第五章 GraphPad软件绘图与统计分析高级教程.pdf
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2020年11月12日
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复旦大学附属肿瘤医院 周支瑞
第五章 GraphPad软件绘
图与统计分析 高级教程
跟我学GraphPad Prism：制图与统计分析系列视频课程5.1 复杂方差分析的图形绘制
与统计分析【案例 1】复杂方差分析的图形绘制与统计分析
· 研究者连续5天测量了A、B、C、D四种不同处理方式下的一株细胞
吸光度相对值，该值越高标明存活细胞数量越多。每个时间点的每
种处理方式有三个独立样本。数据如图所示。T im e In t e r v a l (d a y )
C e l l V ia b i l i t y
d a y 1 d a y 2 d a y 3 d a y 4 d a y 5
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【案例 1】复杂方差分析的图形绘制与统计分析T im e in te rv a l (d a y )
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5.2 非线性曲线拟合【案例 2】非线性曲线拟合 -- 半数抑制浓度IC50计算药 物 A ( L o g ? M)
相 对 存 活 率
-2 -1 0 1 2 3
0 .0
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0 .6
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IC 5 0 = 8 .4 6 1 ?M
【案例 2】非线性曲线拟合 -- 半数抑制浓度IC50计算
· 半数抑制浓度(IC50)计算，已知模型拟合方程如下：
· Y=Bottom + (Top-Bottom)(1+10^((LogIC50-X)HillSlope))【案例 3】非线性曲线拟合 -- 放射生物学剂量存活曲线拟合D o s e (G y )
S ru v iv a l F ra c t io n
0 1 2 3 4 5 6 7 8
0 .0 0 1
0 .0 1
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1
【案例 3】非线性曲线拟合 -- 放射生物学剂量存活曲线拟合
· 放射生物学二次线性模型方程如下：
· y=exp(-ax-bx^2)0 1 2 3 4 5 6 7 8
0 .0 0 1
0 .0 1
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D o s e (G y )
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Best-fit values
a
b
0.1206
0.036365.3 Y轴分离的统计图形绘制【案例 4】 Y轴分离的统计图形绘制
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5.4 Meta亚组分析森林图绘制Study name Risk ratio Lower limit Upper limit
Cardenal 1999 0.77 0.55 1.1
Crino 1999 1.02 0.78 1.33
Danson 2001 1.12 0.88 1.42
Meio 2002 0.54 0.32 0.93
Rudd 2002 0.76 0.61 0.93
Sandler 2000 0.76 0.63 0.91
Chang 2001 0.93 0.4 2.16
Comella 2000 0.71 0.45 1.13
Gridelli 2002 1.02 0.76 1.35
Melo 2002 0.71 0.41 1.22
Scagliotti 2002 0.87 0.69 1.09
Scagliotti 2003 1.04 0.83 1.31
Schiller 2002 0.94 0.79 1.14
Schiller 2002 0.92 0.76 1.1
Schiller 2002 0.96 0.8 1.15
Thomas 2002 0.89 0.53 1.49
Van Meerbeeck 2001 0.9 0.65 1.25
【案例 5】亚组分析森林图绘制0 .0 0 .4 0 .8 1 .2 1 .6 2 .0
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【案例 5】亚组分析森林图绘制0 .0 0 .4 0 .8 1 .2 1 .6 2 .0
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1 .0【软件自带案例】亚组分析森林图绘制
Sohn 2007 Raine 2001 Snow 2005
lower limit 2.3 0.9 3.4
relative risk 4.5 2.2 4.1
upper limit 7.8 4.3 5.60 2 4 6 8
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【软件自带案例】亚组分析森林图绘制5.5 双坐标轴图形绘制与图层叠加【案例 6】双坐标轴图形绘制与图层叠加
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【案例 6】双坐标轴图形绘制与图层叠加1 9 9 3
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N um b e rs参考文献
1. 马骏, 周登远, 崔壮, 焦振山,等.《临床医学研究中的统计分析和图形表达实例详
解》, 军事医学科学出版社; 第1版 (2011年5月1日).
