灵芝从神话中的“瑶姬”化为“萄草”，又经过深化而出现了“六芝”，经历了相当长的时间，在东晋之前古籍中没有“灵芝”之说。“六芝”的出现无疑是古人对芝类认识的发展。吴谱等在《神农本草经》和葛洪的《抱朴子》中主要根据颜色划分“六芝”。葛洪曰“赤者如珊瑚，白者如截脂，黑者如泽漆，青者如翠羽，黄者如紫金。皆光明洞察，如坚冰也”。葛洪又按质地分“五芝，即石芝、木芝、肉芝、菌芝和草芝。”梁代陶弘景在《本草经集注》中也是依据色泽不同论述“六芝”。明代李时珍则进一步从性味和药效功能进行“六芝”分类。

    时珍曰“芝类甚多，亦有花实者，本草惟以芝标名，然其种属不可不识。”说明芝类众多 ......