让基因组序列更完美的技术
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2003年4月21日
美国黛那法柏癌症研究所(Dana-Farber Cancer Institute)的研究人员已经成功的使用一种自行设计的基因拼凑技术，完成了一个目前为止最清楚的动物——线虫(Caenorhabditis elegans)基因图谱。科学家们相信这项技术也能使现今有点模糊的人类基因组更加的精细。
该研究报告刊登在最新一期的《自然基因学》(Nature Genetics)期刊上。这项研究报告详细的记载了定位、鉴定将近19000个线虫基因的过程。该研究机构的Marc Vidal博士表示，几年前利用计算机程序所完成的人类基因组定序，其中仍有许多基因结构和位置是不清不楚的。事实上，我们不晓得大部分的基因开始和结束的确切位置。而且在组成基因的区块中仍有许多漏洞(gaps)。
Vidal博士强调“在预测的30000个人类基因中，只有大约5000个是已经有明确定义的。”在这项研究中，研究人员抽取线虫细胞的RNA并反转录放大成互补DNA(cDNAs)，由此找出真正制造出蛋白质的开放阅读序列(open reading frames，ORFs)。之后将这些大约19000个基因序列与之前已经定序完成的线虫基因组序列进行比对。结果他们发现，之前定序完成的预测基因中有56%与他们所分离出来的真实基因不吻合。这项结果证实了，即使是比人类基因组还清楚的线虫基因组都还有许多缺失需要修正。此外，这项技术还能用在新兴的研究领域——蛋白质组学(proteomics)并且能解决有些蛋白质在细胞中数量太少，无法研究的窘境。, 百拇医药
该研究报告刊登在最新一期的《自然基因学》(Nature Genetics)期刊上。这项研究报告详细的记载了定位、鉴定将近19000个线虫基因的过程。该研究机构的Marc Vidal博士表示，几年前利用计算机程序所完成的人类基因组定序，其中仍有许多基因结构和位置是不清不楚的。事实上，我们不晓得大部分的基因开始和结束的确切位置。而且在组成基因的区块中仍有许多漏洞(gaps)。
Vidal博士强调“在预测的30000个人类基因中，只有大约5000个是已经有明确定义的。”在这项研究中，研究人员抽取线虫细胞的RNA并反转录放大成互补DNA(cDNAs)，由此找出真正制造出蛋白质的开放阅读序列(open reading frames，ORFs)。之后将这些大约19000个基因序列与之前已经定序完成的线虫基因组序列进行比对。结果他们发现，之前定序完成的预测基因中有56%与他们所分离出来的真实基因不吻合。这项结果证实了，即使是比人类基因组还清楚的线虫基因组都还有许多缺失需要修正。此外，这项技术还能用在新兴的研究领域——蛋白质组学(proteomics)并且能解决有些蛋白质在细胞中数量太少，无法研究的窘境。, 百拇医药