水稻苯丙氨酸氨解酶基因在大肠杆菌BL21DE3中的表达
作者:蔡朱男 余应年 罗建红 钱羽力 陈星若
单位:(浙江大学医学院病理生理教研室,浙江 杭州 310031)
关键词:苯丙氨酸氨裂合酶;基因重排;质粒;大肠杆菌
中国病理生物杂志000103
[摘 要] 目的:探索水稻苯丙氨酸氨解酶基因在大肠杆菌中的表达及其规律,为治疗苯丙酮尿症奠定基础。方法:应用基因工程技术,将水稻苯丙氨酸氨解酶的cDNA(rPAL-1-cDNA)重组入大肠杆菌高效表达质粒pET-28c,通过异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)诱导,在大肠杆菌中获得表达。结果:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳表明,诱导1,3,5,7 h后,表达蛋白量占菌体总蛋白分别为21.40%, 30.60%, 35.40%, 35.43%,融合蛋白His6-rPAL分子量为78.6 kDa,主要以包涵体形式存在。结论:建立了水稻苯丙氨酸氨解酶基因的大肠杆菌表达株。
, 百拇医药
[中图分类号] Q786 [文献标识码] A
[文章编号] 1000-4718(2000)01-0012-05
Expression of phenylalanine ammonia-lyase cDNA from rice in E. coli BL21DE3
CAI Zhu-nan, YU Ying-nian, LUO Jian-hong, QIAN Yu-li, CHEN Xiang-ruo
(Depatment of Pathophysiology, Medical School, Zhejiang University, Hangzhou 310031, China)
[Abstract] AIM: To study the expression and its kinetics of rice phenylalanine ammonia-lyase gene encoding into E. coli as the basis of treatment for phenylketouria. METHODS: The phenylalanine ammonia-lyase-1-cDNA(rPAL-1-cDNA) from rice was recombined into E. coli high expression vector pET-28c and transformed into E. coli host strain BL21DE3. Engineering bacteria was then inducted by isopropyl-β-D-thiogalactoside (IPTG) for 1, 3, 5, 7 hours, in order to obtain high level expression. RESULTS: After induction, the expression level of fusion protein was 21.40%, 30.60%, 35.40%, 35.43% respectively. The fusion protein exhibited a band of 78.6 kD on SDS-PAGE analysis,but was not found in controls.The target protein was mainly existed in the form of inclusion body. CONCLUSION:Rice PAL gene expressing E. coli was established by gentic engineering technique.
, http://www.100md.com
[MeSH] Phenylalanine ammonia-lyase; Gene rearrangement; Plasmid; Escherichia coli
遗传性缺乏苯丙氨酸羟化酶所致的苯丙酮尿症是人类常见的先天性苯丙氨酸代谢缺陷病,是引起先天性智力降低的主要原因之一。为防止痴呆的发生,在出生后至发育期必需服用不含或含极少量苯丙氨酸的合成食物,费用十分昂贵。用酶在肠道内/外将消化后的苯丙氨酸降解,是一个有希望的取代途径。苯丙氨酸氨解酶(L-phenylalanine ammonia lyase, PAL)广泛分布于植物和某些真菌中[1],它可使苯丙氨酸降解为无毒的苯丙烯酸。在动物实验中证明,口服该酶可降低实验性苯丙酮尿症动物血清中异常增高的苯丙氨酸浓度[2, 3],已有学者研究将该酶固化后,口服用于治疗苯丙酮尿症[4, 5]。尽管PAL在临床治疗应用中具有良好的前景,但无法从真菌和高等植物细胞中大量提取PAL,为此,试图应用基因工程技术探索从大肠杆菌中获取大量廉价的PAL,藉以通过口服在肠道内消除苯丙氨酸,或用于生产廉价的无苯丙氨酸食物,达到治疗苯丙酮尿症的目的。
, http://www.100md.com
材 料 和 方 法
一、菌株和质粒:
大肠杆菌DH5α和BL21DE3为本实验室保存;pUC19-rPAL-cDNA质粒由日本国立农业生物研究所Ei-ichi Minami博士惠赠;质粒pET-28a,b,c
为美国Novagen公司产品。
二、酶及主要试剂:
EcoR I为德国Boehringer Mannheim公司产品;BamH I, IPTG为日本Takara公司产品;牛小肠碱性磷酸酶(CIP),T4DNA连接酶,丙烯酰胺及亚甲基双丙烯酰胺为美国Promega公司产品;DNA分子量标准λDNA/Hind Ⅲ及中分子量标准蛋白质购自上海生工生物工程公司;N, N, N', N'-四甲基乙二胺(TEMED)为美国Bio-Rad公司产品;引物5' TGGATCTTGACCAGCGGCT 3'由上海生工生物工程公司合成;测序试剂Terminator cycle sequence kit购自美国Perkin Elmer公司。
, 百拇医药
三、pUC19-rPAL-1-cDNA部分测序及表达载体的选择:
按文献[6],将质粒pUC19-rPAL-1-cDNA转化大肠杆菌DH5α,并加以扩增。根据文献[7~9]在水稻苯丙氨酸氨解酶基因(GenBank/EMBL, Accession number: x16099)ATG下游131-112碱基段设计测序引物5' TGGATCTTGACCAGCGGCT 3',对pUC19-rPAL-1-cDNA质粒进行反向测序。测序按Perkin Elmer公司推荐的BigDye标记终止碱基双脱氧法在ABI PrismTM310自动序列分析仪上进行。根据测序结果,在表达质粒pET-28系列中,选择与之相匹配的表达载体。
四、表达质粒的构建:
用EcoR I酶将pET-28c从多克隆位点处切开,在其5'端用牛小肠碱性磷酸酶(CIP)脱去磷酸,纯化后溶于双蒸水中备用。
, http://www.100md.com
用EcoR I酶切质粒pUC19-rPAL-1-cDNA,通过1.5%琼脂糖凝胶电泳分离(80V 4 h),切取2.5kb的rPAL-1-cDNA条带,用透析袋法回收,经酚、氯仿抽提,乙醇沉淀纯化,溶于双蒸水。
按文献[6]描述步骤用T4DNA连接酶将2.5kb rPAL-1-cDNA与5'端脱磷酸之线性pET-28c连接重组成表达质粒,连接时取插入片段DNA与pET-28c DNA的摩尔比为3∶1。连接产物转化感受态大肠杆菌BL21DE3, 在含有卡那霉素的LB平板上,筛选出阳性克隆。
五、鉴定插入方向:
根据rPAL-1-cDNA及pET-28c酶切图谱,选用BamH I酶切重组质粒,鉴定插入方向。并用测序引物对重组质粒PET-28c-rPAL-1-cDNA进行测序,进一步确定其插入方向及阅读框架。
, 百拇医药
六、工程菌的诱导表达及SDS-聚丙酰胺凝胶电泳分析:
挑取正向插入克隆,接种于含50 μg/mL卡那霉素的LB培养基中,37℃振荡培养16 h,以1∶200比例接种于新鲜的含抗生素的培养基中, 37℃振荡培养2.5 h进行扩增,取100 mL菌液作为诱导前对照。然后加入终浓度为1 mmol/L的异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG),在37℃振荡培养中诱导工程菌表达,分别于诱导1,3,5,7 h四时间点取样,以BL21DE3及经pET-28c空载体转化的BL21DE3为对照,在超声裂解液中将大肠杆菌超声破碎,200 W 10 s,停10 s,重复10次。4 ℃ 15 000 r/min离心15 min,上清液和沉淀分别进行10% SDS-聚丙酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),200 V,30 min,考马斯亮兰染色,结果经Kodak digital scienceTM电泳扫描仪分析确定其分子量及蛋白表达量。
, 百拇医药
Fig 1 The partial sequence of pET-28a, b, c, pUC19-rPAL-1-cDNA and expected recombinant expression plasmid pET-28c-rPAL-1-cDNA
图1 pET-28a, b, c, pUC19-rPAL-1-cDNA及预期重组表达质粒pET-28c-rPAL-1-cDNA部分序列
结 果
一、表达质粒pET-28系列的选择:
应用测序引物对质粒pUC19-rPAL-1-cDNA进行部分测序,结果见图1。从rPAL-1-cDNA序列中首先找出翻译起始密码ATG,根据3个碱基编码1个氨基酸的原则,由此往上推算可知,要求表达载体在EcoR I接头处的三联体结构必需具备与之相匹配的ATT框架。对比大肠杆菌表达质粒pET-28a, b, c部分序列,发现在重组后,能保持正确阅读框架,而不发生移码的只有pET-28c符合要求。若rPAL-1-cDNA正向插入pET-28c 多克隆位点上的EcoR I位点,预期重组后的表达质粒部分序列应如图1所示。
, 百拇医药
二、重组表达质粒构建及酶切分析:
rPAL-1-cDNA大小为2519 bp,pET-28c大小为5367 bp,通过T4 DNA连接酶连接后的重组表达质粒应为7886 bp。挑取四个重组阳性克隆,经EcoR I酶切图谱鉴定,所得片段符合预计大小(见图2,lane2, 4, 6, 8)。由于应用单酶切插入目的基因所获得的重组质粒,存在着正反两种插入方向。为了获得所需的正向插入重组克隆,经查阅GenBank, 在对rPAL-1-cDNA及pET-28c质粒的酶切图谱分析后,选用各自都只有一个酶切位点并能显著区分正反插入方向的BamH I进行酶切鉴定。根据理论分析,经BamH I酶切后可能出现的二种情况如下:正向插入生成的二个片段大小预计应为337bp和7549 bp,反向插入分别为2194 bp和5692 bp(见图3)。四个重组克隆的BamH I酶切图谱见图2,lane 1, 3, 5, 7。由此可知,获得了3个正向插入重组克隆和1个反向插入重组克隆。
