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编号:12814934
人颊黏膜微生物群落年龄相关性演替研究(3)
http://www.100md.com 2014年2月1日 张洋洋等
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    参见附件。

     1.5.1 Shannon指数 Shannon指数(H)代表微生物群落多样性的丰富程度。公式为:H=-∑PilnPi,H的计算是基于DGGE胶条带的位置和条带的强度,条带的强度(Pi)由经凝胶分析软件Quantity One分析后得到的波峰面积来表示,即Pi=ni/N,其中ni为峰面积,N为所有峰的总面积。

    1.5.2 非加权组平均法(unweighted pair-group me-thod with arithmetic means,UPGMA)聚类分析 使用UPGMA聚类分析构建系统进化树。

    1.6 统计学分析

    应用SPSS 19.0软件分析数据,多组间的条带数和Shannon指数的比较采用独立样本Kruskal Wallis检验,组间多重比较采用Student-Newman-Keuls检验(SNK检验),检验效能α=0.05。

    2 结果

    2.1 PCR扩增结果

    经PCR扩增各颊黏膜菌群的16S rDNA,25例样本均得到预期长度约300 bp的产物(图1),扩增产物无明显拖尾及引物二聚体形成。

    2.2 DGGE图谱总体特征

    图2为5个年龄组的颊黏膜菌群DGGE指纹图谱。图2每一泳道代表一个研究对象颊黏膜细菌样本的DGGE指纹图谱,不同位置的条带代表不同的优势细菌,泳道的条带数代表该样本中的优势菌种的数量。分析图2可以看出:1)个体间唾液微生物中共享的优势菌群数量较多,图谱表现为相同位置的条带在各个体中均有出现;2)唾液微生物的组成同时具有个体差异性,未见有完全相同的泳道出现。

    2.3 条带数比较

    5个年龄组DGGE 图谱经标准化后,得到64个不同条带,条带平均数介于10~31之间。乳牙列组、混合牙列组、青少年组、青年组和老年组检测到的平均条带数分别为21.2±4.0、17.8±3.9、15 ......

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