16S～23SrDNA内转录间隔区序列分析及其在分支杆菌鉴定中的应用价值
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解放军第三○九医院结核病研究室；中国药品生物制品检定所；上海市疾病预防控制中心 100091北京 李国利；庄
分支杆菌|鉴定|内转录间隔区|聚合酶链反应|序列分
参见附件(70kb)。
解放军第三○九医院结核病研究室；中国药品生物制品检定所；上海市疾病预防控制中心 100091北京 李国利；庄玉辉；赵铭；王国治；范以虎；陈保文；胡忠义
关键词：分支杆菌；鉴定；内转录间隔区；聚合酶链反应；序列分
摘要：目的 研究16S～23SrDNA内转录间隔区(internaktranscribedspacer,ITS)序列在分支杆菌鉴定中的应用价值。方法 应用PCR 直接测序法对22种30株分支杆菌参考菌株和16株分支杆菌临床分离菌株16S～23SrDNAITS测序。对所测定序列以及GenBank所报道的有关序列用Ckustak程序(MegAkignPackage[WindowsVersion4 01];DNASTAR,Madson,Wis)处理分析,计算种间相似性,用PHYLIPPackage构建分支杆菌菌种聚类分析树状谱。结果 除结核分支杆菌复合群(MTC)菌种(结核分支杆菌、牛分支杆菌、非洲分支杆菌和田鼠分支杆菌)16S～23SrDNAITS序列完全一致外,其它分支杆菌菌种间核苷酸排列顺序及长度变异较大,种间相似性为30 4%～86 5%,聚类分析树状谱能将各分支杆菌菌种相分离。结果表明16S～23SrDNAITS序列分析能将MTC与非结核分支杆菌(NTM)相鉴别,能将NTM鉴定至种的水平。结论 16S～23SrDNAITS可做为分支杆菌鉴定的靶基因。
解放军第三○九医院结核病研究室；中国药品生物制品检定所；上海市疾病预防控制中心 100091北京 李国利；庄玉辉；赵铭；王国治；范以虎；陈保文；胡忠义
关键词：分支杆菌；鉴定；内转录间隔区；聚合酶链反应；序列分
摘要：目的 研究16S～23SrDNA内转录间隔区(internaktranscribedspacer,ITS)序列在分支杆菌鉴定中的应用价值。方法 应用PCR 直接测序法对22种30株分支杆菌参考菌株和16株分支杆菌临床分离菌株16S～23SrDNAITS测序。对所测定序列以及GenBank所报道的有关序列用Ckustak程序(MegAkignPackage[WindowsVersion4 01];DNASTAR,Madson,Wis)处理分析,计算种间相似性,用PHYLIPPackage构建分支杆菌菌种聚类分析树状谱。结果 除结核分支杆菌复合群(MTC)菌种(结核分支杆菌、牛分支杆菌、非洲分支杆菌和田鼠分支杆菌)16S～23SrDNAITS序列完全一致外,其它分支杆菌菌种间核苷酸排列顺序及长度变异较大,种间相似性为30 4%～86 5%,聚类分析树状谱能将各分支杆菌菌种相分离。结果表明16S～23SrDNAITS序列分析能将MTC与非结核分支杆菌(NTM)相鉴别,能将NTM鉴定至种的水平。结论 16S～23SrDNAITS可做为分支杆菌鉴定的靶基因。
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