登革2型病毒04株5′和3′末端的序列分析
登革热病毒|基因|序列分析,关键词:
关键词:登革热病毒;基因;序列分析
【摘要】 目的 测定登革2型病毒04株(D2-04)基因组5′和3′末端序列。方法 从D2-04感染的C6/36细胞中提取总RNA,以该RNA为模板,利用RACE法,分别扩增D2-04株的5′和3′末端cDNA片段。将其分别与pGEM-T载体连接得到含有5′端535bp和3′端503 bp cDNA的重组质粒,并测定上述cDNA插入片段的序列。将D2-04的5′和3′端非编码区的核苷酸序列与其它登革2型毒株进行同源性比较。结果 D2-04株与JAM、NGC、S1、16681和PDK-53株的同源性分别为98.96%,98.96%,93.75%,98.95%,97.92%和97.72%,97.80%,90.65%,94.26%,94.22%。结论 D2-04株除与S1株的同源性略低外,其余株的同源性均在94%以上。
Sequenceanalysis of the 5 ′ and3 ′ terminal regions ofdengue type 2 virus 04 strain
YANG Jing, YANG Peiying, QIN Ede, et al.
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