Internet与医学信息资源的应用
作者：王志禄 刘铭
单位：兰州医学院第一附属医院，甘肃省兰州市，730000)
关键词：
心血管病康复医学杂志000301
在信时代如何快捷地掌握信息技术手段，用好信息资源，特别是医学工作者利用Internet提 供 的医学信息数据，具有极其重要的意义。因此，本文就有关Internet的功能及其常用医学搜 索引擎作以介绍。
1 Interner上的资源
Internet上的资源主要有超级计算中心、图书文献中心、技术资料中心、公共软件库、科学 数据库、地址目录库及信息库等。随着Internet资源的日益丰富，在专业人员的指导下查询 信息就显得尤为重要。所提供服务大部分是免费的，其基本服务主要有下列几项：
, http://www.100md.com
1.1 电子邮件(E-mail)
是一种通过Inernet与其他用户进行联系，方便、快捷、价廉的现 代化通信手段，并在信息获取，科研合作等方面提供了非常重要的帮助，也是目前Internet 用户使用最为频繁的服务功能，是用户最先接触到的Internet功能。目前Web浏览器的软 件Netscape commnicator和Microsoft Internet Explorer都包含电子邮件客户软件，其设 备和操作都很简单，用户可在网上浏览的同时，收发电子邮件。
1.2 文件传输(FTP)
按照FTP(FiIe Transfer Protocol,文件传输协议)提供任意两台计算 机之间相互传输文件的功能。用户可使用windows 95专用FTP客户软件，或直接使用更为 简单，也不具备转送整个目录的功能。
1.3 远程登录(Telnet)
, 百拇医药
用户使用远程登录命令，可以使自己的计算机暂时成为远程计算 机的一个仿真终端。远程登录允许任意类型计算机之间进行通信，但目前Telnet的应用已经 越来越少，主要在于个人计算机性能已增强；Te ln et服务器安全性欠佳，一旦用户享有足够权限，便可随意操纵系统及文件；Telnet对初学者 来说不易学习掌握。
1.4 网络新闻(Usenet)
用户通过Internet并遵守网络礼仪可参与上万个几乎履盖当今生活全 部内容的新闻交流和讨论。上网的用户只要在计算机上安装一个新闻组阅读器软件，即可完 成申请加入新闻组，从服务器上读取新闻组消息，编写要发表的消息，并把它发送到服务器 等功能的程序，也可直接用Netscape communicator 软件的Collabra组件阅读新闻。
1.5 网络检索工具
目前基本的网络工具有Archie、Gopher及Wais，其中Archie只检索文 件名，不检索文件本身内容，Gopher只检索文件的类别和提要，也不检索文件的内容，而 WAIS则按照用户所给出的关键词对文件内容进行全文检索(fulltext seareh)。
, 百拇医药
1.6 全球网(WorId wide web, WWW)
也称万维网，是目前 Internet 上最方便、使用最 火爆的信息服务类型。WWW除了浏览外，也具有检索功能。通过WWW可以存取世界各地的超 媒体文件，包括文字、图形、声音、动画、资料库及各种软件。理论上WWW包括整个Int ernet世界，包含所有的Web站点，Gpher信息站、FTP档案库、Telnet公共存取帐号、Ne ws(新闻)讨论组，以及WAIS资料库。可以说WWW是当今全球最大的电子资料库，已经可以涵 盖Internet，通过它可以实现与其他Web网站之间的链接，达到信息资源共享。
2 WWW信息检索
WWW上存储着大量的信息资源，如各种类型的数据库，图书馆电子资源，国际组织、大学机 构、新闻报道、金融贸易以及购物、娱乐等信息，它已成为科研、教育、商务和社会信息在 全球 范围内传播的主要渠道。为了帮助人们快捷地获取所需信息，计算机和信息管理专家探索和 开发了一系列WWW检索工具-搜索引擎，用于网络资源的管理和检索。WWW基于超文本标记语 言(html),通过关键词在超文本、超媒体信息间建立起网状链接，实现了Internet上不同型 号计算机间简捷而自由的链接。
, 百拇医药
2.1 WWW检索工具类型
目前网上的检索工具已达到500余种，其分类如下：