, 百拇医药 三、重组质粒测序:
重组表达质粒测序结果如图4所示,与设计时预期的完全相同。说明该重组质粒已正向插入目的基因,对阅读框架分析,完全肯定了该质粒能正确表达rPAL-1-cDNA。
四、10% SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳及扫描分析:
以大肠杆菌BL21DE3和经pET-28c质粒转化的BL21DE3为对照,与经pET-28c-rPAL-1-cDNA 转化的BL21DE3在同等条件下按照方法六项中描述的方法进行扩增、诱导表达、裂解和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,结果如图5。工程菌在分子量66.2 kD和97.4 kD间,出现明显的表达条带,表达的目的蛋白主要存在于沉淀中(以包涵体形式存在),而对照组BL21DE3及经pET-28c质粒转化的BL21DE3都没有出现。IPTG诱导5和7 h时蛋白表达量最高,表达产物His-rPAL的分子量为78.6 kD,与文献报导一致。IPTG诱导1,3,5,7 h蛋白表达量占菌体总蛋白量的百分数分别为21.40%, 30.60%, 35.40%, 35.43%。
, http://www.100md.com
Fig 2 Restriction map analysis of recombinant plasmids, pET-28c-rPAL-1-cDNA
Lane 1, 3, 5, 7:pET-28c-rPAL-1-cDNA cut with BamH I respectively; Lane 2, 4, 6, 8: pET-28c-rPAL-1-cDNA cut with EcoR I respectively; Lane 9: pET-28c plasmid; Lane 10: λDNA/Hind Ⅲ marker
图2 重组质粒pET-28c-rPAL-1-cDNA 的酶切分析
Fig 3 Restriction enzyme map analysis of expected recombinant plasmid pET-28c-rPAL-1-cDNA
, http://www.100md.com
图3 预期重组质粒pET-28c-rPAL-1-cDNA 的酶切分析
Fig 4 The partial sequencing results of recombinant expression plasmid PET-28c-rPAL-1-cDNA
图4 重组表达质粒PET-28c-rPAL-1-cDNA部分序列测定结果
Fig 5 10% SDS-PAGE analysis of the expressed product in pellet of E. coli BL21DE3 harboring plasmid pET-28c-rPAL-1-cDNA
, http://www.100md.com
Lane 1: E. coli BL21DE3 control; 2: pET-28c vector control; 3: Protein molecular weight marker(97.4, 66.2, 43.0, 31.0, 20.1 kD); 4: pET-28c-rPAL-1-cDNA
before IPTG induction; 5~8: pET-28c-rPAL-1-cDNA after IPTG induction for 1, 3, 5, 7 h, respectively
图5 大肠杆菌BL21DE3中pET-28c-rPAL-cDNA表达产物的SDS-PAGE分析
讨 论
Ei-ichi Minami博士克隆的水稻苯丙氨酸氨解酶基因全长4412 bp,由2个外显子和1个内含子组成。其克隆在pUC19质粒上的rPAL-1-cDNA,总长为2519 bp[7~9],起始部位加入了1个具有EcoR I酶切位点的人工接头,经对其DNA序列及酶切图谱分析,发现ATG上游存在79 bp,并且难于找到合适克隆于表达天然目的蛋白载体上的酶切位点,于是选用能在大肠杆菌中高效表达融合蛋白的pET-28a, b,c系列质粒,作为表达载体。然而表达融合蛋白的一个重要条件是真核基因的阅读框架必须与原核基因的阅读框架相符合或匹配。根据测序结果,经阅读框架核对,最终确定大肠杆菌表达质粒pET-28c作为表达rPAL-1-cDNA的重组载体。在BL21DE3宿主菌中,它既能应用异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)使lac阻遏蛋白失活,从而使T7启动子脱阻遏并诱导T7聚合酶,提高表达目的基因水平,同时,由于宿主菌不表达OmpT和Lon蛋白酶,因此表达产物又比较稳定,不会被宿主菌蛋白水解酶所降解。我们建株的工程菌,经超声破碎后的粗提物,按Zucker[10]建立的苯丙氨酸氨解酶活性测定方法,测得的酶比活性为461.7 nmol.g-1.min-1(结果准备另文发表)。该质粒还具有表达His6-Tag结构,便于应用Ni柱亲和层析,快速纯化,经凝血酶酶切,有可能获得具有活性的天然PAL。为今后PAL的基础研究(如高等植物中的UV反应,创伤防御,氧化应激,凋亡等[11~13])及临床治疗(如苯丙酮尿症)奠定了基础。
, 百拇医药
[基金项目] 浙江省自然科学基金资助(397463)
[参 考 文 献]
[1] Camm EL, Towers GHN. Review article phenylalanine ammonia lyase[J]. Phytochemistry, 1973, 12:961~973.
