按病因分类，蒙医将疾病分为赫依病、协日病、巴干达病、血病、黄水病、虫病六种。
赫依病变
赫依失去相对平衡，发生太过、不及或搏乱等变化而损害身体称为赫依病变。赫依具有煽动寒热的双重性质，有轻、糙、滑等秉性，发生病变时亦表现以上特性。赫依病一般多见于年老、体弱及赫依个性的人，一旦发生病变，无论寒症还是热症，均使其加剧、复杂化。
可引起赫依病变的外因有以下几种：①过食苦、辛味，性轻、糙、凉的饮食，营养不良；②长期失眠，多语，欲望过度；③受风、受凉过度；④过度惊恐、悲伤、精神受刺激或下泻、催吐、放血等疗法应用不当。以上四种因素均可使赫依功能紊乱，引起盈症。反之，温性油腻厚重的饮食过度，身体活动过少，时季过度温热，补养过量等可压抑赫依，使其减少，引起亏症。
赫依病变过程有蓄积、发作、平息三个阶段。
赫依病变的形式分太过、不及、搏乱三种形式。太过表现消瘦、皮肤青、喜暖、身颤、腹胀、便秘、多语、头晕、体力衰弱、睡眠不佳、感觉迟钝等赫依秉性增多的症状；不及表现乏力、少语、身感不适、反应迟钝等赫依秉性减少的症状；搏乱是赫依秉性紊乱的症状。
赫依病变部位可遍及全身表里上下，主要累及在肾、髋、心脏、大肠、骨、关节、皮肤、耳等部位。
协日症变
协日属火，有热、锐利等秉性，所以协日病发病较急，病变过程快，易流行、高热、刺痛较严重。多见于青壮年及协日个性者。
引起协日病变的外因有：①过食辛、咸、酸味，热性、油腻的食品；②过度劳累、长期日晒、焦急等锐性活动过度；③时季气候异常变热；④跌伤、热病传染、温热施治过量等。以上原因皆可诱发协日盈症病变。反之，清、冷、淡的饮食，长期处于荫凉寒冷的环境，清凉施治过量等可使协日减少，引起亏症。
协日病变过程有蓄积、发作、平息三个阶段。
协日病变形式有太过、不及、搏乱三种。太过表现为发热、口渴、黄染、下泻等症状；不及表现为体温低下、身体发冷、皮肤发青等；搏乱表现协日紊乱的各种症状。
协日病变虽循于全身，但主要累及肝、胆、小肠、血、汗、眼、皮肤等。
巴达干病变
巴达干属水、土，有重、冷等秉性，所以巴达干病变发病慢，变化少，病程长，痊愈慢，疼痛钝、弱。临床多见于少年儿童及巴达干个性者。
巴达干病变的内因是其本身。外因有：生冷、油腻、不易消化的饮食过量；受冷、潮湿、长期不活动；时季寒冷；清凉施治过度等。以上为促使巴达干发生盈症病变的外因。与此相反，热锐、轻性的饮食，过热的环境，活动过度，热性施治过度等则压仰巴达干，引起亏症。
巴达干太过则身体发凉，食物不消，身体沉重、倦怠，关节松软，唾液、鼻涕增多；不及表现为头晕、心悸等；搏乱表现为巴达干七种秉性互相干扰的症状。
巴达干病的循径为头、舌、胃、肾、膀胱、肺、饮食精微、肌肉、脂肪、精液、大小便等。
血病
血病类似于协日病，热锐性，起病急，发展快，变化多，临床上多见于壮年及血协日个性者。
血病有三种形式：太过、亏损、搏乱。太过表现为眼、面发红，头痛、发热，口腔牙龈溃烂，鼻衄，咳血，便血，尿血，疮疡等；亏损表现为身体衰弱，头晕，耳鸣，眼花，心悸，气急，口唇发白，月经失调等；搏乱则为血热增多的各种表现。
血病变主要累及肝、血脉、眼、鼻、头等部位。
黄水病变
黄水发生太过、不及、搏乱变化，损害身体称为黄水病变。黄水病与协日、血合并则为热性病变，与巴达干、赫依合并则为寒性病变。因此，引起血、协日热的因素即可引起热性黄水病，引起巴达干、赫依病变的因素即引起寒性黄水病变。
黄水病变的形式有增多、耗损、搏乱三种形式。黄水增多是由于消化功能不佳，血液清浊分泌不良，血之浊返流入精微之道，使元气混浊而黄水增多，表现全身生疮，皮肤瘙痒，肌肉肿胀，毛发脱落，关节肿痛，皮下囊肿等；黄水亏损是由于大出血、长期营养不良等因素使黄水产生减少所致，表现为全身干瘦、乏力，皮肤无弹性；黄水搏乱主要表现增多的症状。
黄水病虽然累及全身，但主要累及皮肤、肌肉之间的组织，腹腔，关节腔等。
虫病
由致病虫引起的疾病叫虫病，合并巴达干、赫依为寒性病变，合并协日、血为热性病变。致病虫主要分为寄生虫和粘虫，粘虫主要合并血、协日引起瘟疫症、皮肤病等热症，并有传染性；寄生虫则引起肠道寄生虫等多种寄生虫病。