2.1.1 按信息组织和查询方式分类：①查询引擎：也称检索引擎，即通过Robert、Spider等软件自动搜寻网络资源，并自动排 序或索引，形成一个庞大的主页信息数据库，如AIta Vista等。支持关键词或短语词查询 ，该类引擎查全率较高，但查准率较低;②目录指南：按某种分类规则，如按年代、地理位置、主题类目等建成树状等级目录。最常见 于主题目录分类，如Yahoo等。支持菜单式检索，此法检出结果可靠，查准率较高，但查 全率较低；③混合查询：既可键入关键词、短语等，也可按分类目标浏 览查询，且有混合型逐渐替代单一型之势，如Infoseek等。
2.1.2 按查询范围分类:①普通检索工具：通过一种检索工具检索到相应的信息。各个独立的检索工具都有自己的特点 ，如分类查询、简单查询、高级查询等是目前访问率最高的检索工具，如Alta Vista是目 前网上搜索内容最详尽的引擎;②复合式网络搜索工具：此类搜索调用多个独立检索工具的数据库加以收集、整理，并在若干 个检 索工具中同时查询，作出相关度排序后，显示查询结果。此法检出网址较多，较全面，如美 商资讯人公司开发的IQ网际搜寻家99软件。
, http://www.100md.com
2.1.3 按语种分类：①单语种检索工具：只能用一种语言查询者，如Healthgate；②多语种检索工具：可用多种语言在同一检索工具中查询者，如Alta Vista，可使用25种语言 进行查询。
2.1.4 按应用对象分类：①通用检索工具：如Yahoo!、Alta、Vista等是综合性的信息检索系统；②专业检索工具：如Pubmed、Medical、Matrix等是医学专业信息机构根据医学需求，将Inter net上医学资源进行筛选整理，重新组织而形成的医学专业信息指南，专业针对性较强。
3 生物医学网络资源检索应用
3.1 医学数据库
Internet上的医学数据库包括MEDLINE、CANCERLIT、PHYSICIAN DATA QUERY等，其Web检索 界面简单直观，可免费获取和享用。其中MEDLINE是美国国立医学图书馆MEDLARS系统中最 大的生物医学数据库，内容涵盖医学各领域，是目前医学专业人员使用频率最高的生物医学 数据库。
, http://www.100md.com
3.1.1 Pubmed：Pubmed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed)由美国国立医学图书馆(NLM)附属国立 生物 技术信息中心(NCBI)研制，包括medline、premedline和pubisher supplied citations，其 中Medline收录1966年以来70多个国家3900多种生物医学期刊，内容每周更新，涉及临床医 学、基础医学、护理学、牙科学、兽医学、药理学、环境和公共卫生等专业，80%以上有英 文摘要。
Pubmed的主页上列有多种检索方式供选择，如Basic Search、 Advanced Search、 The MeS H Browser、 Clinical Queries、 The Journal Browser以及 The Citaion Matcher等，只 要点击工具栏中相应的按钮，便可进入该种检索方式，支持关键词、著者(姓在前，名在后) 或刊名检索，并在详细记录格式的每条记录间建立了相关链接，部分期刊可免费获取全文， 如 Science、Pediatrics等。
, 百拇医药
3.1.2 HealthGate：HealthGate(http://www.healthgate.com)是由healthGate Data Corp公司的专业人员以 科 学性和权威性的高标准设置的生物医学信息网站、它将许多优秀的医学数据库集成在一起， 其内容涉及医学、行为医学、药物学、护理学、病人教育和医学继续教育等。拥有一些免 费提供信息的医学数据库，如AIDSDRUGS、AIDSLINE、AIDSTRIALS、MEDLINE、CANCERLIT等 。
HealthGate使用ReADER转换功能，能将用户的检索词或语句自动转换成MeSH词表中的主 题词进行检索，从而可获得较佳的检索结果。它有基本和高级两个检索界面。
