日本血吸虫一个新钙结合蛋白全长编码区的克隆与功能预测
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第一军医大学热带军队卫生学系寄生虫学教研室；中山大学生物防治国家重点实验室 广州；510275 彭鸿娟；陈晓
日本血吸虫|基因功能预测|钙结合蛋白
参见附件(50kb)。
第一军医大学热带军队卫生学系寄生虫学教研室；中山大学生物防治国家重点实验室 广州；510275 彭鸿娟；陈晓光；王珣章
关键词：日本血吸虫；基因功能预测；钙结合蛋白
摘要：目的 对用表达序列标签 (ExpressionSequenceTag ,EST)策略从日本血吸虫尾蚴cDNA文库中筛选出的新基因进行功能预测。方法 用NCBI站点的BLASTx及BLASTn程序对所获得的新基因序列进行同源性搜索 ;用NCBIBLAST站点的blasttwosequence程序对同源性高的基因进行核苷酸及氨基酸水平的同源性比较 ;利用motifscaninaProteinsequence对cDNA序列所编码的蛋白质进行结构域搜索。结果 发现一个与曼氏血吸虫尾蚴期特异性 8kDa钙结合蛋白 (Sm8)基因高度同源的日本血吸虫新基因 ,cDNA序列与氨基酸水平的同一性均为 82 % ;蛋白结构域搜索结果显示 ,该cDAN序列所编码.
第一军医大学热带军队卫生学系寄生虫学教研室；中山大学生物防治国家重点实验室 广州；510275 彭鸿娟；陈晓光；王珣章
关键词：日本血吸虫；基因功能预测；钙结合蛋白
摘要：目的 对用表达序列标签 (ExpressionSequenceTag ,EST)策略从日本血吸虫尾蚴cDNA文库中筛选出的新基因进行功能预测。方法 用NCBI站点的BLASTx及BLASTn程序对所获得的新基因序列进行同源性搜索 ;用NCBIBLAST站点的blasttwosequence程序对同源性高的基因进行核苷酸及氨基酸水平的同源性比较 ;利用motifscaninaProteinsequence对cDNA序列所编码的蛋白质进行结构域搜索。结果 发现一个与曼氏血吸虫尾蚴期特异性 8kDa钙结合蛋白 (Sm8)基因高度同源的日本血吸虫新基因 ,cDNA序列与氨基酸水平的同一性均为 82 % ;蛋白结构域搜索结果显示 ,该cDAN序列所编码.
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