舌鳞癌Tca8113细胞株干细胞相关差异表达基因的筛选及分析(1)
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[摘要] 目的 应用抑制消减杂交(SSH)技术筛选舌鳞癌干细胞相关差异表达基因。方法 以舌鳞癌Tca8113细胞株中的醛脱氢酶(ALDH)高表达(ALDHbr)细胞与低表达(ALDHlow)细胞互为实验组和对照组,进行正反向消减杂交后建立差异表达基因文库,随机挑选差异基因克隆进行测序及生物信息学分析。结果 经Blast比对分析,得到62条差异表达基因;功能聚类发现多数与细胞周期调节、细胞分化等生物行为相关;信号通路分析显示有11条基因参与的12条信号通路发生显著改变。结论 应用SSH技术成功筛选出了与舌鳞癌干细胞相关的一些基因,进一步研究这些基因对探索舌鳞癌干细胞特异性表面标志物具有重要意义。
[关键词] 舌鳞状细胞癌; 肿瘤干细胞; 醛脱氢酶; 基因
[中图分类号] Q 786 [文献标志码] A [doi] 10.3969/j.issn.1000-1182.2012.05.003
Screen and analysis of differentially expressed genes related to stem-like cells in tongue squamous cell car-cinoma Tca8113 cell line Zou Bo, Ji Ping, Sun Shoujuan, Qi Xiaojuan ......
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