F型、H型居群的铁皮石斛rDNAITS区序列差异及SNP现象的研究

http://www.100md.com 丁小余；王峥涛；徐珞珊；徐红；周开亚；施国新

铁皮石斛|rDNAITS区|DNA序列|单核苷酸多态(SNP)|居群差异,关键词：

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     丁小余；王峥涛；徐珞珊；徐红；周开亚；施国新 南京师范大学生命科学学院；江苏南京210097；中国药科大学生药学研究室 江苏南京210038 中国中药杂志 2002 1

    关键词：铁皮石斛；rDNAITS区；DNA序列；单核苷酸多态(SNP)；居群差异

    目的 :研究铁皮石斛主产区F型和H型居群rDNAITS碱基序列的差异。方法 :运用PCR直接测序法对广西、贵州、云南铁皮石斛主要居群的rDNAITS区 (包括ITS1,5 .8SrDNA ,ITS2 )碱基序列进行了序列测定。结果 :在铁皮石斛各居群中 ,F型居群与H型居群植株的rDNAITS区碱基序列有 2个位点差异 ,且变异分别发生在ITS1区及 5 .8S区内。研究表明 :铁皮石斛居群内部rDNAITS区的差异与植物生活型的差异呈一定的相关性 ,H型居群的铁皮石斛是F型的变种。在F型与H型居群间 ,其 5 .8SrDNA区存在单核苷酸多态 (SNP)现象。首次报道了铁皮石斛ITS区的碱基序列 ,ITS区总长度为 6...

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