3.1.3 Medical Matrix：Medical Matrix(医源) (http://www.medmatrix.org)由Healthtel Corporation创建， 其 目标是在国际学术机构协作下成为“21世纪的Medline”。医源为了统计用户专业类型和使 用目的，以便调整和完善其数据库内容，并将最新动态及时通知用户，网络用户第一次使用 时 需先注册(免费)。该网站属概念驱动的智能检索工具，包括4000个医学网址分为7大类；专 业和疾病(specialty and disease Categorized Information)、临床实践(Clinical Pr actice)、文献(literature)、教育(Education)、卫生保健和职业(Healthcare and profes sionals)、计算机和医学交互网技术(Computors, medical Internet and Technology)、以 及市场(Marketplace)等，并将各大类内容进一步细分为不同的小类，每个类名旁标出该类 目所包含的网址。它提供关键词检索和分类检索。
, http://www.100md.com
3.2 生物医学数据库
目前在Internet上已有近千个生物医学Web网站，可及时为科研人员提供核苷酸序列、蛋白 质序列、蛋白质结构预测、蛋白质三维结构等生物医学信息，成为生物医学研究不可缺少的 工具。近年来，许多生物医学技术公司和研究机构又开发出集成的生物医学信息服务系统和 综合软件包。令人遗憾的是必须支付昂贵的入网费用后方可检索，但也有免费生物医学信息 服务供我们利用。
3.2.1 美国生物技术信息中心基因系列(National Center for Biotechnology Information,NCBI)(http:// www.ncbi.nlm.nih.gov)：该中心于1982年创建了Genbank数据库，1991年又开发出 Entrez sequences数据库。该网站主页包括7个大类：①Pubmed:可免费获取Medline、premedline 的信息，并可通过记录间相关链接，获取基 因序列、蛋白质序列以及蛋白质三维结构等生物医学信息；②Entrez: 可获取核苷酸、蛋白质序列，蛋白质三维结构，基因组信息，生物学门类以 及Medline和Premedline的信息；③BLAST:可进行核苷酸序列、蛋白质序列等方面的同源性分析；④BanKIt:向GenbanK数据库提交新发现或新测定的核苷酸序列，以便获得GenBanK分配的基 因存取号；⑤QMIM:孟德尔遗传学；⑥Taxonomy：生物学门类；⑦Structure：蛋白质三维结构。
, http://www.100md.com
3.2.2 美国Whitehead生物医学研究所PCR最佳引物设计：美国Whitehead生物医学研究所基因组研究中心(The Center for Genome Research at the whitehe ad Institute for Biomedical Research)(http://www.genome.wi.mit.edu)的Web服 务器 提供以下信息：基因组序列、基因组图谱、基因组中心的软件以及该中心的研究人员。其中 软件组中的Primer 3程序可自动设计PCR最佳引物，从中获得设计最佳引物应满足的条件和 原则。
3.2.3 瑞士日内瓦大学专家蛋白质分析系统(Expert protenin analysis system, EXPASY)(http:/ /expasy.hcuge.ch)：是1994年瑞士日内瓦大学A.Bairoch等开发的第一个分子生物学Web 服务器，它拥有最全面的分析蛋白质和核苷酸序列的软件程序。
此外介绍以下几个网站，供感兴趣者使用。
, 百拇医药
①网络医学：http://www.cyber\|med.com；②中国卫生事业：http://www.imicams.ac.cn其中包括中国生物医学文献和数据库和In ternet 网络信息查询等几栏目;③世界卫生组织：http://www.who.ch;④国际红十字会：http://www.icrc.ch;⑤中国国家卫生部：http://www.moh.gov.cn;⑥全球紧急医疗服务：http://www.homecom.com/globalmed;⑦美国医学会12种杂志：http://www.ama-assn.org其中 Internal Medicine homepage的htt p://www.am-assn.org/internal;⑧美国心脏学会五种杂志：http://www.ahajournals.org
