PCR/SSP结合PCR/SSCP分析湖南汉族HLA-DQA1等位基因多态性
作者:田伟 李立新 郭实士 程文
单位:410078 长沙 湖南医科大学免疫研究室
关键词:
中华微生物990413 为准确阐明湖南汉族群体HLA-DQA1遗传多态性,采用PCR/SSP方法,并联合应用可同时区分HLA-DQA1*0101~0601等位基因的银染PCR/SSCP技术对60例随机选择的湖南汉族健康者作HLA-DQA1等位基因分型。结果表明,湖南汉族存在10种HLA-DQA1等位基因,以DQA1*0302,0501,0102最为常见,等位基因频率值分别为0.225 4, 0.225 4, 0.204 1;DQA1*0101, 0201, 0401最为少见, 基因频率值分别为0.016 7, 0.016 7, 0.016 7; 另外4种等位基因DQA1*0103, 0104,0301, 0601基因频率值分别为0.096 2,0.078 0,0.069 0,0.069 0;空白基因频率值为0。对全部基因型观察值和理论值作H-W吻合度检验,P>0.5 (ν=45), 说明本次调查具有代表性,所获数据可作为湖南汉族群体HLA-DQA1等位基因频率正常参考值。全部60例样本中5例样本PCR/SSP只能准确指定一个等位基因,另一等位基因不能肯定或可有多种解释,上述样本经PCR/SSCP分析获明确定型。
PCR/SSP尽管具备方便、快捷等诸多优点,但可因诸多因素的影响存在分型误差。对HLAⅡ类基因分型而言,PCR/SSCP是PCR/SSP的一种有益补充,这在样本仅检出一个等位基因而不能明确定为纯合子的情况下尤为重要。建立可同时区分HLA-DQA1*0101~0601的银染PCR/SSCP技术,不仅可比较样本间HLA-DQA1相容性,也可同时确定样本HLA-DQA1基因型别。
(收稿:1998-11-30 修回:1999-03-08), http://www.100md.com
单位:410078 长沙 湖南医科大学免疫研究室
关键词:
中华微生物990413 为准确阐明湖南汉族群体HLA-DQA1遗传多态性,采用PCR/SSP方法,并联合应用可同时区分HLA-DQA1*0101~0601等位基因的银染PCR/SSCP技术对60例随机选择的湖南汉族健康者作HLA-DQA1等位基因分型。结果表明,湖南汉族存在10种HLA-DQA1等位基因,以DQA1*0302,0501,0102最为常见,等位基因频率值分别为0.225 4, 0.225 4, 0.204 1;DQA1*0101, 0201, 0401最为少见, 基因频率值分别为0.016 7, 0.016 7, 0.016 7; 另外4种等位基因DQA1*0103, 0104,0301, 0601基因频率值分别为0.096 2,0.078 0,0.069 0,0.069 0;空白基因频率值为0。对全部基因型观察值和理论值作H-W吻合度检验,P>0.5 (ν=45), 说明本次调查具有代表性,所获数据可作为湖南汉族群体HLA-DQA1等位基因频率正常参考值。全部60例样本中5例样本PCR/SSP只能准确指定一个等位基因,另一等位基因不能肯定或可有多种解释,上述样本经PCR/SSCP分析获明确定型。
PCR/SSP尽管具备方便、快捷等诸多优点,但可因诸多因素的影响存在分型误差。对HLAⅡ类基因分型而言,PCR/SSCP是PCR/SSP的一种有益补充,这在样本仅检出一个等位基因而不能明确定为纯合子的情况下尤为重要。建立可同时区分HLA-DQA1*0101~0601的银染PCR/SSCP技术,不仅可比较样本间HLA-DQA1相容性,也可同时确定样本HLA-DQA1基因型别。
(收稿:1998-11-30 修回:1999-03-08), http://www.100md.com