[2] Safos S, Chang TM. Enzyme replacement therapy in ENU2 phenylketonuric mice using oral microencapsulated phenylalanine ammonia lyase: a preliminary report[J]. Artif Cells Blood Substit Immobil Biotechnol, 1995, 23(6):681~692.
, 百拇医药
[3] Bourget L, Chang TMS. Phanylalanmine ammonia lyase immobilized in semipermeable microcapsules for enzyme replacement in phenylketonuria[J]. FEBS, 1985, 180(1):5~8.
[4] Shintaro I, Yuji M, Hiroadi I, et al. Entrapment of phenylalanine ammonia-lyase in silk fibroin for protection from proteolytic attack[J]. Biochem Biophys Res Commun, 1986,141(1):165~170.
[5] Chang TM, Bourget L, Lister C. A new theory of enterorecirculation of amino acids and its use for depleting unwanted amino acids using oral enzyme artificial cells, as in removing phenylalanine in phenylketonuria[J]. Artif Cells Blood Substit Immobil Biotechnol, 1995, 23(1):1~21.
, 百拇医药
[6] Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual[M]. 2th ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory, 1989. 1.60~1.91.
[7] Minami E, Ozeki Y, Matsueka M, et al. Structure and some characterization of the gene for phenylalanine ammonia lyase from rice plants[J]. FEBS, 1989, 185: 19~25.
[8] Zhu Q, Dabi T, Beeche A, et al. Cloning and properties of a rice gene encoding phenylalanine ammonia lyase[J]. Plant Mol Biol, 1995, 29(3): 535~550.
, 百拇医药
[9] Mimani E, Ozeki Y, Matsueka M, et al. Nucleotide sequence of the gene for phenylalanine ammonia lyase of rice and its deduced amino acid sequence[J]. Biochem Biophys Acta, 1993, 1171(3): 321~322.
[10] Zucker M. Induction of phenylalanine deaminase by light and its relation to chlorogenic acid synthesis in potato tuber tissue[J]. Plant Physiol, 1965, 40(5):779~784.
[11] Zhang S, Du H, Klessig DF. Activation of the tobacco SIP kinase by both a cell wall-derived carbohydrate elicitor and purified proteinaceous elicitins from phytophthosa ssp[J]. Plant Cell, 1998, 10(3): 435~450.
, 百拇医药
[12] Kabasek WL, Ausubel FM, Shirley BW. A light-independent developmental mechanism potentiates flavonoid gene expression in arabidosis seedings[J]. Plant Mol Biol, 1998, 37(2): 217~223.
[13] Kalbin G, Ohlsson AB, Berglund T, et al. Ultraviolet B radiation induced changes in nicotinamide and glutathione metabolism and gene expression in plants[J]. Eur J Biochem, 1997, 249(2): 466~472.
