大鼠4—1ＢＢＬｃＤＮＡ的克隆、分析及染色体定位
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摘要：目的 克隆、分析并染色体定位肿瘤坏死因子配体超家族(TumorNecrosisFactorSuperfamily，TNFSF)成员4-1BBI。分子。方法 在对小鼠、人4—1BBLmRNA进行生物信息学分析的基础上，采用PCR扩增、T载体克隆测序等实验技术，并用软件对基因进行了拼接、序列分析及同源性比较，同时通过荧光原位杂交(FISH)技术对该基因进行了染色体定位。结果 首次获得了具有完整开放阅读框的大鼠cDNA，GenBank登录号为No.AY259541，通过同源性比较分析，证明该基因与小鼠高度同源，编码区的核苷酸序列与小鼠、人的同源性分别为88%、37%。推导出的大鼠4—1BBL蛋白质由308个氨基酸分子组成，分子量为33469d，咆外区有三个潜在的N糖基化位点：AAl38，AAl60和AA292，是典型的Ⅱ型糖蛋白，与小鼠、人在氨基酸水平的同源性分别为83%、31%，其中胞质区为76%、32%，跨膜区为45%、40%，胞外区为87%、28%。该基因定位于大鼠染色体9ql(GenBankUni—Gene登录号为No.Rn.46783)。结论 大鼠4—1BBI，胞内区的“SDAA”可能发挥着TNF家族中具有逆信号的其他成员的胞内区酪氨酸激酶I磷酸化位点“SXXS”的作用。大鼠4—1BBLcDNA的成功克隆与定位为探讨4—1BBI，在免疫共刺激中的作用机制以及TNF分子的进化研究打下了基础。
关键词：TNF超家族；大鼠；4-1BBL；cDNA；克隆；染色体定位
中图分类号：R392.12 文献标识码：A 文章编号：1673—0399(2005)05—0787—05
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