西藏藏医学基本理论的依据是稀奇罕有的《四部医典》，此典中记载了详细的藏医理论，可是因篇幅有限，只能简单地介绍理论要点。人体无病期间维持的三大因素，七种物质包括乳糜、血、肉、脂、骨、髓和精，它们均可在赤巴产生的热能作用下，渐变成“精华”，“精华”散布全身，使人发育成长，保持健康。三种排泄物包括粪便、尿和汗，可以通过它们将体内的废物排出体外。特别是藏医对胚胎发育过程的论述很细致，指出当男女同房时，男子精液进入子宫同女子经血混合即可受孕，孕期三十八周。精液是人体中最上等的精华，它产于睾丸，功能遍布全身，使人容光焕发、健康长寿。三大因素中的隆是气，聚集在脑髓、心肺和骨骼里，主管呼吸、循环、感觉、运动；赤巴是火，分散在肝脏和血液中，促进消化、吸收热能和产生智慧；培根是水和土，存在于脾、胃、膀胱内，可以调节消化及水分代谢，影响人的体格和性情。特别是持命龙(索增龙)，位于头顶大安脉轮，运行在喉头、胸部等处，管理饥食渴饮，呼吸空气，吐出唾液，打喷嚏、打噎嗝，在意识器官保持清畅。上行龙(紧久龙)，位于胸部，在鼻、舌、喉头等处运行，作用是语言、增气力、焕发容颜，使记忆器官保持清畅。通行龙(恰不欺龙)，位于心脏，在全身运行，功能是支撑身体，司行走，伸缩，主口、眼开合。平住龙(麦娘姆龙)位于胃部，运行在内脏，功能是主消化，将饮食物分解为精华与糟粕，补偿损伤。下泄龙(吐塞龙)位于肛门，运行在大肠、膀胱、密处，大腿内侧等处，功能是控制精血、大小便的排泄和胎儿的降生。

    消化赤巴(久寄赤巴)位于胃位的消化和未消化的食物中，功能是主消化，将食物分解为精华与糟粕 ......