQB1为结构基因,DQ的表型是由DQB1决定的[5]。
器官移植配型中重要的是了解供、受者之间的HLA基因型是否相合。既往配型采用血清学定型分析,由于高质量的Ⅱ类定型血清来源困难,存在交叉反应,而且血清学相同者基因型不一定相同,导致比较高的分型错误率[6]。与其比较,PCR-SSP具有特异性高的特点,避免了杂交、酶切等步骤。整个过程3~4小时即可完成,是血清学和其它PCR基础上的基因分型方法难以比拟的。在以上分型标本中,患者8,患者9与其供者DR,DQ基因分型全相同,其中,患者8成功地进行了骨髓移植,移植后情况良好,未出现严重移植物抗宿主病。
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4 参考文献
1 刘红雨.HLA-Ⅱ类基因表达的上游调节.国外医学输血及血液学分册,1997,20(3):162.
2 Clift RA,Appelbaum FR,Thomos ED. Treatment of chronic myeloid leuke mia by marrow transplantation. Blood,1993,82(7):1954~1956.
3 Stroneck DF. Results of bone marrow transplant from unrelated donor . Transfusion,1992,32:180~189.
4 Marsh SG. HLA class Ⅱ nucleotide sequences. Human Immunol,1992,35( 1):21.
5 Marsh SG. Bodmer JG. HLA class Ⅱ region nucleotide sequence. Tissu e Antigens,1995,46:258~280.
6 Willem V,Ilias IN,Anholts J. Biotinylated DRB sequence -specific
oligonucleotides comparision to serologic HLA-DR typing of o rgan donors in eurotransplant. Human Immunol,1993,37:59., http://www.100md.com