人类基因组研究标志着生命科学进入一个从总体、综合角度理解生命活动的分子基础新阶段。基因的功能主要通过其编码的蛋白质来实现，但一个基因碱基序列并不代表可以识别这个基因所编码的蛋白质，因为一个基因可以产生出多个蛋白质，如人的一个基因大约可编码10个蛋白质 [1] ;而且DNA序列信息不能说明蛋白质的翻译后修饰，一个蛋白质可能有400多个化学修饰来完成其功能、定位和活性 [2] ，如人心脏的HSP27蛋白，一个蛋白可修饰成59种蛋白 [3] 。在生命活动的过程中，基因是控制者，蛋白质才是真正执行者。在基因组计划完成后，蛋白质组学成为主要生命科学研究领域。蛋白质组学(proteomics)是对基因组编码的所有蛋白质进行大规模研究的一门科学。其研究目的是在蛋白质水平上阐明生理、病理过程的发生机制，为疾病诊断、治疗提供依据。在对疾病的研究中，以前主要是基于对病因确定的疾病研究。而疾病的发生往往涉及诸多因素，基因组学和蛋白质组学开阔了对于疾病研究的方法，为在生物学和医学方面研究疾病产生的分子和生理学机制提供了可能。

     1 蛋白质组学的研究策略

    蛋白质组学不仅需要研究生物效应与蛋白质群体在表达数量和性质上的关系，还需要进一步分析群体中各成分之间的相互作用。当前，蛋白质组学分为表达蛋白质组学和功能蛋白质组学 [4] 。表达蛋白质组学是对整个基因组或细胞、组织、器官中的蛋白质组进行大规模研究的方法。其研究方法是像基因组学研究，通过研究，获取人类3～4万基因编码的所有蛋白质，建立蛋白质组学数据库，而蛋白质比DNA的化学组成和分子结构更复杂，高通量地识别和鉴定蛋白质比较困难，在短时间内建立人类蛋白质组学数据库条件还未成熟;功能蛋白质组学是对在特定时间、特定环境和实验条件下，对特定蛋白质复合体的结构组成、功能及作用网络研究的一门科学。

     2 蛋白质组学的方法

    2.1 样品的准备 一个有效的样品准备是蛋白质组学研究成功的基础。在分析中所加入的试剂往往能扩大和潜在地破坏结果的正确性 [4] ，因此在样品制备中减少蛋白被破坏对于实验成功尤为重要。

    2.2 蛋白质的分离技术 二维聚丙烯酰胺凝胶电泳(two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis，2-DE)技术现在依然是蛋白质分离的主要技术。它的第一相是根据多肽电荷大小不同进行分离的等电聚焦(isoelectric focusing，IEF);第二相则是基于多肽的分子量不同进行分离的十二烷基磺酸钠—聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)技术 ......