ＨＩＶ－ｌｇａｇ基因ｐ24编码区的变异性分析
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[摘要] 目的 了解我国HIV感染者p24蛋白编码区的基因变异情况。方法 收集我国河南及上海地区28份已经证实的HIV-1感染患者的血浆标本并抽提出MA；采用逆转录和Nested-PCR的方法扩增所需的目的基因，使用DNA测序仪直接测序；应用CLUSTAL W、PHYLIP等软件包对序列进行比对及进化树分析。结果28份gag样本中25份为B亚型，3份为A亚型。与共享序列相比，25例B亚型的p24编码区中发生核苷酸改变的位点比例为0.4%～4.8%，平均为1.4%，其中A→G占20.5%，G→A占17.3%；3例A亚型发生核苷酸改变的位点比例平均为0.24%。在所有变异位点中均未发现G→A的高度突变。B亚型和A亚型内的基因离散率平均为2.9%和0.58%，A亚型与B亚型之间的基因离散率平均为11.1%。25例B亚型根据基因序列所推测的p24蛋白发生氨基酸改变的比例为0.4%～5.2%，平均为2.2%。进化树分析表明在我国河南地区HIV感染B亚型多为与泰国株相近的B'亚型。结论 HIV-1p24编码区仍相对保守，选择无变异发生的区域有助于免疫治疗及疫苗研制等方面的研究。
[关键词] 人类免疫缺陷病毒I型； 变异； 序列
[中国图书馆分类法分类号] R 512.91
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