当前位置: 首页 > 期刊 > 《新医学》 > 2022年第8期
编号:649856
IRF4 通过JAK/STAT 信号通路调控糖尿病肾病炎症进展
http://www.100md.com 2022年8月24日 新医学 2022年第8期
淋巴细胞,染色,材料与方法,标本来源,生物信息学分析,定量逆转录PCR(RT-qPCR)验证DEGmRNA表达,过碘酸-希夫(PAS)染色和链霉菌抗生物素蛋白-过氧化物酶(SP)染色验证差异基因蛋
     邱月 董兰 赵升 秦曙光 何凤

    糖尿病肾病(DN)是糖尿病全身性微血管病变常见的并发症之一,其患病率占糖尿病患者的30%~40%,为我国终末期肾病(ESRD)的主要病因,已成为我国慢性疾病的防治重点,其具体的疾病机制也是目前的研究热点。有研究表明,代谢紊乱、血流动力学异常、氧化应激及炎症反应等多种病理过程在DN 的发病过程中发挥着重要作用。然而DN 的具体发病机制尚未完全阐明,新的分子诊断及治疗靶点亟待探索。基因表达综合(GEO)数据库是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)创建并维护的基因表达数据库,收录了大量的高通量基因表达数据。随着生物信息学的发展,对海量数据的挖掘和分析,可深入探索疾病进程中的分子变化和功能联系。本研究拟通过生物信息学方法,筛选DN 中差异表达基因(DEG)并分析相关通路和功能,寻找DN 发展过程中的重要分子并验证其表达,为进一步阐明其发病机制以及寻找靶向分子治疗提供新思路和新靶点。

    材料与方法

    一、标本来源

    从2019 年10 月至2021 年10 月广州市第一人民医院的病理活组织检查 (活检)标本中收集6 例DN 肾组织(DN 组)以及6 例肾肿瘤切除术后癌旁正常组织(NC 组)。DN 组标本来源患者年龄(57.5±2.0)岁、BMI(25.4±1.0)kg/m,诊断符合 《糖尿病肾脏疾病临床诊疗中国指南》 (2021版)。NC 组标本来源患者年龄(55.3±1.9)岁、BMI(24.6±0.9)kg/m。本研究经广州市第一人民医院伦理委员会批准(批件号:K2020-014-01),所有入组患者均已签署知情同意书。活组织离体后,均立即放入液氮,后转入-80 ℃冰箱保存备用。

    二、生物信息学分析

    使用GEO 数据库中的RNA 测序图谱GSE142025进行基因表达分析,其中包含对照组9 例与进展期DN(aDN 组)21 例。应用基于R 语言4.0.3 版的limma 包对基因表达矩阵进行差异表达分析,可视化NC 组与aDN 组之间的DEG ......

您现在查看是摘要页,全文长 8022 字符