冠状病毒_____严重急性呼吸综合症；冠状病毒；开放读码框

SARSCoV基因组及其产物的生物学功能(Ⅱ)

http://www.100md.com 《第四军医大学学报》 2004年第20期

冠状病毒,,严重急性呼吸综合症；冠状病毒；开放读码框,0引言,1SARSCoV病毒复制酶,2结构,3结论,【参考文献】

     【摘要】 SARSCoV具有多种蛋白酶，其中有3种蛋白酶(解旋酶和另外两种半胱氨酸蛋白酶)在病毒的复制、转录、翻译和/或翻译后加工等过程中发挥重要的生理和病理作用；而其结构蛋白则在形成病毒粒子、参与病毒的致病机制中发挥重要作用. 本文综述了SARSCoV的主要产物酶及结构蛋白的结构及其功能等方面研究进展.

    【关键词】严重急性呼吸综合症；冠状病毒；开放读码框

     0引言

    2002年11月以来，中国大陆、香港、台湾等地先后经历了一次严重急性呼吸综合征相关的冠状病毒(severe acute respiratory syndrome associated coronavirus, SARSCoV)的流行，由于其病原体传播快,病情凶险，死亡率高. 因此明确它的分子生物学以开发特异性抗SARS 药物和疫苗等具有十分重要的意义. 我们就SARSCoV主要蛋白酶和结构蛋白的结构及其功能等方面研究现状作一综述.

    1SARSCoV病毒复制酶

    复合蛋白(pp1a, pp1ab)pp1a, pp1ab的编码区约占全基因组5′端起2/3 ,由ORF1a和ORF1b共同编码，其中ORF1a碱基序列为nt 265~13 398全长为13 143 bp；ORF1b碱基序列为nt13 398~21 485全长为8087 bp, pp1a的Mr约为486 000, pp1ab的Mr约为790 000. 病毒自身编码的pp1a和pp1ab对其病毒复制所需酶的加工成熟起重要作用. 迄今已知pp1a多肽前体主要由辅助蛋白酶区(PLPpro), 主要蛋白酶区(3CLpro), 疏水区(HD)等组成；而pp1ab前体除了pp1a所编码的蛋白外尚有如下结构域:RNA聚合酶, 解旋酶(HEL)和锌指模序等[1]. 在不同的冠状病毒中,这些结构域的数目多少和位置有所差别. 在pp1ab翻译时约在nt13 392~13 398位点处发生1位的核糖体翻译移框(frame shift)，这是一个保守的位点“UUUAAAC”,位于紧邻ORF1a/1b的假结体(pseudoknot structure)上[2,3]；预测核糖体翻译移框可能引发自单一起始位点起翻译合成复制酶多聚蛋白,蛋白随后自身催化,水解生成多个蛋白质, 包括PCPpro/PLPpro, 3CLpro, RdRp、锌指结构(zinc finger)和HEL及其他一些功能尚不清楚的蛋白. 这是冠状病毒感染适宜的宿主细胞后,在其胞质中进行复制的第一步 ......

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