预测肝癌术后复发可用基因芯片
本报讯 日本Yamaguchi大学Norio等利用寡核苷酸微阵列技术建立了一套预测肝癌根治术后早期复发的新系统,该系统的预测价值比基于SVM(Support Vector Machine)的系统更准确。(Lancet 2003,361∶923)
传统方法预测术后肿瘤复发有很多局限性,另外肝癌本身具有高度异质性,也限制了传统方法的预测价值。
Norio等应用包含6000条基因的高密度寡核苷酸微阵列对33例肝细胞癌患者(研究组)手术切除标本的mRNA表达谱进行了分析,并以此为基础利用SSPR方法(Statisticak Pattern Recognition)建立了一个由12条基因组成的肝癌复发预测系统。然后,研究者又重新收集27例患者的资料作为设盲组,同时利用该系统和另一个基于SVM的预测系统对这组患者术后肝癌复发情况进行预测,比较这两个系统的预测效果。
结果显示,根治性切除术后1年内,研究组和设盲组分别有12例(36%)及8例(30%)患者肝内肿瘤复发。新的预测系统准确预测了设盲组93%(25/27例)患者的复发情况,阳性预测值为88%,阴性预测值为95%;而基于SVM的预测系统仅能准确预测60%(16/27例)患者的复发情况,阳性预测值和阴性预测值分别为38%和79%。, http://www.100md.com
传统方法预测术后肿瘤复发有很多局限性,另外肝癌本身具有高度异质性,也限制了传统方法的预测价值。
Norio等应用包含6000条基因的高密度寡核苷酸微阵列对33例肝细胞癌患者(研究组)手术切除标本的mRNA表达谱进行了分析,并以此为基础利用SSPR方法(Statisticak Pattern Recognition)建立了一个由12条基因组成的肝癌复发预测系统。然后,研究者又重新收集27例患者的资料作为设盲组,同时利用该系统和另一个基于SVM的预测系统对这组患者术后肝癌复发情况进行预测,比较这两个系统的预测效果。
结果显示,根治性切除术后1年内,研究组和设盲组分别有12例(36%)及8例(30%)患者肝内肿瘤复发。新的预测系统准确预测了设盲组93%(25/27例)患者的复发情况,阳性预测值为88%,阴性预测值为95%;而基于SVM的预测系统仅能准确预测60%(16/27例)患者的复发情况,阳性预测值和阴性预测值分别为38%和79%。, http://www.100md.com