经典的关联分析方法是病例-对照研究(case-control study)，是从人群水平上比较疾病组与对照组之间某个位点的等位基因(或等位型)和基因型(genotype)频率的差异。如果病例组与对照组的差异有统计学意义(P[26]利用传递不平衡检验的方法对121个意大利的家庭进行研究，对位于15q21的遗传标记研究发现，15q15-15q21区域的3个DNA标记(D15S146/D15S214/D15S994)与阅读困难显著关联，认为DNA标记在D15S146 和 D15S994之间约1 cM的区域里存在1个或多个造成阅读困难复杂性状的易感基因。

    此外，2项关联研究也表明6p21.3区域与阅读障碍有关。Kaplan^[27]等以104个家庭为被试，对6p21.3-p22区域进行的关联研究表明，DNA标记JA04附近4Mb的区域里可能存在1个影响阅读障碍的QTL ......