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编号:10649682
中国大陆庚型肝炎病毒NS区部分基因序列分析及变异的初步研究
http://www.100md.com 《中华实验和临床病毒学杂志》 1999年第1期
肝炎病毒,庚型|序列同源性|核酸|氨基酸|聚合酶链反应,关键词:,参考文献
中国大陆庚型肝炎病毒NS区部分基因序列分析及变异的初步研究
中国大陆庚型肝炎病毒NS区部分基因序列分析及变异的初步研究

     李伯安 董志锋 程云 高蓉 施红 郭仁峰 薛净 罗清华 韩凤连 张建宗 100039 北京 解放军302医院免疫研究室(李伯安 程云 高蓉 郭仁峰 薛净 罗清华 张建宗),生物工程研究室(施红 韩凤连);中国生物工程开发中心(董志锋) 中华实验和临床病毒学杂志 1999 0 0 1


    关键词:肝炎病毒,庚型;序列同源性;核酸;氨基酸;聚合酶链反应 期刊 zhsyhlcbdxzz 0 论著 fur -->


     【摘要】 目的 研究中国庚型肝炎患者分离的病毒基因的特异性及变异规律。方法 应用逆转录-巢式聚合酶链反应(PCR)技术从16例庚型肝炎病毒(HGV)感染住院病人血清中扩增了HGV NS5区部分基因片段(141nt)。经纯化后采用双脱氧链末端终止法进行序列分析。结果 观察到在HGV NS5区第7 820-7 960核苷酸之间的5′端较3′端核苷酸及其编码氨基酸变异率高。与Linnen等报道的美国株HGV相比,中国人HGV NS5区核苷酸的变异主要集中在HGV NS5工第7 824,7 845~7 860,7 892,7 914,7 917和7 935核苷酸位点及区域,各个核苷酸位点的变异率在0~89.5%,与美国株相比核苷酸序列的同源性为83.6%~95.7%,平均89.6%;氨基酸为83.0%~100%,平均为91.2%。在7 933核苷酸位点与美国株相比变异率为93.7%。结论 中国人群之间HGV NS5区部分基因及其推测编码蛋白较保守,但与美国株有明显差别。不同硷基在序列中呈散在分布,而在某些位点虽与美国株相比变异很大,但中国人群之间离散度较小,HGV核酸的变异可能与地域因素有关。

    Preliminary study on NS5 region gene sequencing and variants of hepatitis G virus in China Li Boan, Dong Zhifeng, Cheng Yun, et al. Department of Immunology, 302 Hospital of PLA, Beijing 100039

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