2. 方积乾, 孙振球,等.《卫生统计学》, 人民卫生出版社; 第6版. Thanks! 感谢您的观看! ......
第五章 GraphPad软件绘
图与统计分析 高级教程
跟我学GraphPad Prism：制图与统计分析系列视频课程5.1 复杂方差分析的图形绘制
与统计分析【案例 1】复杂方差分析的图形绘制与统计分析
· 研究者连续5天测量了A、B、C、D四种不同处理方式下的一株细胞
吸光度相对值，该值越高标明存活细胞数量越多。每个时间点的每
种处理方式有三个独立样本。数据如图所示。T im e In t e r v a l (d a y )
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【案例 1】复杂方差分析的图形绘制与统计分析T im e in te rv a l (d a y )
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5.2 非线性曲线拟合【案例 2】非线性曲线拟合 -- 半数抑制浓度IC50计算药 物 A ( L o g ? M)
相 对 存 活 率
-2 -1 0 1 2 3
0 .0
0 .2
0 .4
0 .6
0 .8
1 .0
1 .2
1 .4
IC 5 0 = 8 .4 6 1 ?M
【案例 2】非线性曲线拟合 -- 半数抑制浓度IC50计算
· 半数抑制浓度(IC50)计算，已知模型拟合方程如下：
· Y=Bottom + (Top-Bottom)(1+10^((LogIC50-X)HillSlope))【案例 3】非线性曲线拟合 -- 放射生物学剂量存活曲线拟合D o s e (G y )
S ru v iv a l F ra c t io n
0 1 2 3 4 5 6 7 8
0 .0 0 1
0 .0 1
0 .1
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【案例 3】非线性曲线拟合 -- 放射生物学剂量存活曲线拟合
· 放射生物学二次线性模型方程如下：
· y=exp(-ax-bx^2)0 1 2 3 4 5 6 7 8
0 .0 0 1
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Best-fit values
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0.036365.3 Y轴分离的统计图形绘制【案例 4】 Y轴分离的统计图形绘制
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F o ld C h a n g e s
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D ru g A
D ru g B
D ru g C
D ru g D
5.4 Meta亚组分析森林图绘制Study name Risk ratio Lower limit Upper limit
Cardenal 1999 0.77 0.55 1.1
Crino 1999 1.02 0.78 1.33
Danson 2001 1.12 0.88 1.42
Meio 2002 0.54 0.32 0.93
Rudd 2002 0.76 0.61 0.93
Sandler 2000 0.76 0.63 0.91
Chang 2001 0.93 0.4 2.16
Comella 2000 0.71 0.45 1.13
Gridelli 2002 1.02 0.76 1.35
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Scagliotti 2002 0.87 0.69 1.09
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Schiller 2002 0.92 0.76 1.1
Schiller 2002 0.96 0.8 1.15
Thomas 2002 0.89 0.53 1.49
Van Meerbeeck 2001 0.9 0.65 1.25
【案例 5】亚组分析森林图绘制0 .0 0 .4 0 .8 1 .2 1 .6 2 .0
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【案例 5】亚组分析森林图绘制0 .0 0 .4 0 .8 1 .2 1 .6 2 .0
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R is k r a t io
1 .0【软件自带案例】亚组分析森林图绘制
Sohn 2007 Raine 2001 Snow 2005
lower limit 2.3 0.9 3.4
relative risk 4.5 2.2 4.1
upper limit 7.8 4.3 5.60 2 4 6 8
S o h n 2 0 0 7
R a in e 2 0 0 1
S n ow 2 0 0 5
1.0
【软件自带案例】亚组分析森林图绘制5.5 双坐标轴图形绘制与图层叠加【案例 6】双坐标轴图形绘制与图层叠加
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N um b e rs参考文献
1. 马骏, 周登远, 崔壮, 焦振山,等.《临床医学研究中的统计分析和图形表达实例详
解》, 军事医学科学出版社; 第1版 (2011年5月1日).
2. 方积乾, 孙振球,等.《卫生统计学》, 人民卫生出版社; 第6版. Thanks! 感谢您的观看! ......
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