乙型肝炎病毒基因型研究新进展
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刘 兴, 唐 红, 何 芳
乙型肝炎病毒;基因型;变异;治疗,刘兴,唐红,何芳,通讯作者:,电话:,收稿日期:,接受日期:,摘要,关键词:,1HBV基因分型的检测方法,2HBV基因型的地理
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参见附件(863KB，6页)。
刘兴, 唐红, 何芳, 四川大学华西医院感染性疾病中心 生物治疗国家重点实验室(四川大学)感染性疾病研究室 四川省成都市 610041国家杰出青年科学基金资助项目, No. 30325036
通讯作者: 唐红, 610041, 四川省成都市, 四川大学华西医院感染性疾病中心, 生物治疗国家重点实验室(四川大学)感染性疾病研究室. htang6198@hotmail.com
电话: 028-85422647
收稿日期: 2006-06-06 接受日期: 2006-06-24
摘要
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)属于嗜肝DNA病毒科, 由于HBV复制过程中HBV DNA聚合酶缺乏校正功能, 导致HBV容易发生突变. 根据基因序列差异的多少, 可将HBV划分为A-H 8种基因型, 其中A, B, C, F 4个基因型还可以划分为不同的亚型. HBV基因型呈一定的地理区域性分布. 并且HBV基因型对于探讨HBV的传播途径, HBV携带者的流动形式以及变异株在不同人群中的流行情况都有很重要的意义. HBV基因型之间结构和功能的差异均可影响慢性HBV感染者在临床诊治过程中出现的基因变异、病情预后以及对抗病毒治疗的反应性. 虽然近几年对HBV基因型的研究迅速增多, 但尚处于探索阶段对其研究仍任重而道远.
关键词: 乙型肝炎病毒; 基因型; 变异; 治疗
刘兴, 唐红, 何芳. 乙型肝炎病毒基因型研究新进展. 世界华人消化杂志 2006;14(22):2211-2216
0 引言
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)感染呈世界范围广泛流行, 仅慢性HBV携带者就有近4亿人之多. HBV感染不仅可导致急、慢性病毒性肝炎, 而且还可发展为肝硬化及肝细胞癌, 每年导致大约100万人死亡, 严重影响了人类的健康. 1988年Okamoto首先提出了HBV基因分型法. 目前, HBV基因型与HBV基因变异、HBV导致的临床疾病、慢性HBV感染者对抗病毒治疗的反应性及病情预后之间的关系已成为研究的热点. 现将HBV基因型的分型方法、不同基因型的地域分布以及与HBV血清型、基因变异、临床疾病、抗病毒治疗及预后的关系等方面的研究进展进行阐述. 1988年, Okamoto et al[1]对18株HBV的全部核苷酸序列进行分析, 根据核苷酸全序列异质≥8%分为A, B, C, D 4个基因型, 从而提出了HBV基因型的概念并初步建立了HBV基因型的分型标准. 1992年Norder et al[2]对HBV的S基因序列进行分析, 根据S基因差异≥4%, 发现了2种新基因型E, F. 以后Stuyver et al[3]及Arauz-Ruizet al[4]分别在2000年和2002年发现了基因型G和H. 到目前为止, 根据HBV核苷酸全序列异质≥8%或S基因序列核苷酸差异度≥4%, 已将乙肝病毒株分为A到H 8种基因型. 其中基因型A还可分为Ae(e代表欧洲)和Aa(a代表亚洲和非洲)2个亚型[5]; 基因型B又可分为Ba(a代表亚洲)和Bj(j代表日本)2个亚型[6]; 基因型C可分为C1和C2 2个亚型[7]; 基因型F又可分为4个分支(Ⅰ-Ⅳ), 亚基因型F1属于分支Ⅰ, 亚基因型F2属于分支Ⅱ和Ⅳ, 基因型H属于基因型F的分支Ⅲ. 基因型H的全基因序列与基因型F相差7.5%-9.6%, 所以把他从基因型F中分离出来作为一种新的基因型[4,8-9]. 鉴于HBV的进化特点, 今后还有可能发现新的基因型.
由于不同基因型的HBV在流行特征、致病性、对药物治疗反应等方面存在差异, 因此了解HBV基因型具有重要的临床意义. 通过HBV基因分型(1)可用于流行病学研究, 了解HBV基因型的地区分布、致病性、基因变异及变异株在不同人群中的流行情况; (2)探索HBV传播途径. 基因型A与性接触有关, 而基因型D则与血液传播有关[10]; (3)可观察疫苗的预防作用, 尤其对母婴传播基因型的研究; (4)可了解基因型与抗病毒疗效之间的关系[11].
1 HBV基因分型的检测方法
1988年Okamoto首先提出了乙型肝炎病毒基因分型法. 随着分子生物学技术的发展, 基因分型的方法也在不断进步, 渐趋简化、准确 ......
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