[收稿日期]1999-07-08 [修回日期]1999-10-07, http://www.100md.com
单位:(浙江大学医学院病理生理教研室,浙江 杭州 310031)
关键词:苯丙氨酸氨裂合酶;基因重排;质粒;大肠杆菌
中国病理生物杂志000103
[摘 要] 目的:探索水稻苯丙氨酸氨解酶基因在大肠杆菌中的表达及其规律,为治疗苯丙酮尿症奠定基础。方法:应用基因工程技术,将水稻苯丙氨酸氨解酶的cDNA(rPAL-1-cDNA)重组入大肠杆菌高效表达质粒pET-28c,通过异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)诱导,在大肠杆菌中获得表达。结果:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳表明,诱导1,3,5,7 h后,表达蛋白量占菌体总蛋白分别为21.40%, 30.60%, 35.40%, 35.43%,融合蛋白His6-rPAL分子量为78.6 kDa,主要以包涵体形式存在。结论:建立了水稻苯丙氨酸氨解酶基因的大肠杆菌表达株。
, 百拇医药
[中图分类号] Q786 [文献标识码] A
[文章编号] 1000-4718(2000)01-0012-05
Expression of phenylalanine ammonia-lyase cDNA from rice in E. coli BL21DE3
CAI Zhu-nan, YU Ying-nian, LUO Jian-hong, QIAN Yu-li, CHEN Xiang-ruo
(Depatment of Pathophysiology, Medical School, Zhejiang University, Hangzhou 310031, China)
[Abstract] AIM: To study the expression and its kinetics of rice phenylalanine ammonia-lyase gene encoding into E. coli as the basis of treatment for phenylketouria. METHODS: The phenylalanine ammonia-lyase-1-cDNA(rPAL-1-cDNA) from rice was recombined into E. coli high expression vector pET-28c and transformed into E. coli host strain BL21DE3. Engineering bacteria was then inducted by isopropyl-β-D-thiogalactoside (IPTG) for 1, 3, 5, 7 hours, in order to obtain high level expression. RESULTS: After induction, the expression level of fusion protein was 21.40%, 30.60%, 35.40%, 35.43% respectively. The fusion protein exhibited a band of 78.6 kD on SDS-PAGE analysis,but was not found in controls.The target protein was mainly existed in the form of inclusion body. CONCLUSION:Rice PAL gene expressing E. coli was established by gentic engineering technique.
, http://www.100md.com
[MeSH] Phenylalanine ammonia-lyase; Gene rearrangement; Plasmid; Escherichia coli
遗传性缺乏苯丙氨酸羟化酶所致的苯丙酮尿症是人类常见的先天性苯丙氨酸代谢缺陷病,是引起先天性智力降低的主要原因之一。为防止痴呆的发生,在出生后至发育期必需服用不含或含极少量苯丙氨酸的合成食物,费用十分昂贵。用酶在肠道内/外将消化后的苯丙氨酸降解,是一个有希望的取代途径。苯丙氨酸氨解酶(L-phenylalanine ammonia lyase, PAL)广泛分布于植物和某些真菌中[1],它可使苯丙氨酸降解为无毒的苯丙烯酸。在动物实验中证明,口服该酶可降低实验性苯丙酮尿症动物血清中异常增高的苯丙氨酸浓度[2, 3],已有学者研究将该酶固化后,口服用于治疗苯丙酮尿症[4, 5]。尽管PAL在临床治疗应用中具有良好的前景,但无法从真菌和高等植物细胞中大量提取PAL,为此,试图应用基因工程技术探索从大肠杆菌中获取大量廉价的PAL,藉以通过口服在肠道内消除苯丙氨酸,或用于生产廉价的无苯丙氨酸食物,达到治疗苯丙酮尿症的目的。
, http://www.100md.com
材 料 和 方 法
一、菌株和质粒:
大肠杆菌DH5α和BL21DE3为本实验室保存;pUC19-rPAL-cDNA质粒由日本国立农业生物研究所Ei-ichi Minami博士惠赠;质粒pET-28a,b,c
为美国Novagen公司产品。
二、酶及主要试剂:
