人红细胞摄取1,2-环己二胺.柠檬酸合铂(Ⅱ)配合物的手性选择性和摄入机制*
作者:高愈希△ 李荣昌
单位:北京医科大学生物无机及无机药物化学系,北京 100083
关键词:红细胞;代谢;1,2-环己二胺·柠檬酸合铂(Ⅱ)☆;铂;药代动力学;药物载体
990325 摘 要 目的:研究酵母RAD24L基因功能,克隆人类同源物。方法:分离RAD24基因区域rad24L突变株,以人的cDNA表达文库转化突变株,筛选回复表型;大剂量X线照射观察细胞周期。结果:rad24L对紫外线敏感,从转化文库后的回复表型中克隆出人类hR24L全长cDNA 。结论:克隆的人类DNA修复基因hR24L,它能校正rad24L的突变表型,参与细胞周期检定点调控。
中国图书资料分类法分类号 Q343.12
hR24L, a functional human homologue of S.cerevisiae RAD24L
, http://www.100md.com
gene,is involved in cell cycle checkpoint control
ZHU Ying-Bao, HAN Yun
(The Laboratory of Molecular Biology, the Third Hospital of Beijing Medical University, Beijing 100083)
MeSH Saccharomyces, cerevisiae/genet Gene library DNA mutational analysis Cell cycle
Genetic complementation test
ABSTRACT Objective:To study the function of RAD24L of S.cerevisiae and clone human functional homologue. Methods:The UV-sensitive mutant rad24L was isolated by plasmid shuffling. Then, transformation of rad24L was performed with human cDNA expression library to screen for reversion phenotype. The cell cycle was studied by X-ray irradiation. Results:The mutant rad24L was obtained and a full length cDNA was cloned from reversion phenotype by transformation with human expression library. Conclusion:Human functional homologue of RAD24L was cloned. The hR24L which corrected the phenotype of rad24L mutant is involved in cell cycle checkpoint control.
, 百拇医药
(J Beijing Med Univ, 1999,31:269-273)
人类基因组计划(HGP)的实施极大地推动了模式生物基因组的研究。啤酒酵母(S.cerevisiae)作为人类基因组计划的重要模式生物,其全基因组序列测定已于1996年完成,由于它是单细胞真核生物,基因组简单,突变株相对易于分离,因而被广泛用作研究DNA损伤修复与细胞周期的理想材料。对紫外线和电离辐射敏感的酵母细胞突变株称为rad突变株(RAD表示野生型)。根据单突变和双突变的敏感特征所得出的上位关系(epistatic relations)可将其分为3个上位显性组[1,2],(1)RAD3组:该组成员参与核苷酸的切除修复,其突变株对紫外线敏感。(2)RAD6组:该组成员参与复制后修复,其突变株对化学诱变剂敏感。(3)RAD52组:该组成员参与重组修复(包括链断裂修复),其突变株对电离辐射(包括X线、γ射线等)敏感。RAD24基因是切除修复上位显性组的成员,兼有其他上位显性组的某些特性。我们继克隆出该基因区域DNA片段后,对照酵母基因组测序结果发现该基因区域存在两个开放阅读框架。为此,我们分离左侧的阅读框基因(RAD24L)突变株,观察其表型,继而用功能互补法克隆人类同源物并推及其功能。
, 百拇医药
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
酵母细胞HY684,本室保存,其营养表型为MATa、his3-△200、trp1-△、ura3-52、leu2人胎肝cDNA文库购自CLONTECH公司。
质粒pDel24L为His3基因的BamHⅠ片段插入到含RAD24L开放阅读框架基因内部的BamHⅠ位点,用于RAD24L基因敲除,本室构建。
5-FOA购自Sigma公司。酵母含氮碱(无氨基酸、无硫酸铵)为Difco公司产品。各种工具酶购自Biolab公司和华美生物工程公司。Plasmid premier基因分析软件购自CLONTECH公司。
1.2 方法