(收稿日期：2000-01-24), 百拇医药
单位：兰州医学院第一附属医院，甘肃省兰州市，730000)
关键词：
心血管病康复医学杂志000301
在信时代如何快捷地掌握信息技术手段，用好信息资源，特别是医学工作者利用Internet提 供 的医学信息数据，具有极其重要的意义。因此，本文就有关Internet的功能及其常用医学搜 索引擎作以介绍。
1 Interner上的资源
Internet上的资源主要有超级计算中心、图书文献中心、技术资料中心、公共软件库、科学 数据库、地址目录库及信息库等。随着Internet资源的日益丰富，在专业人员的指导下查询 信息就显得尤为重要。所提供服务大部分是免费的，其基本服务主要有下列几项：
, http://www.100md.com
1.1 电子邮件(E-mail)
是一种通过Inernet与其他用户进行联系，方便、快捷、价廉的现 代化通信手段，并在信息获取，科研合作等方面提供了非常重要的帮助，也是目前Internet 用户使用最为频繁的服务功能，是用户最先接触到的Internet功能。目前Web浏览器的软 件Netscape commnicator和Microsoft Internet Explorer都包含电子邮件客户软件，其设 备和操作都很简单，用户可在网上浏览的同时，收发电子邮件。
1.2 文件传输(FTP)
按照FTP(FiIe Transfer Protocol,文件传输协议)提供任意两台计算 机之间相互传输文件的功能。用户可使用windows 95专用FTP客户软件，或直接使用更为 简单，也不具备转送整个目录的功能。
1.3 远程登录(Telnet)
, 百拇医药
用户使用远程登录命令，可以使自己的计算机暂时成为远程计算 机的一个仿真终端。远程登录允许任意类型计算机之间进行通信，但目前Telnet的应用已经 越来越少，主要在于个人计算机性能已增强；Te ln et服务器安全性欠佳，一旦用户享有足够权限，便可随意操纵系统及文件；Telnet对初学者 来说不易学习掌握。
1.4 网络新闻(Usenet)
用户通过Internet并遵守网络礼仪可参与上万个几乎履盖当今生活全 部内容的新闻交流和讨论。上网的用户只要在计算机上安装一个新闻组阅读器软件，即可完 成申请加入新闻组，从服务器上读取新闻组消息，编写要发表的消息，并把它发送到服务器 等功能的程序，也可直接用Netscape communicator 软件的Collabra组件阅读新闻。
1.5 网络检索工具
目前基本的网络工具有Archie、Gopher及Wais，其中Archie只检索文 件名，不检索文件本身内容，Gopher只检索文件的类别和提要，也不检索文件的内容，而 WAIS则按照用户所给出的关键词对文件内容进行全文检索(fulltext seareh)。
, 百拇医药
1.6 全球网(WorId wide web, WWW)
也称万维网，是目前 Internet 上最方便、使用最 火爆的信息服务类型。WWW除了浏览外，也具有检索功能。通过WWW可以存取世界各地的超 媒体文件，包括文字、图形、声音、动画、资料库及各种软件。理论上WWW包括整个Int ernet世界，包含所有的Web站点，Gpher信息站、FTP档案库、Telnet公共存取帐号、Ne ws(新闻)讨论组，以及WAIS资料库。可以说WWW是当今全球最大的电子资料库，已经可以涵 盖Internet，通过它可以实现与其他Web网站之间的链接，达到信息资源共享。
2 WWW信息检索
WWW上存储着大量的信息资源，如各种类型的数据库，图书馆电子资源，国际组织、大学机 构、新闻报道、金融贸易以及购物、娱乐等信息，它已成为科研、教育、商务和社会信息在 全球 范围内传播的主要渠道。为了帮助人们快捷地获取所需信息，计算机和信息管理专家探索和 开发了一系列WWW检索工具-搜索引擎，用于网络资源的管理和检索。WWW基于超文本标记语 言(html),通过关键词在超文本、超媒体信息间建立起网状链接，实现了Internet上不同型 号计算机间简捷而自由的链接。
, 百拇医药
2.1 WWW检索工具类型
目前网上的检索工具已达到500余种，其分类如下：
