计算机辅助设计提高人NMDA受体主亚基M3-M4环在E.coli中的表达
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张玉梅；孙长凯；范明；李伍举；赵杰；韩大跃；王吉庆；吴加金
人NMDA受体|RNA二级结构|密码子偏性计算,关键词：
参见附件(76kb)。
张玉梅；孙长凯；范明；李伍举；赵杰；韩大跃；王吉庆；吴加金 大连医科大学脑疾病研究所；大连医科大学脑疾病研究所 大连116027；军事医学科学院基础医学研究所 北京100850；解放军大连210医院 大连116011 基础医学与临床 2003 5
关键词：人NMDA受体；RNA二级结构；密码子偏性计算
基于对螺旋区随机堆积的RNA二级结构的预测和密码子偏性计算,建立了pBV2 2 0载体中外源基因高效表达的判别模型。该模型认为,外源基因的表达水平与其5′端30～39区域,以及3′端30～- 39区域的RNA二级结构自由能具有显著的统计学意义;其次与3′端9bp的局部密码子偏性相关。据此模型,使用RNAfold和Goldkey软件优化改构设计了用于克隆表达人NMDA受体主亚基M3 M4环的引物。将PCR扩增的基因克隆入pBV2 2 0载体中,在大肠杆菌DH5α宿主中获得了高效表达(表达水平在2 0 %以上)。
关键词：人NMDA受体；RNA二级结构；密码子偏性计算
基于对螺旋区随机堆积的RNA二级结构的预测和密码子偏性计算,建立了pBV2 2 0载体中外源基因高效表达的判别模型。该模型认为,外源基因的表达水平与其5′端30～39区域,以及3′端30～- 39区域的RNA二级结构自由能具有显著的统计学意义;其次与3′端9bp的局部密码子偏性相关。据此模型,使用RNAfold和Goldkey软件优化改构设计了用于克隆表达人NMDA受体主亚基M3 M4环的引物。将PCR扩增的基因克隆入pBV2 2 0载体中,在大肠杆菌DH5α宿主中获得了高效表达(表达水平在2 0 %以上)。
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