, 百拇医药 1.2.1 基因组信息学及计算机分析 在Internet下进入SGD网址,下载啤酒酵母第Ⅴ号染色体RAD24基因区域约10 kb的DNA序列用Plasmid premier程序进行分析。
1.2.2 RAD24L PCR扩增 根据Plasmid premier分析的结果,将RAD24L开放阅读框基因用PCR方法克隆至pRB363(带Ura3标志基因)[3]的SalⅠ位点。用于PCR扩增的上游引物为:5′-AGGAGTCGAC-
ATATGGATAGTACGAATTTGAACAAA-3′;下游引物为:5′-GGAGGTCGACTTAGAGTATTTCCAT-TTCCAGATCT-
GAAT-3′。
1.2.3 RAD24L突变株的分离 先将含RAD24L基因的质粒备份(带Ura3标志基因)转化HY684,在-Ura的合成培养基上筛选阳性克隆,将pDel24L质粒用XbaⅠ线性化后转化上述阳性克隆,用一步基因中断法使基因组中的RAD24L中断,在-Ura、-His的培养基上筛选阳性克隆,再将用HA处理的RAD24L突变库(含Trp1标志基因)转化上一步的阳性克隆,在-Ura、-His、-Trp的培养基上筛选阳性克隆,并把阳性克隆放在含5-FOA的-His、-Trp、+Ura的培养基上筛选阳性克隆[3,4],最后用平皿复制法(影印法)分离紫外线敏感突变株。
, 百拇医药
1.2.4 功能互补试验 将人cDNA表达文库转化突变株,筛选回复生长表型的克隆。酵母转化方法按文献[3]的方法进行。
1.2.5 质粒回收测序 酵母阳性克隆质粒的回收按文献[5]方法进行。序列测定在ABI377测序仪上完成。
1.2.6 细胞周期分析 分别接种10ml的rad24L、RAD24L及经hR24L转化的酵母30 ℃培养过夜,次日转移至100ml培养液中继续培养5h,然后加入α因子使细胞周期同步化。X线照射后于不同时间点收集等份试样进行流式细胞学检查,计数经过分裂期的细胞。
2 结果
2.1 RAD24L基因Plasmid premier分析
Plasmid premier分析结果见图1,由图可见RAD24L框架长为1.98 kb,编码659个氨基酸的蛋白质。在编码区内部有一个BamHⅠ位点,这为我们用His3基因的BamHⅠ片段中断该基因提供了便利。
, 百拇医药
图1 RAD24L基因Plasmid premier分析
Figure 1 Analysis of RAD24L gene by Plasmid premier
2.2 RAD24L突变株分离
为分离RAD24L突变株rad24L,首先必须将基因中的RAD24L基因敲除(中断),一步基因中断法的示意图见图2。
图2 RAD24L一步基因中断法
Figure 2 One step gene disruption of RAD24L
, http://www.100md.com
用Plasmid shuffling分离到一个紫外线敏感表型rad24L。
2.3 文库转化
将人cDNA表达文库转化rad24L后,获得3个紫外抗性克隆,从阳性克隆回收质粒,酶切鉴定证实为同一质粒。完成测序后进行数据库检查证实为新基因,登录到Genbank,登记号为AF126424。
2.4 细胞周期分析
X线照射引起的细胞周期变化结果见图3,由图3可以看出rad24L突变株丧失了G2阻滞表型,其G2阻滞表型的抑制可被hR24L校正,校正后的表型与野生型相似。
图3 X线照射诱导的细胞周期阻滞互补分析
, http://www.100md.com
Figure 3 Complementation test of cell cycle
arrest induced by X-ray irradiation
2.5 Plasmid premier分析
将克隆的人类 RAD24L 同源基因 cDNA 用 Plasmid premier 分析,揭示其编码的蛋白质为670个氨基酸,含有一般认定的解旋酶结构域GKT,见图4。
, 百拇医药
图4 hR24L基因cDNA序列及其预测的氨基酸序列
Figure 4 DNA sequence of hR24L cDNA and predicted amino sequence
3 讨论
DNA损伤修复涉及医学诸多领域,是生命科学的重大课题。在基因水平研究DNA修复不仅对揭示遗传与进化等生物学基本问题具有重大的理论意义,而且对某些遗传病及肿瘤的发病与基因治疗均具有广阔的应用前景。人们对DNA损伤修复认识的不断加深,得益于对酵母细胞辐射敏感突变株的研究。由于啤酒酵母是研究高等生物和人类基因的理想材料,因而被正式列为人类基因组计划重要的模式生物。我们曾用Gap repair方法克隆出啤酒酵母RAD24基因区域的DNA片段后,根据该片段在基因组中的位置将其和第Ⅴ号染色体的DNA序列进行对比分析,发现在我们以前曾报道的编码区左侧尚存在一个开放阅读框,将其命名为RAD24L(L表示左侧),而在我们报道的编码区内部出现了一个移码突变。为此我们对该区域进行了再测序,结果证实我们以前曾报道的序列少了一个碱基。为探讨RAD24L的功能及克隆人类同源基因,我们用一步基因中断法并结合Plasmid shuffling[3]技术分离了该基因紫外线敏感突变株rad24L,该突变株的生长呈现出G2阻滞抑制表型,与我们分离到的温度敏感突变株rad24LR具有某些相似的遗传表型(将另文发表)。进而,我们以人的cDNA表达文库转化突变株,用功能互补法(又称质粒拯救技术)克隆了人类同源基因hR24L,其cDNA全长3 075 bp,开放阅读框在538~2 550之间,编码的氨基酸含有一般认定的解旋酶结构域GKT,提示该基因产物尚参与DNA或/和RNA的解旋过程。hR24L基因能校正rad24L的G2阻滞抑制表型,说明它参与细胞周期检定点调控。该基因的表达及功能的进一步鉴定工作目前正在进行中。