赫依病变
赫依失去相对平衡，发生太过、不及或搏乱等变化而损害身体称为赫依病变。赫依具有煽动寒热的双重性质，有轻、糙、滑等秉性，发生病变时亦表现以上特性。赫依病一般多见于年老、体弱及赫依个性的人，一旦发生病变，无论寒症还是热症，均使其加剧、复杂化。
可引起赫依病变的外因有以下几种：①过食苦、辛味，性轻、糙、凉的饮食，营养不良；②长期失眠，多语，欲望过度；③受风、受凉过度；④过度惊恐、悲伤、精神受刺激或下泻、催吐、放血等疗法应用不当。以上四种因素均可使赫依功能紊乱，引起盈症。反之，温性油腻厚重的饮食过度，身体活动过少，时季过度温热，补养过量等可压抑赫依，使其减少，引起亏症。
赫依病变过程有蓄积、发作、平息三个阶段。
赫依病变的形式分太过、不及、搏乱三种形式。太过表现消瘦、皮肤青、喜暖、身颤、腹胀、便秘、多语、头晕、体力衰弱、睡眠不佳、感觉迟钝等赫依秉性增多的症状；不及表现乏力、少语、身感不适、反应迟钝等赫依秉性减少的症状；搏乱是赫依秉性紊乱的症状。
赫依病变部位可遍及全身表里上下，主要累及在肾、髋、心脏、大肠、骨、关节、皮肤、耳等部位。
协日症变
协日属火，有热、锐利等秉性，所以协日病发病较急，病变过程快，易流行、高热、刺痛较严重。多见于青壮年及协日个性者。
引起协日病变的外因有：①过食辛、咸、酸味，热性、油腻的食品；②过度劳累、长期日晒、焦急等锐性活动过度；③时季气候异常变热；④跌伤、热病传染、温热施治过量等。以上原因皆可诱发协日盈症病变。反之，清、冷、淡的饮食，长期处于荫凉寒冷的环境，清凉施治过量等可使协日减少，引起亏症。
协日病变过程有蓄积、发作、平息三个阶段。
协日病变形式有太过、不及、搏乱三种。太过表现为发热、口渴、黄染、下泻等症状；不及表现为体温低下、身体发冷、皮肤发青等；搏乱表现协日紊乱的各种症状。
协日病变虽循于全身，但主要累及肝、胆、小肠、血、汗、眼、皮肤等。
巴达干病变
巴达干属水、土，有重、冷等秉性，所以巴达干病变发病慢，变化少，病程长，痊愈慢，疼痛钝、弱。临床多见于少年儿童及巴达干个性者。
巴达干病变的内因是其本身。外因有：生冷、油腻、不易消化的饮食过量；受冷、潮湿、长期不活动；时季寒冷；清凉施治过度等。以上为促使巴达干发生盈症病变的外因。与此相反，热锐、轻性的饮食，过热的环境，活动过度，热性施治过度等则压仰巴达干，引起亏症。
巴达干太过则身体发凉，食物不消，身体沉重、倦怠，关节松软，唾液、鼻涕增多；不及表现为头晕、心悸等；搏乱表现为巴达干七种秉性互相干扰的症状。
巴达干病的循径为头、舌、胃、肾、膀胱、肺、饮食精微、肌肉、脂肪、精液、大小便等。
血病
血病类似于协日病，热锐性，起病急，发展快，变化多，临床上多见于壮年及血协日个性者。
血病有三种形式：太过、亏损、搏乱。太过表现为眼、面发红，头痛、发热，口腔牙龈溃烂，鼻衄，咳血，便血，尿血，疮疡等；亏损表现为身体衰弱，头晕，耳鸣，眼花，心悸，气急，口唇发白，月经失调等；搏乱则为血热增多的各种表现。
血病变主要累及肝、血脉、眼、鼻、头等部位。
黄水病变
黄水发生太过、不及、搏乱变化，损害身体称为黄水病变。黄水病与协日、血合并则为热性病变，与巴达干、赫依合并则为寒性病变。因此，引起血、协日热的因素即可引起热性黄水病，引起巴达干、赫依病变的因素即引起寒性黄水病变。
黄水病变的形式有增多、耗损、搏乱三种形式。黄水增多是由于消化功能不佳，血液清浊分泌不良，血之浊返流入精微之道，使元气混浊而黄水增多，表现全身生疮，皮肤瘙痒，肌肉肿胀，毛发脱落，关节肿痛，皮下囊肿等；黄水亏损是由于大出血、长期营养不良等因素使黄水产生减少所致，表现为全身干瘦、乏力，皮肤无弹性；黄水搏乱主要表现增多的症状。
黄水病虽然累及全身，但主要累及皮肤、肌肉之间的组织，腹腔，关节腔等。
虫病
由致病虫引起的疾病叫虫病，合并巴达干、赫依为寒性病变，合并协日、血为热性病变。致病虫主要分为寄生虫和粘虫，粘虫主要合并血、协日引起瘟疫症、皮肤病等热症，并有传染性；寄生虫则引起肠道寄生虫等多种寄生虫病。