中国大陆庚型肝炎病毒NS区部分基因序列分析及变异的初步研究
肝炎病毒,庚型|序列同源性|核酸|氨基酸|聚合酶链反应,关键词:,参考文献
关键词:肝炎病毒,庚型;序列同源性;核酸;氨基酸;聚合酶链反应
【摘要】 目的 研究中国庚型肝炎患者分离的病毒基因的特异性及变异规律。方法 应用逆转录-巢式聚合酶链反应(PCR)技术从16例庚型肝炎病毒(HGV)感染住院病人血清中扩增了HGV NS5区部分基因片段(141nt)。经纯化后采用双脱氧链末端终止法进行序列分析。结果 观察到在HGV NS5区第7 820-7 960核苷酸之间的5′端较3′端核苷酸及其编码氨基酸变异率高。与Linnen等报道的美国株HGV相比,中国人HGV NS5区核苷酸的变异主要集中在HGV NS5工第7 824,7 845~7 860,7 892,7 914,7 917和7 935核苷酸位点及区域,各个核苷酸位点的变异率在0~89.5%,与美国株相比核苷酸序列的同源性为83.6%~95.7%,平均89.6%;氨基酸为83.0%~100%,平均为91.2%。在7 933核苷酸位点与美国株相比变异率为93.7%。结论 中国人群之间HGV NS5区部分基因及其推测编码蛋白较保守,但与美国株有明显差别。不同硷基在序列中呈散在分布,而在某些位点虽与美国株相比变异很大,但中国人群之间离散度较小,HGV核酸的变异可能与地域因素有关。
Preliminary study on NS5 region gene sequencing and variants of hepatitis G virus in China Li Boan, Dong Zhifeng, Cheng Yun, et al. Department of Immunology, 302 Hospital of PLA, Beijing 100039
......
您现在查看是摘要页,全文长 10992 字符。