蒙药方剂是用蒙药材配伍而成的复方，也是古代单味药治疗疾病的进一步发展。它具有综合治疗作用，疗效范围较广，并能调和、缓解药物的毒性，减少或避免不良反应，达到临床的治疗目的。它是蒙医学理、法、方、药体系的一个重要部分，是蒙医治病的主要手段。蒙医临床上用药基本以成方为主。虽有辨证加减药味，但加减的药物基本固定。

    由于受《四部医典》等藏医学著作的影响，蒙药方剂除蒙文名称外大多都冠以藏文名称。1981年，内蒙古自治区曾组织有关蒙医药专家去青海、西藏等地参观考察，发现500种藏医常用药材中有120种与蒙医用药完全不同；《藏药标准》收载的174种药材中有120种与蒙药同名异物；290种藏成药中与蒙药方剂完全相同的仅7种 ......