益气滋阴饮治疗2型糖尿病活性成分的虚拟筛选研究(4)
由图4A和图4B可以看出,在N-反式-咖啡酰酪胺分子与GSK-3β对接结合的立体构象中,在活性口袋内,N-反式-咖啡酰酪胺与GSK-3β的氨基酸残基ILE217、CYS218、GLY259、ASP260形成常规氢键,与ARG220形成π-烷基化相互作用,影响了GSK-3β的结构稳定性及活性,产生拮抗作用,导致GSK-3β表达下降,从而降低其对胰岛素信号传导的抑制,使胰岛素能正常发挥作用,增加糖原合成酶的活性,促进细胞外葡萄糖向糖原的转化,提高外周组织对葡萄糖的利用,从而降低血糖。4 讨论
4.1 化学空间
本文以益气滋阴饮方剂10味中药中已分离得到的732个化合物分子为基础,建立了小分子三维数据集,从DrugBank数据库检索到127个治疗2型糖尿病的药物/类药分子,计算了益气滋阴饮方剂中所含小分子化合物的分子描述符,其中绝大部分小分子符合Lipinski规则。PCA分析结果显示益气滋阴饮方剂所含732个小分子与治疗2型糖尿病的药物/类药分子在化学空间分布上有较大程度的重叠,提示这些小分子化合物与药物/类药分子在化学结构上具有较大的相似性,表明益气滋阴饮方剂中含有治疗2型糖尿病的活性物质。
4.2 生物分子网络
通过益气滋阴饮方剂所含小分子化合物与2型糖尿病相关靶标蛋白的对接 ......
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