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基因芯片技术在白血病研究中的应用
http://www.100md.com 2003年2月27日 《中国医学论坛报》 2003年第8期
     肿瘤的发生是多基因、多步骤的过程。要想确切了解肿瘤的发病机制,寻找更有效的治疗方法,过去所采用的以一个或几个基因为目标的研究方法已不适合了,基因芯片技术的出现为这一问题提供了有效的解决方法。

    基础研究

    在肿瘤发病机制的研究中,基因芯片技术为识别出与肿瘤发生密切相关的基因、了解各基因之间复杂的关系提供了强有力的手段。Shimada等利用芯片技术,分析了异位表达AML1-ETO融合基因的鼠粒祖细胞系L-G的6500个基因的表达情况,识别出32个候选基因,其中23个基因过去并不知道受到AML1-ETO的调节。AML1-ETO能提高许多与粒细胞分化有关的基因的表达,特别是编码嗜天青颗粒蛋白的基因,如组织蛋白酶G、髓过氧化物酶、溶菌酶等。这就为携带AML1-ETO融合基因的AML发病机制研究开辟了新的领域。

    临床应用

    基因芯片技术在临床工作中也显示出光明前景。如果能从基因表达图中提取有用的信息,进行肿瘤的临床诊断和细致分型,将对肿瘤的诊断和治疗提供巨大帮助。Yeoh等利用含有1.26万个基因探针的寡核苷酸芯片分析了360例儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)标本,识别出6个主要的白血病亚型:T-ALL、BCR-ABL+

    ALL、E2A-PBX1+

    ALL、TEL-AML1+

    ALL、MLL重排+ ALL和超二倍体且2n>50的ALL,而上述白血病亚型在临床治疗中确实显示出突出的反应特点。人们还发现有14个标本具有独特的基因表达图,可能属于某些尚未确定的新亚型。同时,通过分析初诊及复发时的基因表达图,在每种白血病亚型都获得了预示复发或发生治疗相关急性粒细胞白血病(AML)的独特表达图,准确率达到或接近100%。

    基因芯片技术目前仍不完善,例如没有一种芯片能够包含所有人类基因,还未出现专门针对某一特定肿瘤或疾病的芯片。同时,该技术尚未成熟到在临床工作中广泛应用的程度,许多芯片中没有包含与药物的治疗效果和毒副反应有关的基因,还未能充分与蛋白质组学、蛋白质芯片技术相结合。但随着后基因组计划的开展,它必将逐渐成熟完善,并引导肿瘤的治疗和研究进入一个全新的时代,最终造福于人类健康。

    背景资料

    基因芯片(Gene Chip)就是利用点样机等机械装置,在玻璃等支持物表面整齐地点上高密度的、成千上万个“点”,每个“点”含有可与一种基因或表达序列标签(EST)杂交的一条或几条DNA探针。由于芯片上有序地排列着DNA探针,因此也被称为微阵列(Microarray)。在芯片上滴加样品后,在合适的条件下,样品中含有的各种核酸片段(cDNA或cRNA)就与相应的探针杂交。由于核酸片段上已标记有荧光素,激发后产生的荧光强度就与样品中所含有的相应核酸片段的量成正比,也就代表该基因的表达量。经激光共聚焦扫描仪等装置扫描后,所获得的信息经专用软件分析处理,即可获得成千上万种基因的表达情况。正因为这种特点,基因芯片技术已成为当前肿瘤研究的热点。, 百拇医药(北京儿童医院 胡亚美 李志刚)