细胞培养仍是检查沙眼衣原体的金标准。但费用高，技术难度大，难以在临床广泛应用。因此非培养诊断试验是近年来的研究热点，最先应用的是抗原检测法，一般为衣原体脂多糖(LPS)及外膜主蛋白(MOMP)；检查生殖器标本中衣原体的原体，应用较多的是DFA和酶免疫检查(EIA)。
LCR和PCR是新近开发的沙眼衣原体核酸扩增检查法，检查的是沙眼衣原体质粒的核苷酸序列，用于子宫颈以及男子尿道和尿标本的检查，敏感性保持在99%以上。转录扩增法(TMA)，扩增衣原体核糖体RNA，检测的则是核糖体RNA序列 ......
LCR和PCR是新近开发的沙眼衣原体核酸扩增检查法，检查的是沙眼衣原体质粒的核苷酸序列，用于子宫颈以及男子尿道和尿标本的检查，敏感性保持在99%以上。转录扩增法(TMA)，扩增衣原体核糖体RNA，检测的则是核糖体RNA序列 ......