由于研究过程中存在众多参数和假设，耐药负担研究需要有严谨的设计和测算过程。在进行抗菌药物耐药负担研究的过程中，有一些非常重要的方法学注意事项是必须要考虑到并且需要给予恰当地处理的[17]。

    2.1 研究角度的确定

    所有的疾病负担研究都必须明确研究角度，这是耐药负担研究的基础。研究角度决定了结局指标的选择以及耐药菌经济负担的测算过程。通常来讲，研究角度越高、覆盖范围越广，耐药负担的内涵越大。如若从全社会角度进行耐药负担研究，那么抗菌药物本身由于耐药发生导致的效力下降也应作为耐药负担的内涵，然而这种抗菌药物效力的下降却很难进行测量。

    2.2 结局指标的定义

    死亡率相对比较容易进行定义，但需区分全因死亡率与归因死亡率，以及院内死亡率与出院后死亡率的差别。由于死亡率是一个相对不常发生的结局指标且并不一定直接与感染相关，因此相关研究中经常会使用一些对感染暴露更加敏感的结局指标，如发病率、成本等。然而鉴于感染的发病率相对较难定义，因此经常使用替代指标，如医院住院时间、是否需要手术或入住重症加强护理病房(ICU)、成本以及出院功能性状态(是否转入下一级别医疗机构)等。

    2.3 感染前住院时间的控制

    感染前住院时间与感染的发生以及感染后的住院时间、成本及死亡率之间是直接相关的 ......