EcoR I为德国Boehringer Mannheim公司产品;BamH I, IPTG为日本Takara公司产品;牛小肠碱性磷酸酶(CIP),T4DNA连接酶,丙烯酰胺及亚甲基双丙烯酰胺为美国Promega公司产品;DNA分子量标准λDNA/Hind Ⅲ及中分子量标准蛋白质购自上海生工生物工程公司;N, N, N', N'-四甲基乙二胺(TEMED)为美国Bio-Rad公司产品;引物5' TGGATCTTGACCAGCGGCT 3'由上海生工生物工程公司合成;测序试剂Terminator cycle sequence kit购自美国Perkin Elmer公司。
, 百拇医药
三、pUC19-rPAL-1-cDNA部分测序及表达载体的选择:
按文献[6],将质粒pUC19-rPAL-1-cDNA转化大肠杆菌DH5α,并加以扩增。根据文献[7~9]在水稻苯丙氨酸氨解酶基因(GenBank/EMBL, Accession number: x16099)ATG下游131-112碱基段设计测序引物5' TGGATCTTGACCAGCGGCT 3',对pUC19-rPAL-1-cDNA质粒进行反向测序。测序按Perkin Elmer公司推荐的BigDye标记终止碱基双脱氧法在ABI PrismTM310自动序列分析仪上进行。根据测序结果,在表达质粒pET-28系列中,选择与之相匹配的表达载体。
四、表达质粒的构建:
用EcoR I酶将pET-28c从多克隆位点处切开,在其5'端用牛小肠碱性磷酸酶(CIP)脱去磷酸,纯化后溶于双蒸水中备用。
, http://www.100md.com
用EcoR I酶切质粒pUC19-rPAL-1-cDNA,通过1.5%琼脂糖凝胶电泳分离(80V 4 h),切取2.5kb的rPAL-1-cDNA条带,用透析袋法回收,经酚、氯仿抽提,乙醇沉淀纯化,溶于双蒸水。
按文献[6]描述步骤用T4DNA连接酶将2.5kb rPAL-1-cDNA与5'端脱磷酸之线性pET-28c连接重组成表达质粒,连接时取插入片段DNA与pET-28c DNA的摩尔比为3∶1。连接产物转化感受态大肠杆菌BL21DE3, 在含有卡那霉素的LB平板上,筛选出阳性克隆。
五、鉴定插入方向:
根据rPAL-1-cDNA及pET-28c酶切图谱,选用BamH I酶切重组质粒,鉴定插入方向。并用测序引物对重组质粒PET-28c-rPAL-1-cDNA进行测序,进一步确定其插入方向及阅读框架。
, 百拇医药
六、工程菌的诱导表达及SDS-聚丙酰胺凝胶电泳分析:
挑取正向插入克隆,接种于含50 μg/mL卡那霉素的LB培养基中,37℃振荡培养16 h,以1∶200比例接种于新鲜的含抗生素的培养基中, 37℃振荡培养2.5 h进行扩增,取100 mL菌液作为诱导前对照。然后加入终浓度为1 mmol/L的异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG),在37℃振荡培养中诱导工程菌表达,分别于诱导1,3,5,7 h四时间点取样,以BL21DE3及经pET-28c空载体转化的BL21DE3为对照,在超声裂解液中将大肠杆菌超声破碎,200 W 10 s,停10 s,重复10次。4 ℃ 15 000 r/min离心15 min,上清液和沉淀分别进行10% SDS-聚丙酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),200 V,30 min,考马斯亮兰染色,结果经Kodak digital scienceTM电泳扫描仪分析确定其分子量及蛋白表达量。
, 百拇医药
Fig 1 The partial sequence of pET-28a, b, c, pUC19-rPAL-1-cDNA and expected recombinant expression plasmid pET-28c-rPAL-1-cDNA
图1 pET-28a, b, c, pUC19-rPAL-1-cDNA及预期重组表达质粒pET-28c-rPAL-1-cDNA部分序列
结 果
一、表达质粒pET-28系列的选择:
应用测序引物对质粒pUC19-rPAL-1-cDNA进行部分测序,结果见图1。从rPAL-1-cDNA序列中首先找出翻译起始密码ATG,根据3个碱基编码1个氨基酸的原则,由此往上推算可知,要求表达载体在EcoR I接头处的三联体结构必需具备与之相匹配的ATT框架。对比大肠杆菌表达质粒pET-28a, b, c部分序列,发现在重组后,能保持正确阅读框架,而不发生移码的只有pET-28c符合要求。若rPAL-1-cDNA正向插入pET-28c 多克隆位点上的EcoR I位点,预期重组后的表达质粒部分序列应如图1所示。
, 百拇医药
二、重组表达质粒构建及酶切分析:
rPAL-1-cDNA大小为2519 bp,pET-28c大小为5367 bp,通过T4 DNA连接酶连接后的重组表达质粒应为7886 bp。挑取四个重组阳性克隆,经EcoR I酶切图谱鉴定,所得片段符合预计大小(见图2,lane2, 4, 6, 8)。由于应用单酶切插入目的基因所获得的重组质粒,存在着正反两种插入方向。为了获得所需的正向插入重组克隆,经查阅GenBank, 在对rPAL-1-cDNA及pET-28c质粒的酶切图谱分析后,选用各自都只有一个酶切位点并能显著区分正反插入方向的BamH I进行酶切鉴定。根据理论分析,经BamH I酶切后可能出现的二种情况如下:正向插入生成的二个片段大小预计应为337bp和7549 bp,反向插入分别为2194 bp和5692 bp(见图3)。四个重组克隆的BamH I酶切图谱见图2,lane 1, 3, 5, 7。由此可知,获得了3个正向插入重组克隆和1个反向插入重组克隆。
, 百拇医药 三、重组质粒测序:
