为全面贯彻实施《药品管理法》和《药品管理法实施条例》等法律法规及有关规定，落实食品药品放心工程的各项工作，新疆维吾尔自治区药品监管局自2003年12月开始，对全区医疗机构配制的制剂品种开展清理整顿和统一换发制剂批准文号工作。该局根据《药品管理法》和《药品管理法实施条例》的有关规定，结合自治区实际，制定了比较周密的工作计划、科学规范的工作措施和合理的工作程序，并执行政务公开。通过全区各地、州、市药品监管局和持有《医疗机构制剂许可证》的各级医疗机构积极配合与扎实工作，目前，这项工作正在有序进行，自治区人民医院、新疆医科大学第二附属医院和自治区维吾尔医院等医疗机构制剂通过了审核，共有101个品种第一批换发了新的制剂批准文号。
这次清理整顿工作重点是，一些医疗机构存在的制剂无质量标准、不按制剂标准配制和检验、制剂批准文号混乱，特别是管理松散等等；此外，对每个制剂品种建立完整、规范的质量档案，进入数字化管理系统，以达到配置、使用、管理有据和监督有效的目的。
这次清理整顿工作重点是，一些医疗机构存在的制剂无质量标准、不按制剂标准配制和检验、制剂批准文号混乱，特别是管理松散等等；此外，对每个制剂品种建立完整、规范的质量档案，进入数字化管理系统，以达到配置、使用、管理有据和监督有效的目的。