, http://www.100md.com
* 国家自然科学基金(39670235,39770409)及国家高技术发展计划青年基金资助课题。
参考文献
1 Heoijmakers J, Bootsma D. Molecular genetics of eukaryotic DNA excision repair. Cancer Cells,1990,2:311-320
2 Broomfield S, Chow BL, Xiao W. MMS2, encoding an ubiquitin-conjugating-enzyme-like protein, is a member of the yeast error-free postreplication repair pathway. Proc Natl Acad Sci USA, 1998,95:5678-5683
, 百拇医药
3 朱应葆,韩 云,傅 欣,等.啤酒酵母DNA 修复基因RAD24 温度敏感突变株的分离及其特性的初步研究.中国生物化学与分子生物学报,1998,14:222-227
4 Robert S, Boeke J. In vitro mutagenesis and plasmid shuffling: from cloned gene to mutant yeast. Methods Enzymol, 1991,194:281-301
5 Frederick MA. Rapid isolation of plasmid DNA from yeast. In: Short protocols in molecular biology. John Wiley & Sons, Inc, 1995.13.45
(1999-02-25收稿), 百拇医药
单位:北京医科大学生物无机及无机药物化学系,北京 100083
关键词:红细胞;代谢;1,2-环己二胺·柠檬酸合铂(Ⅱ)☆;铂;药代动力学;药物载体
990325 摘 要 目的:研究酵母RAD24L基因功能,克隆人类同源物。方法:分离RAD24基因区域rad24L突变株,以人的cDNA表达文库转化突变株,筛选回复表型;大剂量X线照射观察细胞周期。结果:rad24L对紫外线敏感,从转化文库后的回复表型中克隆出人类hR24L全长cDNA 。结论:克隆的人类DNA修复基因hR24L,它能校正rad24L的突变表型,参与细胞周期检定点调控。
中国图书资料分类法分类号 Q343.12
hR24L, a functional human homologue of S.cerevisiae RAD24L
, http://www.100md.com
gene,is involved in cell cycle checkpoint control
ZHU Ying-Bao, HAN Yun
(The Laboratory of Molecular Biology, the Third Hospital of Beijing Medical University, Beijing 100083)
MeSH Saccharomyces, cerevisiae/genet Gene library DNA mutational analysis Cell cycle
Genetic complementation test
ABSTRACT Objective:To study the function of RAD24L of S.cerevisiae and clone human functional homologue. Methods:The UV-sensitive mutant rad24L was isolated by plasmid shuffling. Then, transformation of rad24L was performed with human cDNA expression library to screen for reversion phenotype. The cell cycle was studied by X-ray irradiation. Results:The mutant rad24L was obtained and a full length cDNA was cloned from reversion phenotype by transformation with human expression library. Conclusion:Human functional homologue of RAD24L was cloned. The hR24L which corrected the phenotype of rad24L mutant is involved in cell cycle checkpoint control.