重组表达质粒测序结果如图4所示,与设计时预期的完全相同。说明该重组质粒已正向插入目的基因,对阅读框架分析,完全肯定了该质粒能正确表达rPAL-1-cDNA。
四、10% SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳及扫描分析:
以大肠杆菌BL21DE3和经pET-28c质粒转化的BL21DE3为对照,与经pET-28c-rPAL-1-cDNA 转化的BL21DE3在同等条件下按照方法六项中描述的方法进行扩增、诱导表达、裂解和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,结果如图5。工程菌在分子量66.2 kD和97.4 kD间,出现明显的表达条带,表达的目的蛋白主要存在于沉淀中(以包涵体形式存在),而对照组BL21DE3及经pET-28c质粒转化的BL21DE3都没有出现。IPTG诱导5和7 h时蛋白表达量最高,表达产物His-rPAL的分子量为78.6 kD,与文献报导一致。IPTG诱导1,3,5,7 h蛋白表达量占菌体总蛋白量的百分数分别为21.40%, 30.60%, 35.40%, 35.43%。
, http://www.100md.com
Fig 2 Restriction map analysis of recombinant plasmids, pET-28c-rPAL-1-cDNA
Lane 1, 3, 5, 7:pET-28c-rPAL-1-cDNA cut with BamH I respectively; Lane 2, 4, 6, 8: pET-28c-rPAL-1-cDNA cut with EcoR I respectively; Lane 9: pET-28c plasmid; Lane 10: λDNA/Hind Ⅲ marker
图2 重组质粒pET-28c-rPAL-1-cDNA 的酶切分析
Fig 3 Restriction enzyme map analysis of expected recombinant plasmid pET-28c-rPAL-1-cDNA
, http://www.100md.com
图3 预期重组质粒pET-28c-rPAL-1-cDNA 的酶切分析
Fig 4 The partial sequencing results of recombinant expression plasmid PET-28c-rPAL-1-cDNA
图4 重组表达质粒PET-28c-rPAL-1-cDNA部分序列测定结果
Fig 5 10% SDS-PAGE analysis of the expressed product in pellet of E. coli BL21DE3 harboring plasmid pET-28c-rPAL-1-cDNA
, http://www.100md.com
Lane 1: E. coli BL21DE3 control; 2: pET-28c vector control; 3: Protein molecular weight marker(97.4, 66.2, 43.0, 31.0, 20.1 kD); 4: pET-28c-rPAL-1-cDNA
before IPTG induction; 5~8: pET-28c-rPAL-1-cDNA after IPTG induction for 1, 3, 5, 7 h, respectively
图5 大肠杆菌BL21DE3中pET-28c-rPAL-cDNA表达产物的SDS-PAGE分析
讨 论
Ei-ichi Minami博士克隆的水稻苯丙氨酸氨解酶基因全长4412 bp,由2个外显子和1个内含子组成。其克隆在pUC19质粒上的rPAL-1-cDNA,总长为2519 bp[7~9],起始部位加入了1个具有EcoR I酶切位点的人工接头,经对其DNA序列及酶切图谱分析,发现ATG上游存在79 bp,并且难于找到合适克隆于表达天然目的蛋白载体上的酶切位点,于是选用能在大肠杆菌中高效表达融合蛋白的pET-28a, b,c系列质粒,作为表达载体。然而表达融合蛋白的一个重要条件是真核基因的阅读框架必须与原核基因的阅读框架相符合或匹配。根据测序结果,经阅读框架核对,最终确定大肠杆菌表达质粒pET-28c作为表达rPAL-1-cDNA的重组载体。在BL21DE3宿主菌中,它既能应用异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)使lac阻遏蛋白失活,从而使T7启动子脱阻遏并诱导T7聚合酶,提高表达目的基因水平,同时,由于宿主菌不表达OmpT和Lon蛋白酶,因此表达产物又比较稳定,不会被宿主菌蛋白水解酶所降解。我们建株的工程菌,经超声破碎后的粗提物,按Zucker[10]建立的苯丙氨酸氨解酶活性测定方法,测得的酶比活性为461.7 nmol.g-1.min-1(结果准备另文发表)。该质粒还具有表达His6-Tag结构,便于应用Ni柱亲和层析,快速纯化,经凝血酶酶切,有可能获得具有活性的天然PAL。为今后PAL的基础研究(如高等植物中的UV反应,创伤防御,氧化应激,凋亡等[11~13])及临床治疗(如苯丙酮尿症)奠定了基础。
, 百拇医药
[基金项目] 浙江省自然科学基金资助(397463)
[参 考 文 献]
[1] Camm EL, Towers GHN. Review article phenylalanine ammonia lyase[J]. Phytochemistry, 1973, 12:961~973.
