科学家发现“鸟枪法”DNA测序存在缺陷
新华网伦敦10月20日电(记者曹丽君)英国《新科学家》杂志网站20日报道,美国科学家通过研究发现,目前通常用于大片段脱氧核糖核酸(DNA)测序的“鸟枪法”存在缺陷。
美国文特尔学会的3位科学家对“鸟枪法”进行了重新研究,其中两位曾经参与过该方法的开发。他们把利用“鸟枪法”绘制的人类基因组草图和“人类基因组计划”公布的最新草图进行了对比,发现“鸟枪法”无法测到人类基因组中重复出现的DNA片段,这些片段占到基因组的3%至5%,对于理解遗传性疾病具有重要意义。
负责此项研究的埃万·艾希勒在接受媒体采访时说,这个缺陷并不能抹杀“鸟枪法”的作用,在进行快速DNA测序时,“鸟枪法”仍然不失为一种可取的手段。最佳的DNA测序法是,将两种测序方法相结合:用“鸟枪法”进行整体测序,识别出“鸟枪法”无法测序的区域,再通过传统方法对这些区域测序。
“鸟枪法”是大名鼎鼎的美国塞莱拉遗传公司创始人克雷格·文特尔发明的,它是目前常用的两种DNA测序法中较为快捷的一种。传统的DNA测序法要通过基因方法将DNA片段放大,并在克隆的细菌中对其测序,其过程繁琐复杂。“鸟枪法”则简单地将DNA片段打乱,然后通过强大的计算机运算方法对其进行排序。2000年塞莱拉公司和国际合作项目“人类基因组计划”分别通过这两种方法绘制出人类基因组草图。, http://www.100md.com
美国文特尔学会的3位科学家对“鸟枪法”进行了重新研究,其中两位曾经参与过该方法的开发。他们把利用“鸟枪法”绘制的人类基因组草图和“人类基因组计划”公布的最新草图进行了对比,发现“鸟枪法”无法测到人类基因组中重复出现的DNA片段,这些片段占到基因组的3%至5%,对于理解遗传性疾病具有重要意义。
负责此项研究的埃万·艾希勒在接受媒体采访时说,这个缺陷并不能抹杀“鸟枪法”的作用,在进行快速DNA测序时,“鸟枪法”仍然不失为一种可取的手段。最佳的DNA测序法是,将两种测序方法相结合:用“鸟枪法”进行整体测序,识别出“鸟枪法”无法测序的区域,再通过传统方法对这些区域测序。
“鸟枪法”是大名鼎鼎的美国塞莱拉遗传公司创始人克雷格·文特尔发明的,它是目前常用的两种DNA测序法中较为快捷的一种。传统的DNA测序法要通过基因方法将DNA片段放大,并在克隆的细菌中对其测序,其过程繁琐复杂。“鸟枪法”则简单地将DNA片段打乱,然后通过强大的计算机运算方法对其进行排序。2000年塞莱拉公司和国际合作项目“人类基因组计划”分别通过这两种方法绘制出人类基因组草图。, http://www.100md.com