, 百拇医药
(J Beijing Med Univ, 1999,31:269-273)
人类基因组计划(HGP)的实施极大地推动了模式生物基因组的研究。啤酒酵母(S.cerevisiae)作为人类基因组计划的重要模式生物,其全基因组序列测定已于1996年完成,由于它是单细胞真核生物,基因组简单,突变株相对易于分离,因而被广泛用作研究DNA损伤修复与细胞周期的理想材料。对紫外线和电离辐射敏感的酵母细胞突变株称为rad突变株(RAD表示野生型)。根据单突变和双突变的敏感特征所得出的上位关系(epistatic relations)可将其分为3个上位显性组[1,2],(1)RAD3组:该组成员参与核苷酸的切除修复,其突变株对紫外线敏感。(2)RAD6组:该组成员参与复制后修复,其突变株对化学诱变剂敏感。(3)RAD52组:该组成员参与重组修复(包括链断裂修复),其突变株对电离辐射(包括X线、γ射线等)敏感。RAD24基因是切除修复上位显性组的成员,兼有其他上位显性组的某些特性。我们继克隆出该基因区域DNA片段后,对照酵母基因组测序结果发现该基因区域存在两个开放阅读框架。为此,我们分离左侧的阅读框基因(RAD24L)突变株,观察其表型,继而用功能互补法克隆人类同源物并推及其功能。
, 百拇医药
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
酵母细胞HY684,本室保存,其营养表型为MATa、his3-△200、trp1-△、ura3-52、leu2人胎肝cDNA文库购自CLONTECH公司。
质粒pDel24L为His3基因的BamHⅠ片段插入到含RAD24L开放阅读框架基因内部的BamHⅠ位点,用于RAD24L基因敲除,本室构建。
5-FOA购自Sigma公司。酵母含氮碱(无氨基酸、无硫酸铵)为Difco公司产品。各种工具酶购自Biolab公司和华美生物工程公司。Plasmid premier基因分析软件购自CLONTECH公司。
1.2 方法
, 百拇医药 1.2.1 基因组信息学及计算机分析 在Internet下进入SGD网址,下载啤酒酵母第Ⅴ号染色体RAD24基因区域约10 kb的DNA序列用Plasmid premier程序进行分析。
1.2.2 RAD24L PCR扩增 根据Plasmid premier分析的结果,将RAD24L开放阅读框基因用PCR方法克隆至pRB363(带Ura3标志基因)[3]的SalⅠ位点。用于PCR扩增的上游引物为:5′-AGGAGTCGAC-
ATATGGATAGTACGAATTTGAACAAA-3′;下游引物为:5′-GGAGGTCGACTTAGAGTATTTCCAT-TTCCAGATCT-
GAAT-3′。
1.2.3 RAD24L突变株的分离 先将含RAD24L基因的质粒备份(带Ura3标志基因)转化HY684,在-Ura的合成培养基上筛选阳性克隆,将pDel24L质粒用XbaⅠ线性化后转化上述阳性克隆,用一步基因中断法使基因组中的RAD24L中断,在-Ura、-His的培养基上筛选阳性克隆,再将用HA处理的RAD24L突变库(含Trp1标志基因)转化上一步的阳性克隆,在-Ura、-His、-Trp的培养基上筛选阳性克隆,并把阳性克隆放在含5-FOA的-His、-Trp、+Ura的培养基上筛选阳性克隆[3,4],最后用平皿复制法(影印法)分离紫外线敏感突变株。
, 百拇医药
1.2.4 功能互补试验 将人cDNA表达文库转化突变株,筛选回复生长表型的克隆。酵母转化方法按文献[3]的方法进行。
1.2.5 质粒回收测序 酵母阳性克隆质粒的回收按文献[5]方法进行。序列测定在ABI377测序仪上完成。
1.2.6 细胞周期分析 分别接种10ml的rad24L、RAD24L及经hR24L转化的酵母30 ℃培养过夜,次日转移至100ml培养液中继续培养5h,然后加入α因子使细胞周期同步化。X线照射后于不同时间点收集等份试样进行流式细胞学检查,计数经过分裂期的细胞。
2 结果
2.1 RAD24L基因Plasmid premier分析
Plasmid premier分析结果见图1,由图可见RAD24L框架长为1.98 kb,编码659个氨基酸的蛋白质。在编码区内部有一个BamHⅠ位点,这为我们用His3基因的BamHⅠ片段中断该基因提供了便利。
, 百拇医药
图1 RAD24L基因Plasmid premier分析
Figure 1 Analysis of RAD24L gene by Plasmid premier
2.2 RAD24L突变株分离
为分离RAD24L突变株rad24L,首先必须将基因中的RAD24L基因敲除(中断),一步基因中断法的示意图见图2。
图2 RAD24L一步基因中断法
Figure 2 One step gene disruption of RAD24L
