与口腔黏膜病相关的假丝酵母菌代谢组学鉴定的初步研究(1)
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[摘要] 目的 分析3种假丝酵母菌的磁共振代谢物图谱,探讨用代谢组学方法快速鉴定口腔黏膜致病菌的可行性。方法 在沙保培养基中分别接种白色假丝酵母菌ATCC 10231、热带假丝酵母菌ATCC 13803和光滑假丝酵母菌ATCC 15126,绘制生长曲线,选择3种菌生长稳定期的培养液检测其磁共振图谱,用主成分分析法进行数据分析。结果 主成分分析法显示:每两种细菌在主成分得分图中有组间分散、组内聚集的特点,可以区分不同的假丝酵母菌。结论 代谢组学分析技术是一种有良好发展前景的口腔细菌快速鉴定技术。
[关键词] 代谢组学; 磁共振; 假丝酵母菌; 主成分分析
[中图分类号] R 739.86 [文献标志码] A [doi] 10.7518/hxkq.2013.03.018
白色假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌是正常人口腔、胃肠道、呼吸道及阴道黏膜的常见共生菌,仅能在特定条件下造成宿主感染。代谢组学是20世纪90年代中期发展起来的一门对生物体或细胞的所有低相对分子质量代谢产物进行定量和定性分析的新技术。高分辨率磁共振(nuclear ma-
gnetic resonance,NMR)可用于对细胞外微量代谢组分进行检测,得到相应的代谢图谱,使用先进的软件分析方法可以正确地归类处理这些图谱。本研究对与口腔黏膜病相关的3种假丝酵母菌的代谢图谱进行比较,用主成分分析法(principal components ana-lysis,PCA)进行分析,探讨用该方法寻找特征性产物来鉴定假丝酵母菌的可行性。
1 材料和方法
1.1 实验菌株及实验仪器
白色假丝酵母菌ATCC 10231、热带假丝酵母菌
ATCC 13803、光滑假丝酵母菌ATCC 15126(上海川翔生物科技有限公司);CH-2生物显微镜(Olympus公司 ......
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