甲病毒属_克隆，分子_聚合酶链反应

中国分离的甲属病毒YN87448毒株非结构区基因的核苷酸序列测定及分析

http://www.100md.com 《中华实验和临床病毒学杂志》 1999年第4期

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     周国林梁国栋李蕾付士红李福胜金奇张海林黄文丽侯云德周国林、梁国栋、李蕾、付士红、李福胜、金奇、侯云德 100052 北京，中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程国家重点实验室；张海林、黄文丽云南省流行病防治研究所中华实验和临床病毒学杂志 1999 0 13 4

    关键词：甲病毒属；克隆，分子；聚合酶链反应；碱基序列期刊 zhsyhlcbdxzz 0 论著 fur -->/info/meeting/meeting02.asp?keyword=微生物学

【摘要】目的 研究我国首例从发热病人血清中分离的YN87448病毒的分子致病基础。方法甲属病毒基因序列保守区设计引物，用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增，再将扩增片段克隆到pGEM-T载体。测定YN87448毒株非结构基因序列。结果 YN87448病毒非结构区基因序列为7 613个核苷酸(不包括5′端帽子结构)，编码非结构蛋白1(nsP1)，非结构蛋白2(nsP2)，非结构蛋白3(nsP3)，非结构蛋白4(nsP4)；有一个起始密码子(ATG)位于第60位碱基；含有2个终止密码子(TGA)，分别位于基因组nsP3基因和nsP4基因的末端。YN87448病毒非结构区基因与辛德毕斯病毒家族中唯一能致成年小鼠死亡的S.A.AR86株相应基因的核苷酸序列同源性为98.8%，但YN87448毒株不致成年小鼠死亡。与S.A.AR86株相比，基因结构上有三点明显差异：YN87448毒株在nsP3区位于基因组5 256 bp-5 309 bp含54个核苷酸的插入；位于基因组5 603 bp处3个核苷酸(AGT)的缺失；在nsP3和nsP4之间有乳白突变终止密码子(TGA) ......

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