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用Plasmid shuffling分离到一个紫外线敏感表型rad24L。
2.3 文库转化
将人cDNA表达文库转化rad24L后,获得3个紫外抗性克隆,从阳性克隆回收质粒,酶切鉴定证实为同一质粒。完成测序后进行数据库检查证实为新基因,登录到Genbank,登记号为AF126424。
2.4 细胞周期分析
X线照射引起的细胞周期变化结果见图3,由图3可以看出rad24L突变株丧失了G2阻滞表型,其G2阻滞表型的抑制可被hR24L校正,校正后的表型与野生型相似。
图3 X线照射诱导的细胞周期阻滞互补分析
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Figure 3 Complementation test of cell cycle
arrest induced by X-ray irradiation
2.5 Plasmid premier分析
将克隆的人类 RAD24L 同源基因 cDNA 用 Plasmid premier 分析,揭示其编码的蛋白质为670个氨基酸,含有一般认定的解旋酶结构域GKT,见图4。
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图4 hR24L基因cDNA序列及其预测的氨基酸序列
Figure 4 DNA sequence of hR24L cDNA and predicted amino sequence
3 讨论
DNA损伤修复涉及医学诸多领域,是生命科学的重大课题。在基因水平研究DNA修复不仅对揭示遗传与进化等生物学基本问题具有重大的理论意义,而且对某些遗传病及肿瘤的发病与基因治疗均具有广阔的应用前景。人们对DNA损伤修复认识的不断加深,得益于对酵母细胞辐射敏感突变株的研究。由于啤酒酵母是研究高等生物和人类基因的理想材料,因而被正式列为人类基因组计划重要的模式生物。我们曾用Gap repair方法克隆出啤酒酵母RAD24基因区域的DNA片段后,根据该片段在基因组中的位置将其和第Ⅴ号染色体的DNA序列进行对比分析,发现在我们以前曾报道的编码区左侧尚存在一个开放阅读框,将其命名为RAD24L(L表示左侧),而在我们报道的编码区内部出现了一个移码突变。为此我们对该区域进行了再测序,结果证实我们以前曾报道的序列少了一个碱基。为探讨RAD24L的功能及克隆人类同源基因,我们用一步基因中断法并结合Plasmid shuffling[3]技术分离了该基因紫外线敏感突变株rad24L,该突变株的生长呈现出G2阻滞抑制表型,与我们分离到的温度敏感突变株rad24LR具有某些相似的遗传表型(将另文发表)。进而,我们以人的cDNA表达文库转化突变株,用功能互补法(又称质粒拯救技术)克隆了人类同源基因hR24L,其cDNA全长3 075 bp,开放阅读框在538~2 550之间,编码的氨基酸含有一般认定的解旋酶结构域GKT,提示该基因产物尚参与DNA或/和RNA的解旋过程。hR24L基因能校正rad24L的G2阻滞抑制表型,说明它参与细胞周期检定点调控。该基因的表达及功能的进一步鉴定工作目前正在进行中。
, http://www.100md.com
* 国家自然科学基金(39670235,39770409)及国家高技术发展计划青年基金资助课题。
参考文献
1 Heoijmakers J, Bootsma D. Molecular genetics of eukaryotic DNA excision repair. Cancer Cells,1990,2:311-320
2 Broomfield S, Chow BL, Xiao W. MMS2, encoding an ubiquitin-conjugating-enzyme-like protein, is a member of the yeast error-free postreplication repair pathway. Proc Natl Acad Sci USA, 1998,95:5678-5683
, 百拇医药
3 朱应葆,韩 云,傅 欣,等.啤酒酵母DNA 修复基因RAD24 温度敏感突变株的分离及其特性的初步研究.中国生物化学与分子生物学报,1998,14:222-227
4 Robert S, Boeke J. In vitro mutagenesis and plasmid shuffling: from cloned gene to mutant yeast. Methods Enzymol, 1991,194:281-301
5 Frederick MA. Rapid isolation of plasmid DNA from yeast. In: Short protocols in molecular biology. John Wiley & Sons, Inc, 1995.13.45
(1999-02-25收稿), 百拇医药