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编号:10920091
微卫星分子标记在大豆中的应用.pdf
http://www.100md.com 2006年2月23日
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    第 2 l 卷 第 1 期

    2 0 0 5 年 2 月

    农 业 系 统 科 学 与 综 合 研 究

    S YS TEM S CI ENCES AND COMPREHENSI VE S TUDI ES I N AGRI CUL TURE

    Vo 1 . 21。 No. 1

    F e b.。 2005

    微卫星分子标记在大豆中的应用

    吴俊江

    ( 黑龙 江省农业科学院 大豆研 究所,黑龙江 哈 尔滨 1 5 0 0 8 6 )

    摘 要:微卫星分子标记具有重复性好、多态性高、共显性等特点而在大豆中广泛应用。对微卫星分子标记在大豆分子遗

    传图谱构建 、分子标记辅助选择 、遗传多样性及遗传距离分析 、品种鉴别等方面进行介绍 ,为该标记在大豆中的更好应用

    提供理论参考依据。参2 7 。

    关键词:大豆;微卫星序列;分子标记

    中图分类号 : 5 6 5 . 1 0 3 . 2 文献标识码 :A 文章编号 :1 0 0 1 一O O 6 8( 2 0 O 5 )O 1 —0 0 1 6 —0 4

    Th e u s a g e o f mi c r o s a t e l l i t e mo l e c ul a r ma r kmg i n s o y be a n

    、wu J u n - j i a n g

    ( T h e 肌 l n s t t u t e o f 如 A g r c u t u r a S c e n c e A c a d e m y ,H a r b n 1 5 0 0 8 6 ,C h i n a )

    Ahs l ~e t : Mi c r o s a t e l l l t e mo l e c u l a rma r k i n gi swi d e l y u s e di n s o y b e a nf o ri t s c h a r a c t e r i s t ic s o fg o o d r e p e t it i o n.t r i g h p o l y mor ph i s m a nd c o d o r I l i —

    i l a ac e I n t h i s p a p er ,f ir e u s a g e o f mi c r o s a t e l l i t e m o l e c u l a r mar k i n g i n s oy b e a n g e n e t ic ma p p i n g c o n s t r uc t i o n,a c c e s s o r ia l s el e c t i o n b y mo l e cu l a r

    ma r k i n g ,g e n e t i c d i v e r s i t y,g en e t i c d is t a n c e a n a l y s i s ,v a r i e t y i d e n t i f i c a t i o n a l e i n t r od u c e d i n o r d e r t o b r i n g d a e o r e t i c r e f e r e n c e b a s i s .

    Ke y wo r d s :s oy b e a n ; mi c r o s a t e l l i t e s e q u e n c e ;m o l e cu la r ma r k i n g

    1 前言 2 微卫星序列在大豆基因组中的分布

    在 苎 警 芋 构 差 宴l … O % : 特点 及微卫星分子标记的基本特征 2 0 % , 其余大部分为重复序列。重复序列包括散在 。 。 。

    重复序列和串联重复序列。串联重复序列又可分为

    卫星序列 、小卫星序列和微卫星序列。

    微卫 星序 列又 称简单 序 列重 复 ( S i m p l e S e —

    q u e n c e R e p e a t ,S S R ) ,是指 由 1 ~6个核苷酸组成的

    短序列首尾相连重复几到几十次不等,构成的一段

    D N A,现已证 明存在于绝 大多数真核生物基因组

    中【 , 。微卫星分子标记【 , ] 又称 S S R标记 ,是针

    对微卫星序列的特点,用人工合成的寡核苷酸作为

    探针,探测高变异位点。现多用微卫星两侧保守序

    列作为引物 ,进行 P C R扩增 ,经琼脂糖或聚丙烯

    酰胺凝胶电泳,找到差异片段【 . 6 J 。

    对微卫星分子标记的研究始于动物基因组[ ,在农作物中这一技术应用相对较晚 ,但 目前已在多

    种农作物中开展了这项研究。因此 ,就微卫星序列

    在大豆基因组中的分布特点 、微卫星序列分子标记

    的基本特征以及近几年在大豆中的应用情况作一阐

    述 ,为该标记在大豆中的更好 应用提供理论参考

    依据。

    2 . 1 微卫星序列在大豆基因组中的分布特点

    2 . 1 . 1 微卫星序列均匀、随机 、广泛地分布于大

    豆基因组 ,平均间隔约 1 5 K b 。

    2 . 1 . 2 微卫星序列的两侧顺序常较保守 ,在同种

    而不同遗传型大豆问多相同。

    2 . 2 微卫星分子标记的基本特征

    2 . 2 . 1 重复性好。虽然开始筛选重复序列和引物

    设计过程较慢 ,但只要引物确知,使用极为简单,结果极为稳定。

    2 . 2 . 2 多态性高。多数微卫 星序列无功能作用,增加或减少几个重复序列的频率高 ,因而在品种问

    具广泛位点变异,比 R F L P及 I L ~ P D分子标记具多

    态性 。

    2 . 2 . 3 共显性。由于微卫星序列多态性 的本质为

    重复单位数 目的不同,也就导致重复片段的长度不

    同。显性纯合个体与隐性纯合个体之问的差异为扩

    增片段的长度的差异,不是有无的差异 ,因而可以

    区分开显性纯合个体与杂合个体。

    收稿 L I 期 :2 0 0 4—0 7—0 5 ;修 口期:2 0 0 4—0 9—2 0 .

    基金项 目:黑龙江省青年基金项 目 ( Q C 0 3 C 2 5 ) ;国家 “ 8 6 3 ”i t ‘ 划项 } j ( 2 0 0 2 A 2 1 1 0 5 1 —2 ).

    作者简介 :吴俊江 ( 1 9 7 0一) ,男,硕 土,助理研究员,从事大豆遗传育种及分子标记辅助育种

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    2 . 2 . 4 呈孟德尔式遗传 ,因而对个体鉴定具特殊

    意义。

    2 . 2 . 5 分析 简便。仅需 微量组织 ,即便 D N A降

    解,其也能有效地分析鉴定。

    3 微卫星分子标记在大豆中的应用

    3 . 1 微卫星分子标记在大豆遗传作图中的应用

    到 目前为止,大豆上已有许多遗传图谱构建的

    报导,其 中利用 R F L P标 记是较常用 的一 种,但

    R F L P标记的局 限使大豆遗传 图谱 因所基于的群体

    变化而变化。微卫星分子标记由于单个位点具有多

    个等位基因,而每一遗传型中仅有一个等位基因的

    特点可克服 R F L P标记的不足。A k k a y a M. S . 等 J 、Mo r g a n t e等[ 9 l 、R o n g w e n等【 m J 证实 了 S S R标记在大

    豆基因组的高多态性 ......

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