基于伪F统计量的模糊聚类方法在基因表达数据分析中的应用
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易东；张彦琦；王文昌；张蔚；杨梦苏；黄明辉；方志俊
基因表达|模糊聚类法|伪F-统计,关键词：
参见附件(131kb)。
易东；张彦琦；王文昌；张蔚；杨梦苏；黄明辉；方志俊 香港城市大学基因组科技应用研究中心；第三军医大学卫生统计学教研室 中国卫生统计 2002 3
关键词：基因表达；模糊聚类法；伪F-统计
目的 通过对基因芯片数据的分析 ,提出一种基因表达的分类方法。方法 首先 ,应用FCM模糊聚类法(FuzzyClusteringMethod)进行聚类 ,然后我们应用PFS(PseudoF statistics)统计量作为一个判别函数来确定最佳类数目。结果 将本方法应用于模拟数据、人类纤维原细胞血清基因表达数据上 ,其结果明显好于K 均值法。结论 本方法基于没有聚类数据的任何先验知识和组成成分信息的前提下 ,考虑如何确定数据的分类结构。根据实际结果发现 ,该方法是揭示基因表达变化内在模式的有力工具 .
关键词：基因表达；模糊聚类法；伪F-统计
目的 通过对基因芯片数据的分析 ,提出一种基因表达的分类方法。方法 首先 ,应用FCM模糊聚类法(FuzzyClusteringMethod)进行聚类 ,然后我们应用PFS(PseudoF statistics)统计量作为一个判别函数来确定最佳类数目。结果 将本方法应用于模拟数据、人类纤维原细胞血清基因表达数据上 ,其结果明显好于K 均值法。结论 本方法基于没有聚类数据的任何先验知识和组成成分信息的前提下 ,考虑如何确定数据的分类结构。根据实际结果发现 ,该方法是揭示基因表达变化内在模式的有力工具 .
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