2.1.1 按信息组织和查询方式分类：①查询引擎：也称检索引擎，即通过Robert、Spider等软件自动搜寻网络资源，并自动排 序或索引，形成一个庞大的主页信息数据库，如AIta Vista等。支持关键词或短语词查询 ，该类引擎查全率较高，但查准率较低;②目录指南：按某种分类规则，如按年代、地理位置、主题类目等建成树状等级目录。最常见 于主题目录分类，如Yahoo等。支持菜单式检索，此法检出结果可靠，查准率较高，但查 全率较低；③混合查询：既可键入关键词、短语等，也可按分类目标浏 览查询，且有混合型逐渐替代单一型之势，如Infoseek等。
2.1.2 按查询范围分类:①普通检索工具：通过一种检索工具检索到相应的信息。各个独立的检索工具都有自己的特点 ，如分类查询、简单查询、高级查询等是目前访问率最高的检索工具，如Alta Vista是目 前网上搜索内容最详尽的引擎;②复合式网络搜索工具：此类搜索调用多个独立检索工具的数据库加以收集、整理，并在若干 个检 索工具中同时查询，作出相关度排序后，显示查询结果。此法检出网址较多，较全面，如美 商资讯人公司开发的IQ网际搜寻家99软件。
, http://www.100md.com
2.1.3 按语种分类：①单语种检索工具：只能用一种语言查询者，如Healthgate；②多语种检索工具：可用多种语言在同一检索工具中查询者，如Alta Vista，可使用25种语言 进行查询。
2.1.4 按应用对象分类：①通用检索工具：如Yahoo!、Alta、Vista等是综合性的信息检索系统；②专业检索工具：如Pubmed、Medical、Matrix等是医学专业信息机构根据医学需求，将Inter net上医学资源进行筛选整理，重新组织而形成的医学专业信息指南，专业针对性较强。
3 生物医学网络资源检索应用
3.1 医学数据库
Internet上的医学数据库包括MEDLINE、CANCERLIT、PHYSICIAN DATA QUERY等，其Web检索 界面简单直观，可免费获取和享用。其中MEDLINE是美国国立医学图书馆MEDLARS系统中最 大的生物医学数据库，内容涵盖医学各领域，是目前医学专业人员使用频率最高的生物医学 数据库。
, http://www.100md.com
3.1.1 Pubmed：Pubmed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed)由美国国立医学图书馆(NLM)附属国立 生物 技术信息中心(NCBI)研制，包括medline、premedline和pubisher supplied citations，其 中Medline收录1966年以来70多个国家3900多种生物医学期刊，内容每周更新，涉及临床医 学、基础医学、护理学、牙科学、兽医学、药理学、环境和公共卫生等专业，80%以上有英 文摘要。
Pubmed的主页上列有多种检索方式供选择，如Basic Search、 Advanced Search、 The MeS H Browser、 Clinical Queries、 The Journal Browser以及 The Citaion Matcher等，只 要点击工具栏中相应的按钮，便可进入该种检索方式，支持关键词、著者(姓在前，名在后) 或刊名检索，并在详细记录格式的每条记录间建立了相关链接，部分期刊可免费获取全文， 如 Science、Pediatrics等。
, 百拇医药
3.1.2 HealthGate：HealthGate(http://www.healthgate.com)是由healthGate Data Corp公司的专业人员以 科 学性和权威性的高标准设置的生物医学信息网站、它将许多优秀的医学数据库集成在一起， 其内容涉及医学、行为医学、药物学、护理学、病人教育和医学继续教育等。拥有一些免 费提供信息的医学数据库，如AIDSDRUGS、AIDSLINE、AIDSTRIALS、MEDLINE、CANCERLIT等 。
HealthGate使用ReADER转换功能，能将用户的检索词或语句自动转换成MeSH词表中的主 题词进行检索，从而可获得较佳的检索结果。它有基本和高级两个检索界面。