[2] Safos S, Chang TM. Enzyme replacement therapy in ENU2 phenylketonuric mice using oral microencapsulated phenylalanine ammonia lyase: a preliminary report[J]. Artif Cells Blood Substit Immobil Biotechnol, 1995, 23(6):681~692.
, 百拇医药
[3] Bourget L, Chang TMS. Phanylalanmine ammonia lyase immobilized in semipermeable microcapsules for enzyme replacement in phenylketonuria[J]. FEBS, 1985, 180(1):5~8.
[4] Shintaro I, Yuji M, Hiroadi I, et al. Entrapment of phenylalanine ammonia-lyase in silk fibroin for protection from proteolytic attack[J]. Biochem Biophys Res Commun, 1986,141(1):165~170.
[5] Chang TM, Bourget L, Lister C. A new theory of enterorecirculation of amino acids and its use for depleting unwanted amino acids using oral enzyme artificial cells, as in removing phenylalanine in phenylketonuria[J]. Artif Cells Blood Substit Immobil Biotechnol, 1995, 23(1):1~21.
, 百拇医药
[6] Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual[M]. 2th ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory, 1989. 1.60~1.91.
[7] Minami E, Ozeki Y, Matsueka M, et al. Structure and some characterization of the gene for phenylalanine ammonia lyase from rice plants[J]. FEBS, 1989, 185: 19~25.
[8] Zhu Q, Dabi T, Beeche A, et al. Cloning and properties of a rice gene encoding phenylalanine ammonia lyase[J]. Plant Mol Biol, 1995, 29(3): 535~550.
, 百拇医药
[9] Mimani E, Ozeki Y, Matsueka M, et al. Nucleotide sequence of the gene for phenylalanine ammonia lyase of rice and its deduced amino acid sequence[J]. Biochem Biophys Acta, 1993, 1171(3): 321~322.
[10] Zucker M. Induction of phenylalanine deaminase by light and its relation to chlorogenic acid synthesis in potato tuber tissue[J]. Plant Physiol, 1965, 40(5):779~784.
[11] Zhang S, Du H, Klessig DF. Activation of the tobacco SIP kinase by both a cell wall-derived carbohydrate elicitor and purified proteinaceous elicitins from phytophthosa ssp[J]. Plant Cell, 1998, 10(3): 435~450.
, 百拇医药
[12] Kabasek WL, Ausubel FM, Shirley BW. A light-independent developmental mechanism potentiates flavonoid gene expression in arabidosis seedings[J]. Plant Mol Biol, 1998, 37(2): 217~223.
[13] Kalbin G, Ohlsson AB, Berglund T, et al. Ultraviolet B radiation induced changes in nicotinamide and glutathione metabolism and gene expression in plants[J]. Eur J Biochem, 1997, 249(2): 466~472.
[收稿日期]1999-07-08 [修回日期]1999-10-07, http://www.100md.com