浙麦冬根际及非根际细菌菌群结构与多样性研究
物种,1材料与方法,2结果,3讨论
陈 宸 石森林(指导)浙江中医药大学 浙江 杭州 310053
本研究以慈溪和桐庐两个产地浙麦冬为研究对象,通过高通量测序手段研究浙麦冬根际与非根际土壤微生物的结构与多样性差异,为浙麦冬根际微生态的研究提供基础数据,同时为进一步研究浙麦冬对根际微生态的影响机制奠定基础。
1 材料与方法
1.1 样本采集:于2018年9月在慈溪(CX)和桐庐(TL)浙麦冬产区进行样品采集,在二年生浙麦冬种植区域均匀选取3个采样点,每个采样点通过五点取样法采集样本。将浙麦冬植株连根拔起,抖落根系外围的大块土壤,利用1L磷酸缓冲液清洗得到粘附在根部的土壤作为根际土壤(G),在植株附近无植物生长的地方取20cm深处土壤作为非根际土壤(FG),将从两个产区采集到的各两种土壤样本分别标记为:慈溪根际土壤(CXG)、慈溪非根际土壤(CXFG)、桐庐根际土壤(TLG)和桐庐非根际土壤(TLFG)。将同类样本混合均匀,使用qigen DNAeasy powerSoil kit试剂盒(qigen公司,美国)按说明书提取获得DNA,使用Nanodrop2000紫外分光光度计检测浓度,通过琼脂糖凝胶电泳分析DNA完整性。
1.2 16SrDNA基因扩增及Ion Torrent S5测序:采用引物341F/806R(341F:CCTAYGGGRBGCASCAG;806R:GGACTACNNGGGTATCTAAT)扩增16SrDNA V3-V4可变区片段 ......
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