3.1.3 Medical Matrix：Medical Matrix(医源) (http://www.medmatrix.org)由Healthtel Corporation创建， 其 目标是在国际学术机构协作下成为“21世纪的Medline”。医源为了统计用户专业类型和使 用目的，以便调整和完善其数据库内容，并将最新动态及时通知用户，网络用户第一次使用 时 需先注册(免费)。该网站属概念驱动的智能检索工具，包括4000个医学网址分为7大类；专 业和疾病(specialty and disease Categorized Information)、临床实践(Clinical Pr actice)、文献(literature)、教育(Education)、卫生保健和职业(Healthcare and profes sionals)、计算机和医学交互网技术(Computors, medical Internet and Technology)、以 及市场(Marketplace)等，并将各大类内容进一步细分为不同的小类，每个类名旁标出该类 目所包含的网址。它提供关键词检索和分类检索。
, http://www.100md.com
3.2 生物医学数据库
目前在Internet上已有近千个生物医学Web网站，可及时为科研人员提供核苷酸序列、蛋白 质序列、蛋白质结构预测、蛋白质三维结构等生物医学信息，成为生物医学研究不可缺少的 工具。近年来，许多生物医学技术公司和研究机构又开发出集成的生物医学信息服务系统和 综合软件包。令人遗憾的是必须支付昂贵的入网费用后方可检索，但也有免费生物医学信息 服务供我们利用。
3.2.1 美国生物技术信息中心基因系列(National Center for Biotechnology Information,NCBI)(http:// www.ncbi.nlm.nih.gov)：该中心于1982年创建了Genbank数据库，1991年又开发出 Entrez sequences数据库。该网站主页包括7个大类：①Pubmed:可免费获取Medline、premedline 的信息，并可通过记录间相关链接，获取基 因序列、蛋白质序列以及蛋白质三维结构等生物医学信息；②Entrez: 可获取核苷酸、蛋白质序列，蛋白质三维结构，基因组信息，生物学门类以 及Medline和Premedline的信息；③BLAST:可进行核苷酸序列、蛋白质序列等方面的同源性分析；④BanKIt:向GenbanK数据库提交新发现或新测定的核苷酸序列，以便获得GenBanK分配的基 因存取号；⑤QMIM:孟德尔遗传学；⑥Taxonomy：生物学门类；⑦Structure：蛋白质三维结构。
, http://www.100md.com
3.2.2 美国Whitehead生物医学研究所PCR最佳引物设计：美国Whitehead生物医学研究所基因组研究中心(The Center for Genome Research at the whitehe ad Institute for Biomedical Research)(http://www.genome.wi.mit.edu)的Web服 务器 提供以下信息：基因组序列、基因组图谱、基因组中心的软件以及该中心的研究人员。其中 软件组中的Primer 3程序可自动设计PCR最佳引物，从中获得设计最佳引物应满足的条件和 原则。
3.2.3 瑞士日内瓦大学专家蛋白质分析系统(Expert protenin analysis system, EXPASY)(http:/ /expasy.hcuge.ch)：是1994年瑞士日内瓦大学A.Bairoch等开发的第一个分子生物学Web 服务器，它拥有最全面的分析蛋白质和核苷酸序列的软件程序。
此外介绍以下几个网站，供感兴趣者使用。
, 百拇医药
①网络医学：http://www.cyber\|med.com；②中国卫生事业：http://www.imicams.ac.cn其中包括中国生物医学文献和数据库和In ternet 网络信息查询等几栏目;③世界卫生组织：http://www.who.ch;④国际红十字会：http://www.icrc.ch;⑤中国国家卫生部：http://www.moh.gov.cn;⑥全球紧急医疗服务：http://www.homecom.com/globalmed;⑦美国医学会12种杂志：http://www.ama-assn.org其中 Internal Medicine homepage的htt p://www.am-assn.org/internal;⑧美国心脏学会五种杂志：http://www.ahajournals.org
(收稿日期：2000-01-24), 百拇医药