KIF4A在乳腺癌中的功能分析及临床意义(2)
材料与方法一、 数据收集
利用Bioconductor/TCGAbiolinks函数包从肿瘤基因图谱TCGA数据库下载并预处理乳腺癌数据集的mRNA表达数据,在人类蛋白图谱数据库中验证KIF4A蛋白在乳腺癌中的表达水平,利用Kaplan?Meier Plotter在线分析KIF4A与乳腺癌患者预后的相关性。利用Chipbase在线分析基因表达相关性。
二、KIF4A的相关基因分析
通过TCGA数据库分析KIF4A基因在乳腺癌组织中具有相关性的基因群,设置相关系数>0.4或<-0.4,筛选出638个基因,进一步通过DAVID分析软件对KIF4A具有相关性的基因群进行KEGG和GO分析。
三、统计学处理
采用SPSS 17.0分析数据。计量资料以x±s表示,2组间比较采用独立样本t检验,基因表达之间的关系采用Pearson相关分析,生存分析采用Kaplan?Meier Plotter。P<0.05为差异有统计学意义。
结 果
一、KIF4A基因在乳腺癌中的表达
利用TCGA数据库的数据分析了KIF4A基因在113名正常人的乳腺组织、1 090例乳腺癌患者中mRNA的表达情况 ......
您现在查看是摘要页,全文长 4121 字符。