双歧杆菌是人和动物肠道内最主要的生理性细菌，在提高宿主健康方面是关键的共生体。目前已发现，双歧杆菌属包括32个种，每个种还包括若干亚种，双歧杆菌种类如此繁多，因此对它们进行鉴定和分类就是至关重要的，现对双歧杆菌种类鉴定的基因学方法综述如下。

    随着分子生物学的发展，细菌分类学发生了显著的改变，从基因水平对细菌种类的鉴定成为最精确最可靠的方法，当前用于双歧杆菌的分类和鉴定主要有以下基因。

    Tuf基因：在物种的鉴定方面tuf基因表现出极好的特性，这是因为它具有高度的保守性和普遍存在性[1-2]。作为一个适当的种系marker，此基因具有优越的前提条件，如高遗传稳定性和普遍性[3]，它可以避免出现与rRNA的相近性，可避免对于拥有相似不同核苷酸种类的亲缘关系的过高评价，还可避免在不同位点中取代模型的非独立性，及微生物中不同G+C含量的偏移等这些问题[4]。在双歧杆菌中，tuf基因属于一个大的转录单位str操纵子，这个操纵子编码许多核糖体蛋白和相关蛋白。经测定在长双歧杆菌NCC2705中tuf基因为4.8kb,位于fusA基因(翻译延伸因子G)、rpsG基因(30S核糖体蛋白S7)和rpsL基因(30S核糖体蛋白S12)的下游，一个尚未鉴定的开放读码框的上游。在对多种双歧杆菌的tuf基因的序列多重对比中我们发现，在相同种类中，tuf基因有很高的保守性，而在种间这种保守性相对来说不高，双歧杆菌中tuf基因的一致性为89%~97%。Tuf基因编码EF-Tu蛋白，EF-TU是一种延伸因子，在蛋白质合成中起着重要作用，它的二级结构包括Ⅰ区域中的4个α螺旋和两个β片层，整个Ⅱ区域，Ⅲ区域中的N-末端部分[5]，这些结构的确定是根据大肠杆菌中EF-TU的结构而推测的，与其他细菌的EF-Tu比较发现，双歧杆菌EF-TU蛋白质的氨基酸有高度的保守性[6] ......